124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0970 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0970  DGPFAETKE family protein  100 
 
 		 118 aa  243  4.9999999999999997e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.188687  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0010  YCII-related protein  75 
 
 		 119 aa  174  3e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2090  YCII-related protein  44.14 
 
 		 115 aa  73.6  0.0000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.484825  normal  0.775433 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0448  hypothetical protein  43.7 
 
 		 112 aa  72.4  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1555  YCII-related  46.84 
 
 		 118 aa  70.9  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00194658  normal  0.0318419 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2965  hypothetical protein  41.67 
 
 		 114 aa  69.3  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4084  YCII-related protein  37.72 
 
 		 118 aa  66.6  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.304074 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2464  YCII-related protein  44.87 
 
 		 120 aa  66.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0107767  hitchhiker  0.00332743 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0813  YCII-related protein  44.3 
 
 		 120 aa  65.5  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14340  hypothetical protein  45.12 
 
 		 119 aa  65.9  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143905  normal  0.239735 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4577  YCII-related protein  35.2 
 
 		 233 aa  65.5  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229228  normal  0.416535 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0074  YCII-related protein  35.78 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.888616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0396  DGPFAETKE family protein  42.68 
 
 		 120 aa  63.5  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0927  hypothetical protein  39.5 
 
 		 117 aa  63.5  0.0000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.160123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3350  DGPFAETKE family protein  48.72 
 
 		 113 aa  61.6  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.154704  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2593  YCII-related protein  39.53 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0388  YCII-related protein  38.55 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3855  hypothetical protein  45 
 
 		 119 aa  57.8  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.936414 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5826  hypothetical protein  41.03 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.924088  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2089  YCII-related protein  40.23 
 
 		 120 aa  57.4  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.796254 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3057  YCII-related protein  33.03 
 
 		 116 aa  57  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00227791  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3319  YCII-related  33.01 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3319  hypothetical protein  30.48 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.419553  hitchhiker  0.0000411841 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1754  YCII-related protein  34.62 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.261368  normal  0.926785 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3642  DGPFAETKE family protein  37.18 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2958  hypothetical protein  44.17 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.348765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3136  YCII-related protein  43.75 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2715  DGPFAETKE family protein  40 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.651883  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4035  DGPF domain-containing protein  30.85 
 
 		 116 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.110978  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46830  hypothetical protein  30.85 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000423585 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3416  YCII-related protein  38.67 
 
 		 119 aa  53.5  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162675  hitchhiker  0.00509587 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4076  YCII-related protein  40.51 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2176  DGPFAETKE family protein  27.93 
 
 		 119 aa  53.5  0.0000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.66649  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1884  YCII-related protein  38.16 
 
 		 123 aa  53.5  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110578  normal  0.498584 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0741  DGPFAETKE domain-containing protein  34.62 
 
 		 168 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0755  DGPFAETKE family protein  34.62 
 
 		 168 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.19239 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0735  DGPFAETKE family protein  34.62 
 
 		 168 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208807  normal  0.29504 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0824  DGPFAETKE family protein  35.8 
 
 		 115 aa  51.2  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5743  YCII-related protein  38.36 
 
 		 118 aa  50.8  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4327  DGPFAETKE  37.66 
 
 		 114 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3090  DGPFAETKE domain-containing protein  37.11 
 
 		 126 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.471864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3150  DGPFAETKE family protein  37.11 
 
 		 126 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.297543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3110  DGPFAETKE family protein  37.11 
 
 		 126 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.484936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6291  DGPFAETKE family protein  36.05 
 
 		 123 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0991  hypothetical protein  34.23 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0626666 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1406  YCII-related protein  31.43 
 
 		 120 aa  49.7  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48237  normal  0.318259 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2503  YCII-related protein  34.15 
 
 		 122 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1334  DGPFAETKE family protein  30.91 
 
 		 124 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177164  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1110  YCII-related  34.88 
 
 		 119 aa  49.7  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0508518 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8665  YCII-related protein  34.18 
 
 		 123 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18250  hypothetical protein  35.44 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4352  YCII-related protein  32.32 
 
 		 123 aa  48.9  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00663803  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0545  YCII-related protein  41.43 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.150513  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2314  DGPFAETKE family protein  42.47 
 
 		 118 aa  47.8  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.268997 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6406  DGPFAETKE family protein  33.72 
 
 		 123 aa  47  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  0.634634 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4396  hypothetical protein  40.26 
 
 		 116 aa  47  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0759442  normal  0.0566576 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2136  YCII-related protein  34.18 
 
 		 139 aa  47  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210821  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4128  YCII-related protein  31.58 
 
 		 123 aa  46.2  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3461  hypothetical protein  35.37 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  hitchhiker  0.00155442 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0349  YCII-related protein  33.73 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0677816 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3072  DGPFAETKE domain-containing protein  37.18 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4454  DGPFAETKE domain-containing protein  31.33 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3474  YCII-related  55.81 
 
 		 123 aa  45.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0814  YCII-related protein  42.86 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.487046  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3086  YCII-related protein  36.51 
 
 		 104 aa  45.4  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.11532  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0580  DGPFAETKE family protein  31.18 
 
 		 261 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4175  hypothetical protein  30.95 
 
 		 126 aa  45.1  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1521  YCII-related protein  32.89 
 
 		 118 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000673434 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0960  DGPFAETKE family protein  40 
 
 		 119 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2144  YCII-related protein  34.18 
 
 		 139 aa  44.7  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5202  YCII-related protein  32.5 
 
 		 122 aa  44.3  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136953  normal  0.501323 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2421  DGPFAETKE domain-containing protein  36.11 
 
 		 145 aa  43.9  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5546  DGPFAETKE family protein  36.26 
 
 		 132 aa  43.9  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112549  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2011  YCII-related protein  33.33 
 
 		 114 aa  44.3  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3850  DGPFAETKE family protein  34.15 
 
 		 114 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8414  YCII-related  35.9 
 
 		 144 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4555  DGPFAETKE family protein  34.15 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2197  DGPFAETKE domain-containing protein  34.18 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.936751  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1334  DGPFAETKE family protein  34.15 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.277602 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4062  DGPFAETKE family protein  34.15 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1112  YCII-related  34.72 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0499919 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0199  DGPFAETKE domain-containing protein  31.17 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.301875 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5537  DGPFAETKE family protein  32.08 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6623  DGPFAETKE family protein  32.93 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3323  YCII-related protein  31.63 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  0.190231 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0409  DGPFAETKE family protein  29.82 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00347395  normal  0.0963285 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0961  DGPFAETKE family protein  32.89 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1459  YCII-related  31.82 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3925  hypothetical protein  35.71 
 
 		 142 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.123958 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0232  hypothetical protein  33.85 
 
 		 137 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4552  hypothetical protein  35.71 
 
 		 117 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.40507  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3811  DGPFAETKE family protein  35.71 
 
 		 117 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.276008 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2841  YCII-related protein  32.91 
 
 		 135 aa  42  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.903735  decreased coverage  0.00264181 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3713  DGPFAETKE family protein  35.71 
 
 		 117 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.832455 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7113  DGPFAETKE family protein  32.39 
 
 		 137 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730513  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0226  YCII-related protein  41.94 
 
 		 113 aa  42  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0261  hypothetical protein  31.33 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0929  DGPF domain-containing protein  31.33 
 
 		 137 aa  41.2  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3812  DGPFAETKE family protein  30.53 
 
 		 139 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0294  DGPF domain-containing protein  31.33 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.360873  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>