155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3192 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3192  YCII-related protein  100 
 
 		 115 aa  235  1e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.43848  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3461  hypothetical protein  35.96 
 
 		 122 aa  86.7  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  hitchhiker  0.00155442 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4492  hypothetical protein  35.96 
 
 		 122 aa  85.1  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.891813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5220  hypothetical protein  35.96 
 
 		 122 aa  85.1  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6406  DGPFAETKE family protein  33.04 
 
 		 123 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  0.634634 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2715  DGPFAETKE family protein  33.93 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.651883  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6185  hypothetical protein  33.04 
 
 		 117 aa  80.5  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353039  normal  0.674023 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0824  DGPFAETKE family protein  35.4 
 
 		 115 aa  79  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6291  DGPFAETKE family protein  31.25 
 
 		 123 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3855  hypothetical protein  34.82 
 
 		 119 aa  77.4  0.00000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.936414 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1406  YCII-related protein  38.39 
 
 		 120 aa  76.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48237  normal  0.318259 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3319  hypothetical protein  29.46 
 
 		 122 aa  75.5  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.419553  hitchhiker  0.0000411841 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0198  YCII-related protein  37.39 
 
 		 116 aa  75.5  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.0536776 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4454  DGPFAETKE domain-containing protein  34.82 
 
 		 122 aa  75.5  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5202  YCII-related protein  31.3 
 
 		 122 aa  74.3  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136953  normal  0.501323 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2719  DGPFAETKE family protein  35.09 
 
 		 119 aa  74.3  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.945599  normal  0.675282 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5460  hypothetical protein  33.93 
 
 		 120 aa  71.2  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.382977  normal  0.0527528 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3474  YCII-related  33.93 
 
 		 123 aa  70.5  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4327  DGPFAETKE  33.04 
 
 		 114 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8665  YCII-related protein  29.81 
 
 		 123 aa  69.3  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2210  YCII-related protein  39.2 
 
 		 133 aa  69.3  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.822068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3536  YCII-related protein  34.17 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3323  YCII-related protein  31.25 
 
 		 120 aa  67.8  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  0.190231 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3416  YCII-related protein  33.33 
 
 		 119 aa  67.4  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162675  hitchhiker  0.00509587 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1521  YCII-related protein  31.86 
 
 		 118 aa  66.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000673434 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1110  YCII-related  31.25 
 
 		 119 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0508518 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2503  YCII-related protein  30.77 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4035  DGPF domain-containing protein  25.89 
 
 		 116 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.110978  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3850  DGPFAETKE family protein  31.25 
 
 		 114 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2176  DGPFAETKE family protein  29.17 
 
 		 119 aa  64.7  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.66649  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0959  DGPFAETKE family protein  29.46 
 
 		 119 aa  63.9  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46830  hypothetical protein  26.36 
 
 		 116 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000423585 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4062  DGPFAETKE family protein  31.25 
 
 		 114 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4555  DGPFAETKE family protein  30.36 
 
 		 114 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1334  DGPFAETKE family protein  30.36 
 
 		 114 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.277602 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3925  hypothetical protein  30.09 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.123958 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1334  DGPFAETKE family protein  28.07 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177164  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4128  YCII-related protein  31.9 
 
 		 123 aa  61.2  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4024  hypothetical protein  32.73 
 
 		 117 aa  60.1  0.000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4218  DGPFAETKE family protein  32.2 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.780161 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3090  DGPFAETKE domain-containing protein  31.58 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.471864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3150  DGPFAETKE family protein  31.58 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.297543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3110  DGPFAETKE family protein  31.58 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.484936  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0814  YCII-related protein  29.82 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.487046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4943  DGPFAETKE family protein  30.25 
 
 		 120 aa  59.7  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0545  YCII-related protein  30.09 
 
 		 118 aa  58.9  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.150513  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0383  YCII-related protein  30.56 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334499  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1884  YCII-related protein  32.76 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110578  normal  0.498584 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4360  DGPFAETKE family protein  29.73 
 
 		 389 aa  57.8  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0961  DGPFAETKE family protein  26.79 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4760  YCII-related protein  33.94 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000445708  hitchhiker  0.000508919 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4343  YCII-related protein  27.68 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.467101 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4175  hypothetical protein  27.62 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4352  YCII-related protein  32.74 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00663803  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1112  YCII-related  25 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0499919 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2507  YCII-related protein  31.9 
 
 		 114 aa  55.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.521642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4552  hypothetical protein  30.09 
 
 		 117 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.40507  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5537  DGPFAETKE family protein  30.97 
 
 		 117 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3811  DGPFAETKE family protein  30.09 
 
 		 117 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.276008 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3713  DGPFAETKE family protein  30.09 
 
 		 117 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.832455 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3712  DGPFAETKE family protein  30.97 
 
 		 117 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.555531  normal  0.297001 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14340  hypothetical protein  29.91 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143905  normal  0.239735 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0231  hypothetical protein  27.43 
 
 		 117 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6074  YCII-related protein  29.06 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.079571  normal  0.4865 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2256  YCII-related protein  34.82 
 
 		 115 aa  54.3  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4396  hypothetical protein  32.69 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0759442  normal  0.0566576 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0409  DGPFAETKE family protein  28.83 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00347395  normal  0.0963285 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4928  DGPFAETKE family protein  30.09 
 
 		 117 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0813146 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4763  YCII-related protein  31.31 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2285  hypothetical protein  32.17 
 
 		 117 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0910084 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1555  YCII-related  29.46 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00194658  normal  0.0318419 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2593  YCII-related protein  31.25 
 
 		 121 aa  53.5  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0260  hypothetical protein  29.2 
 
 		 117 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1638  DGPF domain-containing protein  29.2 
 
 		 117 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2497  DGPF domain-containing protein  29.2 
 
 		 117 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0293  DGPF domain-containing protein  29.2 
 
 		 117 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.493225  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4227  YCII-related protein  29.06 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0725817 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7112  DGPFAETKE family protein  28.32 
 
 		 117 aa  52  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.87407  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4112  YCII-related protein  45.21 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.423036 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5546  DGPFAETKE family protein  34.43 
 
 		 132 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112549  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1441  DGPF domain-containing protein  29.2 
 
 		 120 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0533  DGPF domain-containing protein  29.2 
 
 		 117 aa  51.6  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0955  DGPFAETKE family protein  29.46 
 
 		 114 aa  51.2  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.410711  normal  0.159018 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3549  YCII-related  29.09 
 
 		 112 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2972  hypothetical protein  27.27 
 
 		 140 aa  50.4  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2314  DGPFAETKE family protein  29.2 
 
 		 118 aa  50.4  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.268997 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0931  DGPF domain-containing protein  28.32 
 
 		 117 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2635  DGPF domain-containing protein  28.32 
 
 		 117 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.230357  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8876  YCII-related protein  28.16 
 
 		 117 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6650  DGPFAETKE family protein  26.67 
 
 		 123 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.96352  normal  0.40787 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2170  YCII-related protein  33.93 
 
 		 113 aa  48.9  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.87091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6623  DGPFAETKE family protein  27.63 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0813  YCII-related protein  30.09 
 
 		 120 aa  48.5  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0472  YCII-related protein  31.58 
 
 		 115 aa  48.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.354888  normal  0.131281 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0137  hypothetical protein  25.71 
 
 		 123 aa  48.1  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.11133  normal  0.389644 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4313  DGPFAETKE domain-containing protein  25.64 
 
 		 118 aa  47.8  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3707  YCII-related protein  31.48 
 
 		 129 aa  47.8  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2826  DGPFAETKE family protein  32.71 
 
 		 158 aa  47.4  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.655447 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4076  YCII-related protein  25.62 
 
 		 138 aa  47.4  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3252  DGPFAETKE family protein  28.18 
 
 		 112 aa  47  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.899565  normal  0.150715 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>