203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0388 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0388  YCII-related protein  100 
 
 		 124 aa  256  8e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2593  YCII-related protein  48.78 
 
 		 121 aa  128  3e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1555  YCII-related  40 
 
 		 118 aa  90.5  7e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00194658  normal  0.0318419 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14340  hypothetical protein  43.33 
 
 		 119 aa  85.1  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143905  normal  0.239735 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3518  hypothetical protein  41.76 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.382158  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4084  YCII-related protein  36.59 
 
 		 118 aa  79  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.304074 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0349  YCII-related protein  40.4 
 
 		 136 aa  78.6  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0677816 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0813  YCII-related protein  37.1 
 
 		 120 aa  77.4  0.00000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6888  hypothetical protein  39.39 
 
 		 138 aa  76.3  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235266  normal  0.0297541 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3642  DGPFAETKE family protein  35.43 
 
 		 154 aa  76.6  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1804  DGPF protein  41.57 
 
 		 136 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2197  DGPFAETKE domain-containing protein  43.9 
 
 		 138 aa  75.9  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.936751  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1303  DGPFAETKE family protein  41.57 
 
 		 138 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1459  YCII-related  39.58 
 
 		 139 aa  75.1  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0199  DGPFAETKE domain-containing protein  35.96 
 
 		 138 aa  73.9  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.301875 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4155  hypothetical protein  39.33 
 
 		 139 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0734985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1754  YCII-related protein  35 
 
 		 116 aa  73.2  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.261368  normal  0.926785 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0396  DGPFAETKE family protein  36.89 
 
 		 120 aa  73.2  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5826  hypothetical protein  32.48 
 
 		 139 aa  72.4  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.924088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0741  DGPFAETKE domain-containing protein  35.11 
 
 		 168 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0755  DGPFAETKE family protein  35.11 
 
 		 168 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.19239 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2089  YCII-related protein  37.82 
 
 		 120 aa  70.9  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.796254 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0735  DGPFAETKE family protein  35.11 
 
 		 168 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208807  normal  0.29504 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18250  hypothetical protein  35.56 
 
 		 139 aa  70.1  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2144  YCII-related protein  35.11 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2972  hypothetical protein  32.38 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3416  YCII-related protein  37.89 
 
 		 119 aa  66.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162675  hitchhiker  0.00509587 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2136  YCII-related protein  33.33 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2314  DGPFAETKE family protein  32.26 
 
 		 118 aa  62.8  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.268997 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2519  DGPFAETKE  33.77 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.278396  normal  0.095455 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2841  YCII-related protein  34.04 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.903735  decreased coverage  0.00264181 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2464  YCII-related protein  33.05 
 
 		 120 aa  62.4  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0107767  hitchhiker  0.00332743 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3123  DGPFAETKE family protein  35.06 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.265819  normal  0.0263064 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4076  YCII-related protein  33.33 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1584  DGPFAETKE  33.7 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8235  YCII-related protein  33.33 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0010  YCII-related protein  41.25 
 
 		 119 aa  59.7  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1521  YCII-related protein  32.56 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000673434 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3500  DGPFAETKE  32.98 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.161886  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3657  YCII-related  34.04 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1484  hypothetical protein  35.19 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.786004 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0970  DGPFAETKE family protein  38.55 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.188687  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5462  YCII-related protein  37.31 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.330293 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19760  hypothetical protein  34.04 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.113314  hitchhiker  0.00158371 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1832  YCII-related protein  33.07 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1126  DGPF domain-containing protein  33.72 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0193856  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0074  YCII-related protein  36.9 
 
 		 107 aa  58.5  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.888616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3588  DGPFAETKE family protein  32.98 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4029  hypothetical protein  31.17 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1458  YCII-related  35 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3256  hypothetical protein  33.33 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46770  hypothetical protein  31.17 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0208952  decreased coverage  0.000000131045 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5112  DGPFAETKE family protein  33.33 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3488  DGPFAETKE  31.82 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4577  YCII-related protein  32.33 
 
 		 233 aa  57.4  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229228  normal  0.416535 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3057  YCII-related protein  30.33 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00227791  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1110  YCII-related  25.66 
 
 		 119 aa  57  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0508518 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1406  YCII-related protein  35.35 
 
 		 120 aa  57  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48237  normal  0.318259 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5169  DGPFAETKE family protein  32 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0803026 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1112  YCII-related  37.11 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0499919 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6406  DGPFAETKE family protein  31.25 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  0.634634 
 
 
-
 
NC_003296  RS03730  hypothetical protein  33.68 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.988914  normal  0.724741 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0528  hypothetical protein  32 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252797  normal  0.454149 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0961  DGPFAETKE family protein  31.93 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3708  DGPFAETKE family protein  30.68 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.229966  normal  0.769344 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3136  YCII-related protein  37.8 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3350  DGPFAETKE family protein  35 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.154704  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4212  DGPFAETKE family protein  29.35 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380376 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2831  DGPFAETKE family protein  32.47 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.618861  normal  0.707195 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3323  YCII-related protein  35.56 
 
 		 120 aa  55.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  0.190231 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6291  DGPFAETKE family protein  27.83 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8315  YCII-related  32.95 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11198  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5048  DGPFAETKE family protein  30.67 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.291625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4525  DGPFAETKE family protein  32 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3531  DGPFAETKE family protein  31.82 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3536  YCII-related protein  37.5 
 
 		 112 aa  54.3  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3924  hypothetical protein  32.29 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.762923  normal  0.122571 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1750  DGPF domain-containing protein  31.88 
 
 		 145 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.605944  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0988  DGPF domain-containing protein  31.88 
 
 		 145 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3072  DGPFAETKE domain-containing protein  32.29 
 
 		 117 aa  53.5  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0384  DGPF domain-containing protein  31.88 
 
 		 145 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391971  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1835  DGPF domain-containing protein  31.88 
 
 		 145 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.565065  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1339  DGPF domain-containing protein  31.88 
 
 		 145 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.071027  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2458  YCII-related  32 
 
 		 140 aa  53.5  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0310  DGPF domain-containing protein  31.88 
 
 		 246 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.471649  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0795  hypothetical protein  32.56 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.999252  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3654  YCII-related protein  36.17 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.046895  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0256  DGPF domain-containing protein  31.88 
 
 		 243 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.162797  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2452  DGPFAETKE family protein  32.56 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0408545 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5743  YCII-related protein  30.4 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2011  YCII-related protein  29.76 
 
 		 114 aa  52.8  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0232  hypothetical protein  32.98 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2421  DGPFAETKE domain-containing protein  33 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0545  YCII-related protein  35.9 
 
 		 118 aa  52.8  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.150513  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1702  YCII-related protein  28.57 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1320  DGPFAETKE family protein  32.41 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.746126  normal  0.587484 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6196  YCII-related protein  29.27 
 
 		 140 aa  51.6  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0694  hypothetical protein  30.43 
 
 		 279 aa  51.6  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0969715  unclonable  0.00000000507336 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0021  hypothetical protein  30.85 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.512817 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7113  DGPFAETKE family protein  32.98 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730513  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>