189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2534 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2534  DGPFAETKE family protein  100 
 
 		 125 aa  259  6e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.490619  normal  0.181696 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3338  DGPFAETKE family protein  43.75 
 
 		 144 aa  84.7  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0729969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3346  DGPFAETKE family protein  40.22 
 
 		 137 aa  73.6  0.0000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119641  normal  0.552539 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1214  YCII-related  35.19 
 
 		 112 aa  73.6  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.742931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0755  YCII-related protein  29.13 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4313  DGPFAETKE domain-containing protein  36.11 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0273  DGPFAETKE family protein  31.82 
 
 		 112 aa  62  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.260759  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0231  hypothetical protein  43.02 
 
 		 117 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5356  YCII-related protein  33.94 
 
 		 113 aa  60.8  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4928  DGPFAETKE family protein  39.36 
 
 		 117 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0813146 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7112  DGPFAETKE family protein  41.86 
 
 		 117 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.87407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2366  DGPFAETKE family protein  32.04 
 
 		 115 aa  58.5  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2781  YCII-related protein  34.55 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.496959  normal  0.164771 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0567  YCII-related protein  35.71 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115419  normal  0.692983 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2314  DGPFAETKE family protein  32.43 
 
 		 118 aa  57  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.268997 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3712  DGPFAETKE family protein  36.17 
 
 		 117 aa  57  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.555531  normal  0.297001 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4100  DGPFAETKE family protein  51.02 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4552  hypothetical protein  37.23 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.40507  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5537  DGPFAETKE family protein  35.11 
 
 		 117 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3811  DGPFAETKE family protein  37.23 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.276008 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3713  DGPFAETKE family protein  37.23 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.832455 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2285  hypothetical protein  36.17 
 
 		 117 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0910084 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3416  YCII-related protein  29.09 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162675  hitchhiker  0.00509587 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3536  YCII-related protein  53.19 
 
 		 112 aa  53.9  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6888  hypothetical protein  46.94 
 
 		 138 aa  52.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235266  normal  0.0297541 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4360  DGPFAETKE family protein  46.81 
 
 		 389 aa  51.6  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0528  YCII-related  28.43 
 
 		 114 aa  51.6  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3657  YCII-related  33 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0349  YCII-related protein  51.06 
 
 		 136 aa  50.8  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0677816 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1126  DGPF domain-containing protein  33.01 
 
 		 145 aa  50.8  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0193856  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8876  YCII-related protein  42.62 
 
 		 117 aa  50.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3588  DGPFAETKE family protein  34 
 
 		 147 aa  50.8  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2197  DGPFAETKE domain-containing protein  55.56 
 
 		 138 aa  50.4  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.936751  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1111  YCII-related  58.7 
 
 		 119 aa  50.4  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0493804 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3531  DGPFAETKE family protein  35.29 
 
 		 143 aa  50.8  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1484  hypothetical protein  34.07 
 
 		 143 aa  50.4  0.000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.786004 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5048  DGPFAETKE family protein  32.11 
 
 		 143 aa  50.1  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.291625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4024  hypothetical protein  46.94 
 
 		 117 aa  50.1  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3925  hypothetical protein  50 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.123958 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2475  hypothetical protein  30.34 
 
 		 114 aa  49.7  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0163393 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2715  DGPFAETKE family protein  36.99 
 
 		 126 aa  49.7  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.651883  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4029  hypothetical protein  29.46 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0988  DGPF domain-containing protein  31.07 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0198  YCII-related protein  34.34 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.0536776 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3500  DGPFAETKE  32 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.161886  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5462  YCII-related protein  57.89 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.330293 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4454  DGPFAETKE domain-containing protein  43.4 
 
 		 122 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4525  DGPFAETKE family protein  31.19 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46770  hypothetical protein  29.46 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0208952  decreased coverage  0.000000131045 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8235  YCII-related protein  34.29 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0384  DGPF domain-containing protein  31.07 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391971  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1835  DGPF domain-containing protein  31.07 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.565065  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1339  DGPF domain-containing protein  31.07 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.071027  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1702  YCII-related protein  35.71 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0260  hypothetical protein  46.94 
 
 		 117 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0931  DGPF domain-containing protein  46.94 
 
 		 117 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0533  DGPF domain-containing protein  46.94 
 
 		 117 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3321  histidine kinase  29.82 
 
 		 284 aa  48.1  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000411841 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1406  YCII-related protein  31.91 
 
 		 120 aa  48.5  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48237  normal  0.318259 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3256  hypothetical protein  33.96 
 
 		 143 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5112  DGPFAETKE family protein  33.96 
 
 		 143 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1350  hypothetical protein  30 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1441  DGPF domain-containing protein  46.94 
 
 		 120 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1638  DGPF domain-containing protein  46.94 
 
 		 117 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2635  DGPF domain-containing protein  46.94 
 
 		 117 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.230357  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2497  DGPF domain-containing protein  46.94 
 
 		 117 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0293  DGPF domain-containing protein  46.94 
 
 		 117 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.493225  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3123  DGPFAETKE family protein  30.39 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.265819  normal  0.0263064 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0310  DGPF domain-containing protein  31.96 
 
 		 246 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.471649  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0528  hypothetical protein  34.41 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252797  normal  0.454149 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4225  DGPF domain-containing protein  32.31 
 
 		 105 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.81583  hitchhiker  0.00855962 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3319  hypothetical protein  30.09 
 
 		 122 aa  48.1  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.419553  hitchhiker  0.0000411841 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0256  DGPF domain-containing protein  31.96 
 
 		 243 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.162797  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2336  YCII-related  31.9 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000398459  hitchhiker  0.000316604 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5169  DGPFAETKE family protein  33.96 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0803026 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4155  hypothetical protein  45.65 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0734985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4212  DGPFAETKE family protein  32.35 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380376 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1065  DGPFAETKE family protein  32.29 
 
 		 123 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4396  hypothetical protein  32.97 
 
 		 116 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0759442  normal  0.0566576 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8665  YCII-related protein  34.94 
 
 		 123 aa  47.4  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1007  DGPFAETKE domain-containing protein  30 
 
 		 123 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3428  DGPFAETKE domain-containing protein  36.67 
 
 		 226 aa  47.4  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1754  YCII-related protein  28.07 
 
 		 116 aa  47.4  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.261368  normal  0.926785 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6291  DGPFAETKE family protein  40.38 
 
 		 123 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1112  YCII-related  46 
 
 		 118 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0499919 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6406  DGPFAETKE family protein  29 
 
 		 123 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  0.634634 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3338  YCII-related  31.3 
 
 		 121 aa  47.4  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000178684  normal  0.0154405 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0824  DGPFAETKE family protein  33.67 
 
 		 115 aa  47.4  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3518  hypothetical protein  32 
 
 		 139 aa  47  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.382158  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3319  YCII-related  40.32 
 
 		 251 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1555  YCII-related  29.06 
 
 		 118 aa  47  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00194658  normal  0.0318419 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46830  hypothetical protein  30.77 
 
 		 116 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000423585 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0961  DGPFAETKE family protein  28.83 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0021  hypothetical protein  32.04 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.512817 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1750  DGPF domain-containing protein  30.39 
 
 		 145 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.605944  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2507  YCII-related protein  38.98 
 
 		 114 aa  47  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.521642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3708  DGPFAETKE family protein  42.55 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.229966  normal  0.769344 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0955  DGPFAETKE family protein  30.25 
 
 		 114 aa  47  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.410711  normal  0.159018 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2519  DGPFAETKE  30.1 
 
 		 141 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.278396  normal  0.095455 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0960  DGPFAETKE family protein  48.98 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>