195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_14340 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_14340  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  239  1e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143905  normal  0.239735 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0813  YCII-related protein  58.12 
 
 		 120 aa  136  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0396  DGPFAETKE family protein  58.97 
 
 		 120 aa  135  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1555  YCII-related  45.76 
 
 		 118 aa  99  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00194658  normal  0.0318419 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2593  YCII-related protein  50 
 
 		 121 aa  92.8  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0388  YCII-related protein  43.33 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2089  YCII-related protein  38.66 
 
 		 120 aa  84  7e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.796254 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0074  YCII-related protein  39.66 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.888616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3136  YCII-related protein  43.59 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4084  YCII-related protein  40.35 
 
 		 118 aa  78.2  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.304074 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3416  YCII-related protein  37.72 
 
 		 119 aa  72.8  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162675  hitchhiker  0.00509587 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2464  YCII-related protein  36.75 
 
 		 120 aa  71.2  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0107767  hitchhiker  0.00332743 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1406  YCII-related protein  33.61 
 
 		 120 aa  68.2  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48237  normal  0.318259 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1804  DGPF protein  35.65 
 
 		 136 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3855  hypothetical protein  38.79 
 
 		 119 aa  66.6  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.936414 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0970  DGPFAETKE family protein  45.12 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.188687  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1459  YCII-related  33.62 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4492  hypothetical protein  34 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.891813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3461  hypothetical protein  38 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  hitchhiker  0.00155442 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5220  hypothetical protein  34 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8665  YCII-related protein  33.9 
 
 		 123 aa  64.7  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0199  DGPFAETKE domain-containing protein  36.25 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.301875 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5826  hypothetical protein  36.75 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.924088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3518  hypothetical protein  33.04 
 
 		 139 aa  63.5  0.0000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.382158  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3057  YCII-related protein  36.75 
 
 		 116 aa  63.5  0.0000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00227791  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1303  DGPFAETKE family protein  34.78 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4155  hypothetical protein  32.17 
 
 		 139 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0734985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6888  hypothetical protein  38.75 
 
 		 138 aa  62  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235266  normal  0.0297541 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3642  DGPFAETKE family protein  35.04 
 
 		 154 aa  62  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2841  YCII-related protein  35.58 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.903735  decreased coverage  0.00264181 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2519  DGPFAETKE  33.33 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.278396  normal  0.095455 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2090  YCII-related protein  33.91 
 
 		 115 aa  60.8  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.484825  normal  0.775433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5460  hypothetical protein  33.33 
 
 		 120 aa  60.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.382977  normal  0.0527528 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2197  DGPFAETKE domain-containing protein  39.51 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.936751  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18250  hypothetical protein  35 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0010  YCII-related protein  42.17 
 
 		 119 aa  59.3  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19760  hypothetical protein  31.9 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.113314  hitchhiker  0.00158371 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4577  YCII-related protein  34.78 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229228  normal  0.416535 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6291  DGPFAETKE family protein  29.82 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6406  DGPFAETKE family protein  28.95 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  0.634634 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1754  YCII-related protein  35.42 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.261368  normal  0.926785 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3500  DGPFAETKE  36.29 
 
 		 147 aa  57  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.161886  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3252  DGPFAETKE family protein  40 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.899565  normal  0.150715 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3549  YCII-related  40 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3072  DGPFAETKE domain-containing protein  37.04 
 
 		 117 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4454  DGPFAETKE domain-containing protein  29.82 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3588  DGPFAETKE family protein  36.29 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3657  YCII-related  36.29 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2972  hypothetical protein  30.43 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3536  YCII-related protein  29.06 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1747  YCII-related  36.08 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0741  DGPFAETKE domain-containing protein  33.33 
 
 		 168 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2136  YCII-related protein  33 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0755  DGPFAETKE family protein  33.33 
 
 		 168 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.19239 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0735  DGPFAETKE family protein  33.33 
 
 		 168 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208807  normal  0.29504 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4343  YCII-related protein  32.74 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.467101 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3192  YCII-related protein  29.91 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.43848  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0545  YCII-related protein  41.25 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.150513  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0198  YCII-related protein  29.31 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.0536776 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3090  DGPFAETKE domain-containing protein  35.9 
 
 		 126 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.471864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3150  DGPFAETKE family protein  35.9 
 
 		 126 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.297543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3110  DGPFAETKE family protein  35.9 
 
 		 126 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.484936  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5462  YCII-related protein  34 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.330293 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1521  YCII-related protein  30.83 
 
 		 118 aa  53.5  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000673434 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2314  DGPFAETKE family protein  30.43 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.268997 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0410  DGPFAETKE family protein  32.95 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00435378  normal  0.146566 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2210  YCII-related protein  32.71 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.822068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8876  YCII-related protein  36 
 
 		 117 aa  51.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0824  DGPFAETKE family protein  27.35 
 
 		 115 aa  51.2  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4327  DGPFAETKE  30.7 
 
 		 114 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3654  YCII-related protein  31.9 
 
 		 141 aa  50.8  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.046895  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3350  DGPFAETKE family protein  36.52 
 
 		 113 aa  50.8  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.154704  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3850  DGPFAETKE family protein  34.52 
 
 		 114 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4076  YCII-related protein  33 
 
 		 138 aa  50.4  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4360  DGPFAETKE family protein  31.03 
 
 		 389 aa  50.8  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3323  YCII-related protein  28.69 
 
 		 120 aa  50.8  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  0.190231 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5546  DGPFAETKE family protein  39.08 
 
 		 132 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112549  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1458  YCII-related  30.43 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0961  DGPFAETKE family protein  32.32 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7112  DGPFAETKE family protein  31.03 
 
 		 117 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.87407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4175  hypothetical protein  34.12 
 
 		 126 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0349  YCII-related protein  32.1 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0677816 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1112  YCII-related  31.31 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0499919 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0814  YCII-related protein  31.58 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.487046  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3455  YCII-related protein  35.58 
 
 		 118 aa  48.9  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0231  hypothetical protein  30.17 
 
 		 117 aa  48.9  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1484  hypothetical protein  31.58 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.786004 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1110  YCII-related  28.07 
 
 		 119 aa  48.9  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0508518 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1334  DGPFAETKE family protein  32.5 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4763  YCII-related protein  32.08 
 
 		 131 aa  48.9  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2336  YCII-related  31.3 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000398459  hitchhiker  0.000316604 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1702  YCII-related protein  25 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3474  YCII-related  29.82 
 
 		 123 aa  47.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3925  hypothetical protein  36.71 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.123958 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2715  DGPFAETKE family protein  28.07 
 
 		 126 aa  47.8  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.651883  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3123  DGPFAETKE family protein  27.97 
 
 		 141 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.265819  normal  0.0263064 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6196  YCII-related protein  31.87 
 
 		 140 aa  47.8  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46830  hypothetical protein  29.67 
 
 		 116 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000423585 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4760  YCII-related protein  37.84 
 
 		 130 aa  47.4  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000445708  hitchhiker  0.000508919 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0003  DGPFAETKE family protein  29.59 
 
 		 124 aa  47.4  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.398282  hitchhiker  0.0000769661 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>