219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1111 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1111  YCII-related  100 
 
 		 119 aa  248  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0493804 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0960  DGPFAETKE family protein  71.43 
 
 		 119 aa  189  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1112  YCII-related  50.44 
 
 		 118 aa  118  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0499919 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0961  DGPFAETKE family protein  48.67 
 
 		 116 aa  116  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46830  hypothetical protein  43.75 
 
 		 116 aa  100  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000423585 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3319  hypothetical protein  39.64 
 
 		 122 aa  98.6  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.419553  hitchhiker  0.0000411841 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4555  DGPFAETKE family protein  43.1 
 
 		 114 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1334  DGPFAETKE family protein  43.1 
 
 		 114 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.277602 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1334  DGPFAETKE family protein  41.07 
 
 		 124 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3850  DGPFAETKE family protein  40.52 
 
 		 114 aa  90.5  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2176  DGPFAETKE family protein  38.74 
 
 		 119 aa  90.9  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.66649  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4062  DGPFAETKE family protein  42.24 
 
 		 114 aa  90.5  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4035  DGPF domain-containing protein  42.34 
 
 		 116 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.110978  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4327  DGPFAETKE  41.96 
 
 		 114 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0409  DGPFAETKE family protein  39.09 
 
 		 135 aa  84.7  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00347395  normal  0.0963285 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0959  DGPFAETKE family protein  33.93 
 
 		 119 aa  84  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3428  DGPFAETKE domain-containing protein  35.59 
 
 		 226 aa  84  7e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4175  hypothetical protein  39 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3323  YCII-related protein  36.94 
 
 		 120 aa  80.1  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  0.190231 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1110  YCII-related  33.04 
 
 		 119 aa  79.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0508518 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0824  DGPFAETKE family protein  33.04 
 
 		 115 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0198  YCII-related protein  42.39 
 
 		 116 aa  73.9  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.0536776 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6185  hypothetical protein  37.82 
 
 		 117 aa  72.4  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353039  normal  0.674023 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2715  DGPFAETKE family protein  43.84 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.651883  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4454  DGPFAETKE domain-containing protein  39.51 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8665  YCII-related protein  33.93 
 
 		 123 aa  70.5  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6650  DGPFAETKE family protein  34 
 
 		 123 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.96352  normal  0.40787 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5460  hypothetical protein  31.53 
 
 		 120 aa  68.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.382977  normal  0.0527528 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3855  hypothetical protein  27.93 
 
 		 119 aa  67.4  0.00000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.936414 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2336  YCII-related  33.93 
 
 		 118 aa  67  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000398459  hitchhiker  0.000316604 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0231  hypothetical protein  37.38 
 
 		 117 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2256  YCII-related protein  40.58 
 
 		 115 aa  66.6  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0137  hypothetical protein  37 
 
 		 123 aa  66.6  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.11133  normal  0.389644 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3536  YCII-related protein  30.43 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4492  hypothetical protein  38.1 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.891813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5220  hypothetical protein  38.1 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1406  YCII-related protein  31.53 
 
 		 120 aa  65.1  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48237  normal  0.318259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3461  hypothetical protein  36.45 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  hitchhiker  0.00155442 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3925  hypothetical protein  35.71 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.123958 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3416  YCII-related protein  33.93 
 
 		 119 aa  63.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162675  hitchhiker  0.00509587 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5202  YCII-related protein  39.74 
 
 		 122 aa  62  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136953  normal  0.501323 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7112  DGPFAETKE family protein  41.89 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.87407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4100  DGPFAETKE family protein  30.17 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2170  YCII-related protein  31.97 
 
 		 113 aa  60.8  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.87091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4928  DGPFAETKE family protein  31.82 
 
 		 117 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0813146 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4218  DGPFAETKE family protein  37.5 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.780161 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0533  DGPF domain-containing protein  36.96 
 
 		 117 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2629  YCII-related protein  40.66 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00535413  normal  0.414588 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2464  YCII-related protein  31.91 
 
 		 120 aa  60.5  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0107767  hitchhiker  0.00332743 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1303  DGPFAETKE family protein  32.48 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4552  hypothetical protein  32.73 
 
 		 117 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.40507  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0472  YCII-related protein  39.73 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.354888  normal  0.131281 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3811  DGPFAETKE family protein  32.73 
 
 		 117 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.276008 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3713  DGPFAETKE family protein  32.73 
 
 		 117 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.832455 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3354  DGPFAETKE family protein  38.89 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526097  normal  0.294803 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2314  DGPFAETKE family protein  33.91 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.268997 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4084  YCII-related protein  31.68 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.304074 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0260  hypothetical protein  35.87 
 
 		 117 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0931  DGPF domain-containing protein  35.87 
 
 		 117 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4024  hypothetical protein  34.94 
 
 		 117 aa  58.9  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2236  YCII-related protein  37.18 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.352695  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1754  YCII-related protein  31.31 
 
 		 116 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.261368  normal  0.926785 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1441  DGPF domain-containing protein  35.87 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1638  DGPF domain-containing protein  35.87 
 
 		 117 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2635  DGPF domain-containing protein  35.87 
 
 		 117 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.230357  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2497  DGPF domain-containing protein  35.87 
 
 		 117 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0293  DGPF domain-containing protein  35.87 
 
 		 117 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.493225  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4943  DGPFAETKE family protein  36.11 
 
 		 120 aa  58.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2285  hypothetical protein  30.91 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0910084 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4227  YCII-related protein  36.36 
 
 		 110 aa  58.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0725817 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1474  DGPFAETKE domain-containing protein  35.8 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.847936  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6406  DGPFAETKE family protein  30.58 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  0.634634 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4343  YCII-related protein  34.23 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.467101 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3712  DGPFAETKE family protein  34.44 
 
 		 117 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.555531  normal  0.297001 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0528  YCII-related  39.76 
 
 		 114 aa  57.4  0.00000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5537  DGPFAETKE family protein  40.62 
 
 		 117 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6888  hypothetical protein  40.74 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235266  normal  0.0297541 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1214  YCII-related  51.02 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.742931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3057  YCII-related protein  32.18 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00227791  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1804  DGPF protein  37.04 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1555  YCII-related  35.63 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00194658  normal  0.0318419 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0545  YCII-related protein  41.89 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.150513  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3474  YCII-related  35.06 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2235  YCII-related protein  36.14 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.346545  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2507  YCII-related protein  34 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.521642  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4128  YCII-related protein  31.71 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4155  hypothetical protein  37.04 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0734985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2475  hypothetical protein  39.76 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0163393 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6291  DGPFAETKE family protein  40.28 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2719  DGPFAETKE family protein  32.32 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.945599  normal  0.675282 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2089  YCII-related protein  33.62 
 
 		 120 aa  55.5  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.796254 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4360  DGPFAETKE family protein  37.5 
 
 		 389 aa  55.5  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3252  DGPFAETKE family protein  37.84 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.899565  normal  0.150715 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1521  YCII-related protein  30.91 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000673434 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2197  DGPFAETKE domain-containing protein  39.51 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.936751  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0383  YCII-related protein  31.63 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2781  YCII-related protein  49.06 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.496959  normal  0.164771 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0349  YCII-related protein  41.67 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0677816 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0199  DGPFAETKE domain-containing protein  33.65 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.301875 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3150  DGPFAETKE family protein  34.94 
 
 		 126 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.297543 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>