194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2090 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2090  YCII-related protein  100 
 
 
115 aa  233  9e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.484825  normal  0.775433 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0448  hypothetical protein  46.73 
 
 
112 aa  101  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2965  hypothetical protein  48.18 
 
 
114 aa  99.8  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0927  hypothetical protein  42.59 
 
 
117 aa  94  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.160123  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2464  YCII-related protein  43.24 
 
 
120 aa  83.6  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0107767  hitchhiker  0.00332743 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1555  YCII-related  40.35 
 
 
118 aa  83.2  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00194658  normal  0.0318419 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2958  hypothetical protein  44.86 
 
 
113 aa  82  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.348765  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0991  hypothetical protein  42.16 
 
 
141 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0626666 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0010  YCII-related protein  44.74 
 
 
119 aa  74.3  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0970  DGPFAETKE family protein  44.14 
 
 
118 aa  73.6  0.0000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.188687  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3057  YCII-related protein  43.12 
 
 
116 aa  72  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00227791  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4084  YCII-related protein  35.71 
 
 
118 aa  70.1  0.000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.304074 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4577  YCII-related protein  34.13 
 
 
233 aa  69.3  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229228  normal  0.416535 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3350  DGPFAETKE family protein  39.64 
 
 
113 aa  68.6  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.154704  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0396  DGPFAETKE family protein  37.07 
 
 
120 aa  67  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0813  YCII-related protein  35.34 
 
 
120 aa  64.3  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1754  YCII-related protein  35.14 
 
 
116 aa  63.5  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.261368  normal  0.926785 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3252  DGPFAETKE family protein  43.18 
 
 
112 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.899565  normal  0.150715 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3549  YCII-related  40.96 
 
 
112 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3072  DGPFAETKE domain-containing protein  42.35 
 
 
117 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14340  hypothetical protein  33.91 
 
 
119 aa  60.8  0.000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143905  normal  0.239735 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0741  DGPFAETKE domain-containing protein  38.89 
 
 
168 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0755  DGPFAETKE family protein  38.89 
 
 
168 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.19239 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0735  DGPFAETKE family protein  38.89 
 
 
168 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208807  normal  0.29504 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0074  YCII-related protein  36.14 
 
 
107 aa  59.7  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.888616  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2089  YCII-related protein  35.04 
 
 
120 aa  59.7  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.796254 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4763  YCII-related protein  38.71 
 
 
131 aa  58.2  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3136  YCII-related protein  38.74 
 
 
108 aa  57.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3642  DGPFAETKE family protein  32.46 
 
 
154 aa  57.4  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5826  hypothetical protein  32.46 
 
 
139 aa  57.4  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.924088  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2314  DGPFAETKE family protein  40.79 
 
 
118 aa  57  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.268997 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3461  hypothetical protein  37.5 
 
 
122 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  hitchhiker  0.00155442 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5546  DGPFAETKE family protein  40.7 
 
 
132 aa  55.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112549  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4552  hypothetical protein  47.46 
 
 
117 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.40507  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3811  DGPFAETKE family protein  47.46 
 
 
117 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.276008 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0824  DGPFAETKE family protein  35.71 
 
 
115 aa  55.1  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3713  DGPFAETKE family protein  47.46 
 
 
117 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.832455 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2593  YCII-related protein  34.21 
 
 
121 aa  54.7  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4112  YCII-related protein  36.45 
 
 
146 aa  54.7  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.423036 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0545  YCII-related protein  41.67 
 
 
118 aa  54.3  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.150513  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1406  YCII-related protein  36.26 
 
 
120 aa  54.3  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48237  normal  0.318259 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18250  hypothetical protein  34.31 
 
 
139 aa  54.3  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3416  YCII-related protein  43.86 
 
 
119 aa  53.9  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162675  hitchhiker  0.00509587 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0199  DGPFAETKE domain-containing protein  41.67 
 
 
138 aa  53.5  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.301875 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4551  hypothetical protein  36.59 
 
 
139 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.626002  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3812  DGPFAETKE family protein  36.59 
 
 
139 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3712  DGPFAETKE family protein  36.59 
 
 
139 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5462  YCII-related protein  36.84 
 
 
146 aa  52.8  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.330293 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2972  hypothetical protein  31.37 
 
 
140 aa  52.4  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2285  hypothetical protein  47.46 
 
 
117 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0910084 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3855  hypothetical protein  33.73 
 
 
119 aa  52.4  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.936414 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5537  DGPFAETKE family protein  45.76 
 
 
117 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4360  DGPFAETKE family protein  42.37 
 
 
389 aa  52  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4927  DGPFAETKE family protein  36.36 
 
 
140 aa  52  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0785882 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3712  DGPFAETKE family protein  45.76 
 
 
117 aa  51.6  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.555531  normal  0.297001 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3924  hypothetical protein  33.73 
 
 
141 aa  51.2  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.762923  normal  0.122571 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2136  YCII-related protein  33.65 
 
 
139 aa  51.2  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210821  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3319  YCII-related  46.51 
 
 
251 aa  51.2  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4928  DGPFAETKE family protein  47.46 
 
 
117 aa  51.6  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0813146 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2284  hypothetical protein  45.1 
 
 
139 aa  51.2  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3536  YCII-related protein  30 
 
 
112 aa  50.8  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4396  hypothetical protein  44.26 
 
 
116 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0759442  normal  0.0566576 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5538  DGPFAETKE family protein  40.68 
 
 
140 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3713  DGPFAETKE family protein  40.68 
 
 
140 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.794137  normal  0.315323 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2144  YCII-related protein  29.9 
 
 
139 aa  50.4  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7112  DGPFAETKE family protein  40.26 
 
 
117 aa  50.1  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.87407  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7113  DGPFAETKE family protein  45.95 
 
 
137 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730513  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2235  YCII-related protein  38.96 
 
 
117 aa  50.1  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.346545  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4024  hypothetical protein  42.37 
 
 
117 aa  48.9  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46830  hypothetical protein  32.38 
 
 
116 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000423585 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1458  YCII-related  38.46 
 
 
142 aa  48.9  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6888  hypothetical protein  42.86 
 
 
138 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235266  normal  0.0297541 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0580  DGPFAETKE family protein  48.72 
 
 
261 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6406  DGPFAETKE family protein  32.14 
 
 
123 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  0.634634 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0283  YCII-related protein  39.68 
 
 
116 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3518  hypothetical protein  37.5 
 
 
139 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.382158  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3474  YCII-related  36.71 
 
 
123 aa  48.9  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2421  DGPFAETKE domain-containing protein  31.63 
 
 
145 aa  48.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2197  DGPFAETKE domain-containing protein  43.75 
 
 
138 aa  48.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.936751  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0021  hypothetical protein  45.95 
 
 
137 aa  48.1  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.512817 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2841  YCII-related protein  37.5 
 
 
135 aa  48.1  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.903735  decreased coverage  0.00264181 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0931  DGPF domain-containing protein  44.07 
 
 
117 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0533  DGPF domain-containing protein  44.07 
 
 
117 aa  47.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0232  hypothetical protein  45.95 
 
 
137 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1441  DGPF domain-containing protein  44.07 
 
 
120 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2635  DGPF domain-containing protein  44.07 
 
 
117 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.230357  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0868  YCII-related protein  39.13 
 
 
108 aa  47.8  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.247388  normal  0.218022 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1521  YCII-related protein  40.74 
 
 
118 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000673434 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3654  YCII-related protein  35.8 
 
 
141 aa  47.8  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.046895  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0260  hypothetical protein  44.07 
 
 
117 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3090  DGPFAETKE domain-containing protein  38.82 
 
 
126 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.471864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3150  DGPFAETKE family protein  38.82 
 
 
126 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.297543 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1638  DGPF domain-containing protein  44.07 
 
 
117 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3110  DGPFAETKE family protein  38.82 
 
 
126 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.484936  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2497  DGPF domain-containing protein  44.07 
 
 
117 aa  47.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0293  DGPF domain-containing protein  44.07 
 
 
117 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.493225  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0231  hypothetical protein  40.68 
 
 
117 aa  47.4  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4454  DGPFAETKE domain-containing protein  31.53 
 
 
122 aa  47.4  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1303  DGPFAETKE family protein  41.07 
 
 
138 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1459  YCII-related  37.5 
 
 
139 aa  47  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>