270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3461 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3461  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  248  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  hitchhiker  0.00155442 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4492  hypothetical protein  78.26 
 
 		 122 aa  194  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.891813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5220  hypothetical protein  78.26 
 
 		 122 aa  194  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5202  YCII-related protein  57.39 
 
 		 122 aa  147  6e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136953  normal  0.501323 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8665  YCII-related protein  57.14 
 
 		 123 aa  145  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2715  DGPFAETKE family protein  57.14 
 
 		 126 aa  144  3e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.651883  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6623  DGPFAETKE family protein  47.71 
 
 		 116 aa  122  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2503  YCII-related protein  49.57 
 
 		 122 aa  122  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2719  DGPFAETKE family protein  48.36 
 
 		 119 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.945599  normal  0.675282 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5460  hypothetical protein  40.16 
 
 		 120 aa  98.2  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.382977  normal  0.0527528 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3323  YCII-related protein  39.34 
 
 		 120 aa  92.8  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  0.190231 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1406  YCII-related protein  40.5 
 
 		 120 aa  91.3  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48237  normal  0.318259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5221  hypothetical protein  53.19 
 
 		 118 aa  90.9  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3192  YCII-related protein  35.96 
 
 		 115 aa  86.7  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.43848  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8876  YCII-related protein  38.98 
 
 		 117 aa  83.6  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5546  DGPFAETKE family protein  40.16 
 
 		 132 aa  79.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112549  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4343  YCII-related protein  35.65 
 
 		 121 aa  76.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.467101 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0198  YCII-related protein  47.25 
 
 		 116 aa  75.9  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.0536776 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2210  YCII-related protein  34.68 
 
 		 133 aa  75.1  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.822068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0383  YCII-related protein  33.33 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4024  hypothetical protein  35.71 
 
 		 117 aa  73.2  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6406  DGPFAETKE family protein  32.76 
 
 		 123 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  0.634634 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0824  DGPFAETKE family protein  34.21 
 
 		 115 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3455  YCII-related protein  37.39 
 
 		 118 aa  73.2  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6291  DGPFAETKE family protein  32.76 
 
 		 123 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4128  YCII-related protein  32.77 
 
 		 123 aa  71.2  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4760  YCII-related protein  31.97 
 
 		 130 aa  70.1  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000445708  hitchhiker  0.000508919 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0226  YCII-related protein  34.75 
 
 		 113 aa  69.3  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0959  DGPFAETKE family protein  29.82 
 
 		 119 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6185  hypothetical protein  34.21 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353039  normal  0.674023 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3855  hypothetical protein  35.25 
 
 		 119 aa  68.6  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.936414 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0955  DGPFAETKE family protein  36.97 
 
 		 114 aa  68.6  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.410711  normal  0.159018 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5826  hypothetical protein  35.14 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.924088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0961  DGPFAETKE family protein  33.33 
 
 		 116 aa  67.8  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3925  hypothetical protein  38.14 
 
 		 142 aa  67  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.123958 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6074  YCII-related protein  34.4 
 
 		 132 aa  67  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.079571  normal  0.4865 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1555  YCII-related  35.59 
 
 		 118 aa  67  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00194658  normal  0.0318419 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1110  YCII-related  29.82 
 
 		 119 aa  66.6  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0508518 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1112  YCII-related  32.46 
 
 		 118 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0499919 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2507  YCII-related protein  32.48 
 
 		 114 aa  65.5  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.521642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4175  hypothetical protein  31.62 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14340  hypothetical protein  38 
 
 		 119 aa  65.9  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143905  normal  0.239735 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1111  YCII-related  36.45 
 
 		 119 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0493804 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3474  YCII-related  33.91 
 
 		 123 aa  65.5  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0231  hypothetical protein  32.46 
 
 		 117 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0409  DGPFAETKE family protein  33.63 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00347395  normal  0.0963285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3642  DGPFAETKE family protein  33.33 
 
 		 154 aa  63.9  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4076  YCII-related protein  33.93 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4313  DGPFAETKE domain-containing protein  32.74 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18250  hypothetical protein  33.93 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4763  YCII-related protein  31.71 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6650  DGPFAETKE family protein  29.06 
 
 		 123 aa  62  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.96352  normal  0.40787 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1952  YCII-related protein  33.06 
 
 		 122 aa  62.8  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00608029 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0396  DGPFAETKE family protein  41.24 
 
 		 120 aa  62.4  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1334  DGPFAETKE family protein  35.79 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2972  hypothetical protein  33 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3319  hypothetical protein  28.07 
 
 		 122 aa  62  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.419553  hitchhiker  0.0000411841 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3416  YCII-related protein  34 
 
 		 119 aa  61.6  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162675  hitchhiker  0.00509587 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1832  YCII-related protein  50.62 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1754  YCII-related protein  35.09 
 
 		 116 aa  61.2  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.261368  normal  0.926785 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1459  YCII-related  35.65 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0349  YCII-related protein  44.59 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0677816 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4327  DGPFAETKE  34.52 
 
 		 114 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4035  DGPF domain-containing protein  36.9 
 
 		 116 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.110978  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4454  DGPFAETKE domain-containing protein  28.7 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46830  hypothetical protein  30.7 
 
 		 116 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000423585 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0960  DGPFAETKE family protein  28.45 
 
 		 119 aa  60.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3057  YCII-related protein  39.78 
 
 		 116 aa  60.8  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00227791  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5674  DGPFAETKE family protein  45.56 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5295  DGPFAETKE domain-containing protein  44.44 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3850  DGPFAETKE family protein  32.17 
 
 		 114 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5384  DGPFAETKE family protein  44.44 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2136  YCII-related protein  32.14 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2285  hypothetical protein  38.55 
 
 		 117 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0910084 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5537  DGPFAETKE family protein  37.35 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2611  DGPFAETKE family protein  41.49 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.089181  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0074  YCII-related protein  40.7 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.888616  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4112  YCII-related protein  44.05 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.423036 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4062  DGPFAETKE family protein  32.17 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3712  DGPFAETKE family protein  37.35 
 
 		 117 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.555531  normal  0.297001 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3549  YCII-related  32.2 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1110  DGPFAETKE family protein  33.91 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0232  hypothetical protein  40.86 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2421  DGPFAETKE domain-containing protein  31.93 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2197  DGPFAETKE domain-containing protein  39.29 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.936751  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0813  YCII-related protein  40.96 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0814  YCII-related protein  32.74 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.487046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0137  hypothetical protein  27.35 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.11133  normal  0.389644 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5462  YCII-related protein  32 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.330293 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3713  DGPFAETKE family protein  39.51 
 
 		 117 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.832455 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4928  DGPFAETKE family protein  37.35 
 
 		 117 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0813146 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1804  DGPF protein  33.33 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4552  hypothetical protein  39.51 
 
 		 117 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.40507  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3090  DGPFAETKE domain-containing protein  32.76 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.471864  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3811  DGPFAETKE family protein  39.51 
 
 		 117 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.276008 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3150  DGPFAETKE family protein  32.76 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.297543 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3252  DGPFAETKE family protein  32.2 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.899565  normal  0.150715 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3110  DGPFAETKE family protein  32.76 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.484936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7112  DGPFAETKE family protein  32.46 
 
 		 117 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.87407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5169  DGPFAETKE family protein  34.41 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0803026 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>