206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2236 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2236  YCII-related protein  100 
 
 		 128 aa  261  2e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.352695  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4227  YCII-related protein  49.07 
 
 		 110 aa  112  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0725817 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2235  YCII-related protein  51.82 
 
 		 117 aa  107  4.0000000000000004e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.346545  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2170  YCII-related protein  50 
 
 		 113 aa  105  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.87091  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2256  YCII-related protein  41.96 
 
 		 115 aa  103  7e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4943  DGPFAETKE family protein  42.74 
 
 		 120 aa  96.3  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4218  DGPFAETKE family protein  41.03 
 
 		 118 aa  95.5  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.780161 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4555  DGPFAETKE family protein  37.61 
 
 		 114 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1334  DGPFAETKE family protein  37.61 
 
 		 114 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.277602 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4062  DGPFAETKE family protein  38.46 
 
 		 114 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4327  DGPFAETKE  36.44 
 
 		 114 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189764  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1112  YCII-related  50.63 
 
 		 118 aa  79  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0499919 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0961  DGPFAETKE family protein  49.37 
 
 		 116 aa  78.2  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6185  hypothetical protein  41.38 
 
 		 117 aa  78.2  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353039  normal  0.674023 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1334  DGPFAETKE family protein  35.29 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3850  DGPFAETKE family protein  36.75 
 
 		 114 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0198  YCII-related protein  35.45 
 
 		 116 aa  71.2  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.0536776 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3319  hypothetical protein  42.35 
 
 		 122 aa  70.1  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.419553  hitchhiker  0.0000411841 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3416  YCII-related protein  37.84 
 
 		 119 aa  70.1  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162675  hitchhiker  0.00509587 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2176  DGPFAETKE family protein  42.86 
 
 		 119 aa  68.9  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.66649  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1110  YCII-related  35.54 
 
 		 119 aa  67  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0508518 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0472  YCII-related protein  38.18 
 
 		 115 aa  67  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.354888  normal  0.131281 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4175  hypothetical protein  38.14 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4454  DGPFAETKE domain-containing protein  42.86 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3536  YCII-related protein  32.14 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4035  DGPF domain-containing protein  41.89 
 
 		 116 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.110978  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46830  hypothetical protein  42.47 
 
 		 116 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000423585 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0960  DGPFAETKE family protein  41.03 
 
 		 119 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6406  DGPFAETKE family protein  30.09 
 
 		 123 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  0.634634 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0824  DGPFAETKE family protein  36.28 
 
 		 115 aa  61.2  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1555  YCII-related  41.89 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00194658  normal  0.0318419 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1553  YCII-related protein  46.58 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.386206  normal  0.374591 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6291  DGPFAETKE family protein  39.13 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2629  YCII-related protein  38.74 
 
 		 118 aa  58.9  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00535413  normal  0.414588 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0545  YCII-related protein  38.89 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.150513  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3474  YCII-related  33.33 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1111  YCII-related  37.18 
 
 		 119 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0493804 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0074  YCII-related protein  30.19 
 
 		 107 aa  58.5  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.888616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0409  DGPFAETKE family protein  40 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00347395  normal  0.0963285 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3855  hypothetical protein  29.31 
 
 		 119 aa  57.8  0.00000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.936414 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1521  YCII-related protein  31.03 
 
 		 118 aa  57.4  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000673434 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0814  YCII-related protein  30.63 
 
 		 125 aa  57.4  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.487046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8665  YCII-related protein  37.89 
 
 		 123 aa  57  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5462  YCII-related protein  34.34 
 
 		 146 aa  57  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.330293 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4212  DGPFAETKE family protein  32.74 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380376 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0231  hypothetical protein  31.25 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4396  hypothetical protein  33.64 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0759442  normal  0.0566576 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4084  YCII-related protein  30.97 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.304074 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4024  hypothetical protein  33.01 
 
 		 117 aa  55.1  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2421  DGPFAETKE domain-containing protein  32.69 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7112  DGPFAETKE family protein  31.3 
 
 		 117 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.87407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0959  DGPFAETKE family protein  44.26 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3588  DGPFAETKE family protein  33.67 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3500  DGPFAETKE  32.65 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.161886  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4352  YCII-related protein  31.31 
 
 		 123 aa  54.3  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00663803  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3657  YCII-related  32.65 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6196  YCII-related protein  35.71 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0396  DGPFAETKE family protein  38.16 
 
 		 120 aa  53.9  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0813  YCII-related protein  38.36 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3057  YCII-related protein  45.61 
 
 		 116 aa  52.8  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00227791  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3354  DGPFAETKE family protein  42.86 
 
 		 260 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526097  normal  0.294803 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0955  DGPFAETKE family protein  35.71 
 
 		 114 aa  53.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.410711  normal  0.159018 
 
 
-
 
NC_003296  RS03730  hypothetical protein  36.45 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.988914  normal  0.724741 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1484  hypothetical protein  36.25 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.786004 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0561  YCII-related protein  41.67 
 
 		 115 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0502519 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3136  YCII-related protein  31.78 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2464  YCII-related protein  26.55 
 
 		 120 aa  52.4  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0107767  hitchhiker  0.00332743 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4029  hypothetical protein  28.83 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6650  DGPFAETKE family protein  34.17 
 
 		 123 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.96352  normal  0.40787 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4552  hypothetical protein  30.43 
 
 		 117 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.40507  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46770  hypothetical protein  30.19 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0208952  decreased coverage  0.000000131045 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3811  DGPFAETKE family protein  30.43 
 
 		 117 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.276008 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1406  YCII-related protein  28.32 
 
 		 120 aa  52  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48237  normal  0.318259 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8414  YCII-related  31.25 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3252  DGPFAETKE family protein  30.56 
 
 		 112 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.899565  normal  0.150715 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3713  DGPFAETKE family protein  30.43 
 
 		 117 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.832455 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3428  DGPFAETKE domain-containing protein  35.62 
 
 		 226 aa  51.2  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5537  DGPFAETKE family protein  37.04 
 
 		 117 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3712  DGPFAETKE family protein  37.04 
 
 		 117 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.555531  normal  0.297001 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0382  YCII-related protein  41.89 
 
 		 115 aa  50.8  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00477239  decreased coverage  0.00575194 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3086  YCII-related protein  34.67 
 
 		 104 aa  50.8  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.11532  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2507  YCII-related protein  38.46 
 
 		 114 aa  50.8  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.521642  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2089  YCII-related protein  35.62 
 
 		 120 aa  50.8  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.796254 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8876  YCII-related protein  50 
 
 		 117 aa  50.1  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1754  YCII-related protein  35.37 
 
 		 116 aa  50.4  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.261368  normal  0.926785 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3925  hypothetical protein  30.63 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.123958 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4577  YCII-related protein  46 
 
 		 233 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229228  normal  0.416535 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2826  DGPFAETKE family protein  28.97 
 
 		 158 aa  50.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.655447 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2284  hypothetical protein  36.99 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5538  DGPFAETKE family protein  36.99 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3713  DGPFAETKE family protein  36.99 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.794137  normal  0.315323 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4928  DGPFAETKE family protein  29.17 
 
 		 117 aa  48.9  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0813146 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2336  YCII-related  39.19 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000398459  hitchhiker  0.000316604 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4155  hypothetical protein  29.73 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0734985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4551  hypothetical protein  36.99 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.626002  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3812  DGPFAETKE family protein  36.99 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0137  hypothetical protein  33.33 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.11133  normal  0.389644 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1702  YCII-related protein  47.37 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6888  hypothetical protein  32.73 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235266  normal  0.0297541 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3712  DGPFAETKE family protein  36.99 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>