240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0959 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0959  DGPFAETKE family protein  100 
 
 		 119 aa  241  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1110  YCII-related  68.07 
 
 		 119 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0508518 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4327  DGPFAETKE  45.76 
 
 		 114 aa  102  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3850  DGPFAETKE family protein  45.22 
 
 		 114 aa  100  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4555  DGPFAETKE family protein  43.48 
 
 		 114 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1334  DGPFAETKE family protein  43.48 
 
 		 114 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.277602 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4062  DGPFAETKE family protein  44.35 
 
 		 114 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1112  YCII-related  41.07 
 
 		 118 aa  97.4  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0499919 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3319  hypothetical protein  43.48 
 
 		 122 aa  95.5  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.419553  hitchhiker  0.0000411841 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0961  DGPFAETKE family protein  41.07 
 
 		 116 aa  94.7  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1334  DGPFAETKE family protein  40.68 
 
 		 124 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0824  DGPFAETKE family protein  35.71 
 
 		 115 aa  89  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46830  hypothetical protein  40.71 
 
 		 116 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000423585 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4035  DGPF domain-containing protein  40.71 
 
 		 116 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.110978  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3855  hypothetical protein  33.93 
 
 		 119 aa  86.7  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.936414 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0960  DGPFAETKE family protein  35.14 
 
 		 119 aa  86.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1111  YCII-related  33.93 
 
 		 119 aa  84  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0493804 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4175  hypothetical protein  37.5 
 
 		 126 aa  82  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2629  YCII-related protein  43.75 
 
 		 118 aa  80.9  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00535413  normal  0.414588 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2176  DGPFAETKE family protein  36.52 
 
 		 119 aa  80.9  0.000000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.66649  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4492  hypothetical protein  35.96 
 
 		 122 aa  78.2  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.891813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5220  hypothetical protein  35.96 
 
 		 122 aa  78.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3416  YCII-related protein  36.13 
 
 		 119 aa  77.8  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162675  hitchhiker  0.00509587 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3323  YCII-related protein  35.71 
 
 		 120 aa  75.9  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  0.190231 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0198  YCII-related protein  35.04 
 
 		 116 aa  73.9  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.0536776 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2256  YCII-related protein  38.46 
 
 		 115 aa  73.9  0.0000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6185  hypothetical protein  37.72 
 
 		 117 aa  73.9  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353039  normal  0.674023 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0409  DGPFAETKE family protein  35.14 
 
 		 135 aa  73.6  0.0000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00347395  normal  0.0963285 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3428  DGPFAETKE domain-containing protein  33.63 
 
 		 226 aa  72.8  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5202  YCII-related protein  33.33 
 
 		 122 aa  72  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136953  normal  0.501323 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2715  DGPFAETKE family protein  32.14 
 
 		 126 aa  72  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.651883  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3461  hypothetical protein  29.82 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  hitchhiker  0.00155442 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0814  YCII-related protein  32.23 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.487046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2197  DGPFAETKE domain-containing protein  33.62 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.936751  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4454  DGPFAETKE domain-containing protein  35.71 
 
 		 122 aa  67  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2170  YCII-related protein  35.65 
 
 		 113 aa  66.2  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.87091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2314  DGPFAETKE family protein  32.74 
 
 		 118 aa  66.2  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.268997 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5460  hypothetical protein  31.86 
 
 		 120 aa  65.5  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.382977  normal  0.0527528 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3536  YCII-related protein  32.14 
 
 		 112 aa  65.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6291  DGPFAETKE family protein  28.57 
 
 		 123 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0545  YCII-related protein  30.97 
 
 		 118 aa  65.1  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.150513  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6406  DGPFAETKE family protein  28.57 
 
 		 123 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  0.634634 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3192  YCII-related protein  29.46 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.43848  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0260  hypothetical protein  29.46 
 
 		 117 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0533  DGPF domain-containing protein  29.46 
 
 		 117 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1441  DGPF domain-containing protein  29.46 
 
 		 120 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1638  DGPF domain-containing protein  29.46 
 
 		 117 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2497  DGPF domain-containing protein  29.46 
 
 		 117 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0293  DGPF domain-containing protein  29.46 
 
 		 117 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.493225  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4313  DGPFAETKE domain-containing protein  34.82 
 
 		 118 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3123  DGPFAETKE family protein  31.58 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.265819  normal  0.0263064 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1555  YCII-related  36.59 
 
 		 118 aa  61.6  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00194658  normal  0.0318419 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8665  YCII-related protein  33.33 
 
 		 123 aa  61.2  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4360  DGPFAETKE family protein  30.09 
 
 		 389 aa  61.6  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0931  DGPF domain-containing protein  28.57 
 
 		 117 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2635  DGPF domain-containing protein  28.57 
 
 		 117 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.230357  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0472  YCII-related protein  43.42 
 
 		 115 aa  60.8  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.354888  normal  0.131281 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4227  YCII-related protein  43.84 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0725817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4343  YCII-related protein  25.89 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.467101 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4943  DGPFAETKE family protein  36.25 
 
 		 120 aa  60.1  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4218  DGPFAETKE family protein  37.5 
 
 		 118 aa  60.1  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.780161 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2089  YCII-related protein  31.82 
 
 		 120 aa  59.3  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.796254 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4212  DGPFAETKE family protein  35.65 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380376 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4396  hypothetical protein  36.84 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0759442  normal  0.0566576 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3474  YCII-related  28.57 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3642  DGPFAETKE family protein  34.44 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2572  DGPFAETKE family protein  31.58 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.725199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1406  YCII-related protein  29.46 
 
 		 120 aa  58.2  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48237  normal  0.318259 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1303  DGPFAETKE family protein  33.33 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2719  DGPFAETKE family protein  27.83 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.945599  normal  0.675282 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3252  DGPFAETKE family protein  36.25 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.899565  normal  0.150715 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1521  YCII-related protein  31.53 
 
 		 118 aa  57.4  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000673434 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6888  hypothetical protein  33.33 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235266  normal  0.0297541 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3549  YCII-related  35 
 
 		 112 aa  57  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4029  hypothetical protein  29.36 
 
 		 141 aa  57  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46770  hypothetical protein  29.36 
 
 		 141 aa  57  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0208952  decreased coverage  0.000000131045 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4155  hypothetical protein  33.33 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0734985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3090  DGPFAETKE domain-containing protein  32.95 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.471864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3150  DGPFAETKE family protein  32.95 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.297543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3110  DGPFAETKE family protein  32.95 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.484936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8315  YCII-related  30.7 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11198  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2336  YCII-related  28.32 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000398459  hitchhiker  0.000316604 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0226  YCII-related protein  34.58 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3657  YCII-related  31.52 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1747  YCII-related  34.45 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6650  DGPFAETKE family protein  29.91 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.96352  normal  0.40787 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0349  YCII-related protein  31.82 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0677816 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5826  hypothetical protein  26.13 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.924088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3500  DGPFAETKE  30.43 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.161886  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0396  DGPFAETKE family protein  33.67 
 
 		 120 aa  55.5  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0383  YCII-related protein  34.15 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3588  DGPFAETKE family protein  30.43 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2285  hypothetical protein  27.68 
 
 		 117 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0910084 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2236  YCII-related protein  44.26 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.352695  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3654  YCII-related protein  33.04 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.046895  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5551  YCII-related protein  31.86 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.622924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1754  YCII-related protein  36.05 
 
 		 116 aa  54.7  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.261368  normal  0.926785 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2519  DGPFAETKE  30.43 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.278396  normal  0.095455 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1804  DGPF protein  31.62 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4928  DGPFAETKE family protein  25.89 
 
 		 117 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0813146 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>