91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2826 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2826  DGPFAETKE family protein  100 
 
 		 158 aa  317  3.9999999999999996e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.655447 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3416  YCII-related protein  34.78 
 
 		 119 aa  68.6  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162675  hitchhiker  0.00509587 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3855  hypothetical protein  35.29 
 
 		 119 aa  63.9  0.0000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.936414 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0824  DGPFAETKE family protein  35.4 
 
 		 115 aa  63.5  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3319  hypothetical protein  34.21 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.419553  hitchhiker  0.0000411841 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4327  DGPFAETKE  35.09 
 
 		 114 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4062  DGPFAETKE family protein  40.66 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3850  DGPFAETKE family protein  37 
 
 		 114 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3536  YCII-related protein  33.94 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4555  DGPFAETKE family protein  38.46 
 
 		 114 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1334  DGPFAETKE family protein  38.46 
 
 		 114 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.277602 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1110  YCII-related  34.55 
 
 		 119 aa  57.8  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0508518 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3090  DGPFAETKE domain-containing protein  36.52 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.471864  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3110  DGPFAETKE family protein  36.52 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.484936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3150  DGPFAETKE family protein  36.52 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.297543 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1112  YCII-related  32.29 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0499919 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2176  DGPFAETKE family protein  33.63 
 
 		 119 aa  55.1  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.66649  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2170  YCII-related protein  33.03 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.87091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2629  YCII-related protein  35.9 
 
 		 118 aa  53.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00535413  normal  0.414588 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1334  DGPFAETKE family protein  37.36 
 
 		 124 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4352  YCII-related protein  36.08 
 
 		 123 aa  53.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00663803  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4454  DGPFAETKE domain-containing protein  34.57 
 
 		 122 aa  52.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2314  DGPFAETKE family protein  31.03 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.268997 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0545  YCII-related protein  34.15 
 
 		 118 aa  52.8  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.150513  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4396  hypothetical protein  40.18 
 
 		 116 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0759442  normal  0.0566576 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4035  DGPF domain-containing protein  29.67 
 
 		 116 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.110978  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2256  YCII-related protein  30.28 
 
 		 115 aa  52.4  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4218  DGPFAETKE family protein  34.41 
 
 		 118 aa  51.6  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.780161 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0959  DGPFAETKE family protein  30.36 
 
 		 119 aa  52  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0199  DGPFAETKE domain-containing protein  27.18 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.301875 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0813  YCII-related protein  45.78 
 
 		 120 aa  51.2  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0198  YCII-related protein  37.5 
 
 		 116 aa  51.2  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.0536776 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0961  DGPFAETKE family protein  31.58 
 
 		 116 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46830  hypothetical protein  30.77 
 
 		 116 aa  51.2  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000423585 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4024  hypothetical protein  30.91 
 
 		 117 aa  50.8  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4360  DGPFAETKE family protein  34.88 
 
 		 389 aa  50.4  0.000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2236  YCII-related protein  28.97 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.352695  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6185  hypothetical protein  27.83 
 
 		 117 aa  49.7  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353039  normal  0.674023 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0409  DGPFAETKE family protein  34.21 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00347395  normal  0.0963285 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4943  DGPFAETKE family protein  33.33 
 
 		 120 aa  49.7  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0814  YCII-related protein  36.14 
 
 		 125 aa  48.9  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.487046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6406  DGPFAETKE family protein  32.11 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  0.634634 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3086  YCII-related protein  37.97 
 
 		 104 aa  48.9  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.11532  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0260  hypothetical protein  30.61 
 
 		 117 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0293  DGPF domain-containing protein  30.61 
 
 		 117 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.493225  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2497  DGPF domain-containing protein  30.61 
 
 		 117 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1441  DGPF domain-containing protein  30.61 
 
 		 120 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6291  DGPFAETKE family protein  31.19 
 
 		 123 aa  48.5  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1638  DGPF domain-containing protein  30.61 
 
 		 117 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2197  DGPFAETKE domain-containing protein  26.44 
 
 		 138 aa  47.8  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.936751  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2719  DGPFAETKE family protein  47.37 
 
 		 119 aa  47.4  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.945599  normal  0.675282 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3192  YCII-related protein  32.71 
 
 		 115 aa  47.4  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.43848  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3474  YCII-related  29.82 
 
 		 123 aa  47.4  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2635  DGPF domain-containing protein  30.11 
 
 		 117 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.230357  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0931  DGPF domain-containing protein  30.11 
 
 		 117 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0533  DGPF domain-containing protein  30.11 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5537  DGPFAETKE family protein  36.36 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4227  YCII-related protein  30 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0725817 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6650  DGPFAETKE family protein  30.77 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.96352  normal  0.40787 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7112  DGPFAETKE family protein  31.4 
 
 		 117 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.87407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4552  hypothetical protein  35.06 
 
 		 117 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.40507  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3712  DGPFAETKE family protein  36.36 
 
 		 117 aa  45.1  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.555531  normal  0.297001 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1521  YCII-related protein  29.03 
 
 		 118 aa  45.1  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000673434 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3713  DGPFAETKE family protein  35.06 
 
 		 117 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.832455 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3811  DGPFAETKE family protein  35.06 
 
 		 117 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.276008 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14340  hypothetical protein  39.02 
 
 		 119 aa  44.7  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143905  normal  0.239735 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4928  DGPFAETKE family protein  37.66 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0813146 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3549  YCII-related  29.21 
 
 		 112 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3252  DGPFAETKE family protein  30.85 
 
 		 112 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.899565  normal  0.150715 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4100  DGPFAETKE family protein  25.58 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2235  YCII-related protein  30.11 
 
 		 117 aa  43.9  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.346545  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2464  YCII-related protein  33.04 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0107767  hitchhiker  0.00332743 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3500  DGPFAETKE  26.72 
 
 		 147 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.161886  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1804  DGPF protein  27.59 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3925  hypothetical protein  31.18 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.123958 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4175  hypothetical protein  29.52 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3518  hypothetical protein  27.71 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.382158  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3588  DGPFAETKE family protein  26.72 
 
 		 147 aa  42.4  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0396  DGPFAETKE family protein  37.78 
 
 		 120 aa  42.4  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2285  hypothetical protein  33.77 
 
 		 117 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0910084 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0283  YCII-related protein  31.18 
 
 		 116 aa  42.4  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3354  DGPFAETKE family protein  45.1 
 
 		 260 aa  42.4  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526097  normal  0.294803 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4577  YCII-related protein  33.06 
 
 		 233 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229228  normal  0.416535 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1702  YCII-related protein  31.4 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0349  YCII-related protein  26.37 
 
 		 136 aa  41.2  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0677816 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3657  YCII-related  26.72 
 
 		 147 aa  41.6  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0231  hypothetical protein  27.91 
 
 		 117 aa  41.2  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0074  YCII-related protein  35 
 
 		 107 aa  40.8  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.888616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0410  DGPFAETKE family protein  26.47 
 
 		 137 aa  40.8  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00435378  normal  0.146566 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2421  DGPFAETKE domain-containing protein  32.93 
 
 		 145 aa  40.8  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1555  YCII-related  32.5 
 
 		 118 aa  40.4  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00194658  normal  0.0318419 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>