225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2235 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2235  YCII-related protein  100 
 
 		 117 aa  229  8.000000000000001e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.346545  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4227  YCII-related protein  48.15 
 
 		 110 aa  110  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0725817 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2236  YCII-related protein  51.82 
 
 		 128 aa  107  4.0000000000000004e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.352695  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4218  DGPFAETKE family protein  45.35 
 
 		 118 aa  100  8e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.780161 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4943  DGPFAETKE family protein  42.7 
 
 		 120 aa  95.9  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2256  YCII-related protein  43.48 
 
 		 115 aa  92.4  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2170  YCII-related protein  43.75 
 
 		 113 aa  82.4  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.87091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6185  hypothetical protein  37.93 
 
 		 117 aa  78.2  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353039  normal  0.674023 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3416  YCII-related protein  35.29 
 
 		 119 aa  72.4  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162675  hitchhiker  0.00509587 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0231  hypothetical protein  37.39 
 
 		 117 aa  72  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4454  DGPFAETKE domain-containing protein  36.61 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0198  YCII-related protein  40 
 
 		 116 aa  70.9  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.0536776 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3713  DGPFAETKE family protein  37.39 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.832455 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3855  hypothetical protein  37.39 
 
 		 119 aa  69.3  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.936414 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4552  hypothetical protein  37.39 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.40507  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3811  DGPFAETKE family protein  37.39 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.276008 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4100  DGPFAETKE family protein  34.78 
 
 		 118 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7112  DGPFAETKE family protein  38.26 
 
 		 117 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.87407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4024  hypothetical protein  35.65 
 
 		 117 aa  67.8  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0409  DGPFAETKE family protein  35.25 
 
 		 135 aa  68.2  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00347395  normal  0.0963285 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2285  hypothetical protein  36.52 
 
 		 117 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0910084 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1112  YCII-related  39.8 
 
 		 118 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0499919 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3536  YCII-related protein  34.82 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4360  DGPFAETKE family protein  34.48 
 
 		 389 aa  65.9  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0961  DGPFAETKE family protein  40.82 
 
 		 116 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0814  YCII-related protein  31.93 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.487046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4928  DGPFAETKE family protein  35.65 
 
 		 117 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0813146 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2176  DGPFAETKE family protein  41.77 
 
 		 119 aa  63.9  0.0000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.66649  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4396  hypothetical protein  39.29 
 
 		 116 aa  63.5  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0759442  normal  0.0566576 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4555  DGPFAETKE family protein  34.26 
 
 		 114 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0260  hypothetical protein  34.48 
 
 		 117 aa  62  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3712  DGPFAETKE family protein  33.91 
 
 		 117 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.555531  normal  0.297001 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4062  DGPFAETKE family protein  35.19 
 
 		 114 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5537  DGPFAETKE family protein  33.91 
 
 		 117 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46830  hypothetical protein  36.04 
 
 		 116 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000423585 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1441  DGPF domain-containing protein  34.48 
 
 		 120 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1638  DGPF domain-containing protein  34.48 
 
 		 117 aa  62  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2497  DGPF domain-containing protein  34.48 
 
 		 117 aa  62  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0293  DGPF domain-containing protein  34.48 
 
 		 117 aa  62  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.493225  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1334  DGPFAETKE family protein  34.26 
 
 		 114 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.277602 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0931  DGPF domain-containing protein  34.48 
 
 		 117 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3925  hypothetical protein  32.58 
 
 		 142 aa  62  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.123958 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0545  YCII-related protein  43.84 
 
 		 118 aa  62  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.150513  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2635  DGPF domain-containing protein  34.48 
 
 		 117 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.230357  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3319  hypothetical protein  31.09 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.419553  hitchhiker  0.0000411841 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6406  DGPFAETKE family protein  31.4 
 
 		 123 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  0.634634 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2197  DGPFAETKE domain-containing protein  33.62 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.936751  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4352  YCII-related protein  36.7 
 
 		 123 aa  61.2  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00663803  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1521  YCII-related protein  37.07 
 
 		 118 aa  61.6  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000673434 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1334  DGPFAETKE family protein  31.86 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4327  DGPFAETKE  31.36 
 
 		 114 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0824  DGPFAETKE family protein  34.23 
 
 		 115 aa  60.1  0.000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0533  DGPF domain-containing protein  33.62 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3090  DGPFAETKE domain-containing protein  32.28 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.471864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3150  DGPFAETKE family protein  32.28 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.297543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3110  DGPFAETKE family protein  32.28 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.484936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3850  DGPFAETKE family protein  32.41 
 
 		 114 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2715  DGPFAETKE family protein  33.61 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.651883  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1406  YCII-related protein  32.14 
 
 		 120 aa  58.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48237  normal  0.318259 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6291  DGPFAETKE family protein  30.08 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4035  DGPF domain-containing protein  34.23 
 
 		 116 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.110978  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0960  DGPFAETKE family protein  47.46 
 
 		 119 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3057  YCII-related protein  35.19 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00227791  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2464  YCII-related protein  32.74 
 
 		 120 aa  57  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0107767  hitchhiker  0.00332743 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3474  YCII-related  32.74 
 
 		 123 aa  57  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0813  YCII-related protein  58.33 
 
 		 120 aa  56.6  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4343  YCII-related protein  34.78 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.467101 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1111  YCII-related  36.14 
 
 		 119 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0493804 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2210  YCII-related protein  40.79 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.822068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1303  DGPFAETKE family protein  32.73 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5462  YCII-related protein  30.3 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.330293 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1110  YCII-related  33.9 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0508518 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1555  YCII-related  48.21 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00194658  normal  0.0318419 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3428  DGPFAETKE domain-containing protein  38.57 
 
 		 226 aa  54.3  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3136  YCII-related protein  37.38 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0396  DGPFAETKE family protein  52.08 
 
 		 120 aa  53.9  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5202  YCII-related protein  34.62 
 
 		 122 aa  53.9  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136953  normal  0.501323 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1553  YCII-related protein  36.21 
 
 		 117 aa  53.9  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.386206  normal  0.374591 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3354  DGPFAETKE family protein  37.11 
 
 		 260 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526097  normal  0.294803 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3086  YCII-related protein  32.1 
 
 		 104 aa  53.5  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.11532  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0472  YCII-related protein  45.61 
 
 		 115 aa  52.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.354888  normal  0.131281 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6888  hypothetical protein  32.73 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235266  normal  0.0297541 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0226  YCII-related protein  37.27 
 
 		 113 aa  52.8  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2314  DGPFAETKE family protein  29.17 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.268997 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4577  YCII-related protein  35.43 
 
 		 233 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229228  normal  0.416535 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2284  hypothetical protein  28.46 
 
 		 139 aa  51.6  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0955  DGPFAETKE family protein  34.45 
 
 		 114 aa  52  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.410711  normal  0.159018 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1484  hypothetical protein  32.94 
 
 		 143 aa  51.6  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.786004 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3323  YCII-related protein  33.05 
 
 		 120 aa  51.6  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  0.190231 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6650  DGPFAETKE family protein  41.18 
 
 		 123 aa  52  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.96352  normal  0.40787 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2089  YCII-related protein  52.17 
 
 		 120 aa  52  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.796254 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8414  YCII-related  32.18 
 
 		 144 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1065  DGPFAETKE family protein  32 
 
 		 123 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03730  hypothetical protein  28.46 
 
 		 143 aa  51.2  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.988914  normal  0.724741 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0199  DGPFAETKE domain-containing protein  27.59 
 
 		 138 aa  50.8  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.301875 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1068  YCII-related  36 
 
 		 123 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3338  YCII-related  31.93 
 
 		 121 aa  50.8  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000178684  normal  0.0154405 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4175  hypothetical protein  33.33 
 
 		 126 aa  50.4  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4155  hypothetical protein  29.73 
 
 		 139 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0734985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3319  YCII-related  43.64 
 
 		 251 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>