227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1754 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1754  YCII-related protein  100 
 
 		 116 aa  237  5e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.261368  normal  0.926785 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4084  YCII-related protein  59.29 
 
 		 118 aa  142  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.304074 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3057  YCII-related protein  54.55 
 
 		 116 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00227791  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2464  YCII-related protein  58.56 
 
 		 120 aa  130  7.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0107767  hitchhiker  0.00332743 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3350  DGPFAETKE family protein  59.82 
 
 		 113 aa  126  9.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.154704  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4577  YCII-related protein  49.61 
 
 		 233 aa  117  7.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229228  normal  0.416535 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1555  YCII-related  43.8 
 
 		 118 aa  102  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00194658  normal  0.0318419 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2089  YCII-related protein  38.14 
 
 		 120 aa  86.3  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.796254 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0813  YCII-related protein  38.14 
 
 		 120 aa  85.5  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2593  YCII-related protein  38.14 
 
 		 121 aa  82.8  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0396  DGPFAETKE family protein  39.83 
 
 		 120 aa  82.8  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0388  YCII-related protein  35 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3416  YCII-related protein  33.64 
 
 		 119 aa  70.9  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162675  hitchhiker  0.00509587 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3136  YCII-related protein  48.65 
 
 		 108 aa  69.7  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8665  YCII-related protein  38.24 
 
 		 123 aa  68.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3642  DGPFAETKE family protein  37.63 
 
 		 154 aa  67.4  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0074  YCII-related protein  41.89 
 
 		 107 aa  66.6  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.888616  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2841  YCII-related protein  38.71 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.903735  decreased coverage  0.00264181 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3474  YCII-related  33.64 
 
 		 123 aa  63.5  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5826  hypothetical protein  33.33 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.924088  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2090  YCII-related protein  35.14 
 
 		 115 aa  63.5  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.484825  normal  0.775433 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0010  YCII-related protein  43.21 
 
 		 119 aa  63.5  0.0000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0824  DGPFAETKE family protein  33.93 
 
 		 115 aa  63.2  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1884  YCII-related protein  32.2 
 
 		 123 aa  63.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110578  normal  0.498584 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2972  hypothetical protein  34.19 
 
 		 140 aa  62  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0198  YCII-related protein  32.74 
 
 		 116 aa  62.4  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.0536776 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1484  hypothetical protein  30.3 
 
 		 143 aa  62  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.786004 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3461  hypothetical protein  35.09 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  hitchhiker  0.00155442 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46830  hypothetical protein  33.33 
 
 		 116 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000423585 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2170  YCII-related protein  32.43 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.87091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3072  DGPFAETKE domain-containing protein  36.36 
 
 		 117 aa  60.8  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4128  YCII-related protein  29.41 
 
 		 123 aa  60.5  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5462  YCII-related protein  29.41 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.330293 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0741  DGPFAETKE domain-containing protein  33.71 
 
 		 168 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18250  hypothetical protein  37.78 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0755  DGPFAETKE family protein  33.71 
 
 		 168 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.19239 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0735  DGPFAETKE family protein  33.71 
 
 		 168 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208807  normal  0.29504 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3252  DGPFAETKE family protein  39.24 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.899565  normal  0.150715 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1111  YCII-related  31.31 
 
 		 119 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0493804 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3549  YCII-related  39.24 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3855  hypothetical protein  35.4 
 
 		 119 aa  58.5  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.936414 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2136  YCII-related protein  37.66 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0580  DGPFAETKE family protein  35.05 
 
 		 261 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3536  YCII-related protein  30.91 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14340  hypothetical protein  35.42 
 
 		 119 aa  57.8  0.00000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143905  normal  0.239735 
 
 
-
 
NC_003296  RS03730  hypothetical protein  30.3 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.988914  normal  0.724741 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2197  DGPFAETKE domain-containing protein  32.99 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.936751  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3924  hypothetical protein  27.62 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.762923  normal  0.122571 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6888  hypothetical protein  30.36 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235266  normal  0.0297541 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4035  DGPF domain-containing protein  33.71 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.110978  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4396  hypothetical protein  43.21 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0759442  normal  0.0566576 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4175  hypothetical protein  34.19 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3090  DGPFAETKE domain-containing protein  29.82 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.471864  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0970  DGPFAETKE family protein  34.62 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.188687  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3150  DGPFAETKE family protein  29.82 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.297543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3110  DGPFAETKE family protein  29.82 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.484936  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1110  YCII-related  29.2 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0508518 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8414  YCII-related  30.39 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3518  hypothetical protein  32.5 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.382158  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4227  YCII-related protein  38.36 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0725817 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2176  DGPFAETKE family protein  33.75 
 
 		 119 aa  55.1  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.66649  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2256  YCII-related protein  31.82 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5202  YCII-related protein  34.19 
 
 		 122 aa  55.5  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136953  normal  0.501323 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0959  DGPFAETKE family protein  36.05 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4218  DGPFAETKE family protein  28.45 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.780161 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3319  hypothetical protein  29.46 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.419553  hitchhiker  0.0000411841 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1553  YCII-related protein  36.67 
 
 		 117 aa  54.7  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.386206  normal  0.374591 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1112  YCII-related  36.59 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0499919 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2831  DGPFAETKE family protein  29.21 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.618861  normal  0.707195 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5220  hypothetical protein  31.86 
 
 		 122 aa  53.9  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4492  hypothetical protein  31.86 
 
 		 122 aa  53.9  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.891813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8876  YCII-related protein  37.07 
 
 		 117 aa  53.9  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0199  DGPFAETKE domain-containing protein  27.66 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.301875 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1406  YCII-related protein  31.03 
 
 		 120 aa  53.5  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48237  normal  0.318259 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2421  DGPFAETKE domain-containing protein  31.31 
 
 		 145 aa  53.5  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46770  hypothetical protein  29.09 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0208952  decreased coverage  0.000000131045 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5743  YCII-related protein  30.09 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4943  DGPFAETKE family protein  30.17 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3123  DGPFAETKE family protein  28.57 
 
 		 141 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.265819  normal  0.0263064 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3488  DGPFAETKE  30.43 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4327  DGPFAETKE  35.87 
 
 		 114 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0528  hypothetical protein  27.1 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252797  normal  0.454149 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8235  YCII-related protein  32.99 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3708  DGPFAETKE family protein  32 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.229966  normal  0.769344 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4525  DGPFAETKE family protein  28.97 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0349  YCII-related protein  35 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0677816 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2336  YCII-related  34.51 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000398459  hitchhiker  0.000316604 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3323  YCII-related protein  32.29 
 
 		 120 aa  52.4  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  0.190231 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5048  DGPFAETKE family protein  28.97 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.291625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2314  DGPFAETKE family protein  28.83 
 
 		 118 aa  52.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.268997 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4029  hypothetical protein  29.09 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4025  hypothetical protein  30.1 
 
 		 149 aa  51.6  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4155  hypothetical protein  28.7 
 
 		 139 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0734985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0283  YCII-related protein  31.07 
 
 		 116 aa  51.6  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2715  DGPFAETKE family protein  34.25 
 
 		 126 aa  51.6  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.651883  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6196  YCII-related protein  29.25 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1804  DGPF protein  29 
 
 		 136 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4212  DGPFAETKE family protein  28.71 
 
 		 144 aa  51.2  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380376 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2144  YCII-related protein  32.43 
 
 		 139 aa  51.2  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6623  DGPFAETKE family protein  32.47 
 
 		 116 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>