252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0561 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0561  YCII-related protein  100 
 
 		 115 aa  231  4.0000000000000004e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0502519 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0955  DGPFAETKE family protein  42.48 
 
 		 114 aa  83.6  9e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.410711  normal  0.159018 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0382  YCII-related protein  44.95 
 
 		 115 aa  82  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00477239  decreased coverage  0.00575194 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2755  DGPFAETKE family protein  50.93 
 
 		 120 aa  81.6  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1334  DGPFAETKE family protein  50.6 
 
 		 124 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3416  YCII-related protein  46.15 
 
 		 119 aa  71.2  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162675  hitchhiker  0.00509587 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2507  YCII-related protein  38.52 
 
 		 114 aa  70.9  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.521642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2314  DGPFAETKE family protein  35.96 
 
 		 118 aa  70.9  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.268997 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4062  DGPFAETKE family protein  40.91 
 
 		 114 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3850  DGPFAETKE family protein  40 
 
 		 114 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4555  DGPFAETKE family protein  49.4 
 
 		 114 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3090  DGPFAETKE domain-containing protein  44.94 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.471864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3150  DGPFAETKE family protein  44.94 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.297543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3110  DGPFAETKE family protein  44.94 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.484936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1334  DGPFAETKE family protein  49.4 
 
 		 114 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.277602 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0545  YCII-related protein  35.96 
 
 		 118 aa  67.8  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.150513  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4327  DGPFAETKE  45.78 
 
 		 114 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6291  DGPFAETKE family protein  38.05 
 
 		 123 aa  67  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46830  hypothetical protein  37.39 
 
 		 116 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000423585 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2629  YCII-related protein  42.98 
 
 		 118 aa  66.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00535413  normal  0.414588 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8876  YCII-related protein  50 
 
 		 117 aa  66.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4396  hypothetical protein  48.72 
 
 		 116 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0759442  normal  0.0566576 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6406  DGPFAETKE family protein  38.05 
 
 		 123 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  0.634634 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3474  YCII-related  37.72 
 
 		 123 aa  65.1  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4035  DGPF domain-containing protein  41.67 
 
 		 116 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.110978  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0472  YCII-related protein  39.13 
 
 		 115 aa  64.3  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.354888  normal  0.131281 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0814  YCII-related protein  41.49 
 
 		 125 aa  63.5  0.0000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.487046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2176  DGPFAETKE family protein  47.73 
 
 		 119 aa  63.9  0.0000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.66649  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3252  DGPFAETKE family protein  35.78 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.899565  normal  0.150715 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0567  YCII-related protein  38.18 
 
 		 111 aa  62.8  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115419  normal  0.692983 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2256  YCII-related protein  37.04 
 
 		 115 aa  62.8  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0824  DGPFAETKE family protein  37.5 
 
 		 115 aa  60.8  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1110  YCII-related  35.4 
 
 		 119 aa  60.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0508518 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0528  YCII-related  33.64 
 
 		 114 aa  60.8  0.000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3455  YCII-related protein  35.65 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3319  hypothetical protein  31.58 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.419553  hitchhiker  0.0000411841 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0396  DGPFAETKE family protein  40.23 
 
 		 120 aa  60.5  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4352  YCII-related protein  36.75 
 
 		 123 aa  60.5  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00663803  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2715  DGPFAETKE family protein  45.45 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.651883  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3549  YCII-related  34.86 
 
 		 112 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3354  DGPFAETKE family protein  40.82 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526097  normal  0.294803 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1555  YCII-related  43.37 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00194658  normal  0.0318419 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1112  YCII-related  40.66 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0499919 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3855  hypothetical protein  40.23 
 
 		 119 aa  59.3  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.936414 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0409  DGPFAETKE family protein  36.21 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00347395  normal  0.0963285 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3536  YCII-related protein  33.93 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0795  hypothetical protein  38.04 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.999252  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3712  DGPFAETKE family protein  36.61 
 
 		 117 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.555531  normal  0.297001 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4552  hypothetical protein  40.96 
 
 		 117 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.40507  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2475  hypothetical protein  32.17 
 
 		 114 aa  58.2  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0163393 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5537  DGPFAETKE family protein  42.17 
 
 		 117 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3811  DGPFAETKE family protein  40.96 
 
 		 117 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.276008 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2452  DGPFAETKE family protein  38.04 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0408545 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3713  DGPFAETKE family protein  40.96 
 
 		 117 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.832455 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4313  DGPFAETKE domain-containing protein  32.74 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0198  YCII-related protein  39.77 
 
 		 116 aa  58.2  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.0536776 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3642  DGPFAETKE family protein  35.54 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2170  YCII-related protein  43.75 
 
 		 113 aa  57.4  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.87091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6196  YCII-related protein  32.26 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1484  hypothetical protein  34.48 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.786004 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8315  YCII-related  35.87 
 
 		 140 aa  57  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11198  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8414  YCII-related  36.84 
 
 		 144 aa  57  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4161  hypothetical protein  37.1 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.78704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4454  DGPFAETKE domain-containing protein  39.76 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4928  DGPFAETKE family protein  36.61 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0813146 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3531  DGPFAETKE family protein  35.63 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8235  YCII-related protein  40.48 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1553  YCII-related protein  39.81 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.386206  normal  0.374591 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1406  YCII-related protein  39.51 
 
 		 120 aa  56.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48237  normal  0.318259 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0961  DGPFAETKE family protein  35.4 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1298  DGPFAETKE family protein  36.29 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.670188  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2285  hypothetical protein  39.76 
 
 		 117 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0910084 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0528  hypothetical protein  34.78 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252797  normal  0.454149 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0755  YCII-related protein  31.96 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5462  YCII-related protein  39.8 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.330293 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3123  DGPFAETKE family protein  34.52 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.265819  normal  0.0263064 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3086  YCII-related protein  37.63 
 
 		 104 aa  54.3  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.11532  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1126  DGPF domain-containing protein  34.41 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0193856  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0813  YCII-related protein  38.83 
 
 		 120 aa  53.5  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4112  YCII-related protein  38.61 
 
 		 146 aa  53.5  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.423036 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46770  hypothetical protein  34.69 
 
 		 141 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0208952  decreased coverage  0.000000131045 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2503  YCII-related protein  36.21 
 
 		 122 aa  53.5  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0310  DGPF domain-containing protein  35.48 
 
 		 246 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.471649  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2336  YCII-related  35.96 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000398459  hitchhiker  0.000316604 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0256  DGPF domain-containing protein  35.48 
 
 		 243 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.162797  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0988  DGPF domain-containing protein  35.48 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2236  YCII-related protein  41.67 
 
 		 128 aa  52.8  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.352695  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3338  YCII-related  37.61 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000178684  normal  0.0154405 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4260  DGPF protein  35.04 
 
 		 123 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.286045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2572  DGPFAETKE family protein  32.97 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.725199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4029  hypothetical protein  32.65 
 
 		 141 aa  52  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5169  DGPFAETKE family protein  33.33 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0803026 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2458  YCII-related  34.09 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3256  hypothetical protein  33.33 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5112  DGPFAETKE family protein  33.33 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4084  YCII-related protein  42.86 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.304074 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0384  DGPF domain-containing protein  35.48 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391971  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1835  DGPF domain-containing protein  35.48 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.565065  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2089  YCII-related protein  38.3 
 
 		 120 aa  52.4  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.796254 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1339  DGPF domain-containing protein  35.48 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.071027  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>