99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2116 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2116  DGPFAETKE family protein  100 
 
 		 125 aa  254  3e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.323809  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3785  DGPFAETKE family protein  82.68 
 
 		 127 aa  213  5e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1065  DGPFAETKE family protein  35.83 
 
 		 123 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1007  DGPFAETKE domain-containing protein  35 
 
 		 123 aa  83.6  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1068  YCII-related  34.17 
 
 		 123 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3500  DGPFAETKE  36 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.161886  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3588  DGPFAETKE family protein  41.76 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3657  YCII-related  41.76 
 
 		 147 aa  60.5  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8235  YCII-related protein  39.78 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03730  hypothetical protein  36.36 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.988914  normal  0.724741 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2284  hypothetical protein  33.33 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5462  YCII-related protein  35.29 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.330293 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5743  YCII-related protein  33.33 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4927  DGPFAETKE family protein  34.38 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0785882 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0231  hypothetical protein  37.65 
 
 		 117 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1441  DGPF domain-containing protein  38.67 
 
 		 120 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0260  hypothetical protein  38.67 
 
 		 117 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7112  DGPFAETKE family protein  37.8 
 
 		 117 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.87407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0293  DGPF domain-containing protein  38.67 
 
 		 117 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.493225  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2497  DGPF domain-containing protein  38.67 
 
 		 117 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2635  DGPF domain-containing protein  38.67 
 
 		 117 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.230357  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1638  DGPF domain-containing protein  38.67 
 
 		 117 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0931  DGPF domain-containing protein  38.67 
 
 		 117 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0533  DGPF domain-containing protein  38.67 
 
 		 117 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4551  hypothetical protein  32.29 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.626002  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3713  DGPFAETKE family protein  33.33 
 
 		 140 aa  52.8  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.794137  normal  0.315323 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3712  DGPFAETKE family protein  32.29 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5551  YCII-related protein  37.18 
 
 		 145 aa  52.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.622924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3812  DGPFAETKE family protein  32.29 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2256  YCII-related protein  31.03 
 
 		 115 aa  52.8  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5538  DGPFAETKE family protein  32.29 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0283  YCII-related protein  33.33 
 
 		 116 aa  52.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3924  hypothetical protein  29.13 
 
 		 141 aa  51.6  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.762923  normal  0.122571 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1702  YCII-related protein  35.44 
 
 		 146 aa  51.2  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5265  YCII-related  40 
 
 		 123 aa  50.8  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4100  DGPFAETKE family protein  34.15 
 
 		 118 aa  50.4  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4099  DGPFAETKE family protein  31.25 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8414  YCII-related  32.99 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0021  hypothetical protein  34.38 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.512817 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4025  hypothetical protein  32.04 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0349  YCII-related protein  34.75 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0677816 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4212  DGPFAETKE family protein  36.99 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380376 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3712  DGPFAETKE family protein  37.5 
 
 		 117 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.555531  normal  0.297001 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0232  hypothetical protein  33.33 
 
 		 137 aa  48.9  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0534  DGPF domain-containing protein  32.29 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.362719  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5537  DGPFAETKE family protein  38.03 
 
 		 117 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2496  DGPF domain-containing protein  32.29 
 
 		 137 aa  47.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0929  DGPF domain-containing protein  32.29 
 
 		 137 aa  47.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2634  DGPF domain-containing protein  32.29 
 
 		 137 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.821675  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2285  hypothetical protein  36.62 
 
 		 117 aa  47  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0910084 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3319  hypothetical protein  29.35 
 
 		 122 aa  47  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.419553  hitchhiker  0.0000411841 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4225  DGPF domain-containing protein  31.18 
 
 		 105 aa  47  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.81583  hitchhiker  0.00855962 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3123  DGPFAETKE family protein  34.44 
 
 		 141 aa  47  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.265819  normal  0.0263064 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2235  YCII-related protein  30.23 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.346545  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0261  hypothetical protein  32.14 
 
 		 137 aa  45.4  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0294  DGPF domain-containing protein  32.14 
 
 		 137 aa  45.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.360873  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1639  DGPF domain-containing protein  32.14 
 
 		 137 aa  45.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4525  DGPFAETKE family protein  33.33 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1442  DGPF domain-containing protein  32.14 
 
 		 137 aa  45.4  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4029  hypothetical protein  32.22 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7113  DGPFAETKE family protein  31.25 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730513  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1458  YCII-related  31.11 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46770  hypothetical protein  32.22 
 
 		 141 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0208952  decreased coverage  0.000000131045 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5048  DGPFAETKE family protein  34.62 
 
 		 143 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.291625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2831  DGPFAETKE family protein  31.51 
 
 		 138 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.618861  normal  0.707195 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2421  DGPFAETKE domain-containing protein  31.87 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2781  YCII-related protein  36.84 
 
 		 112 aa  43.9  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.496959  normal  0.164771 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3713  DGPFAETKE family protein  33.8 
 
 		 117 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.832455 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3855  hypothetical protein  35.71 
 
 		 119 aa  43.9  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.936414 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3811  DGPFAETKE family protein  33.8 
 
 		 117 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.276008 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4227  YCII-related protein  33.33 
 
 		 110 aa  43.9  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0725817 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4552  hypothetical protein  33.8 
 
 		 117 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.40507  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4928  DGPFAETKE family protein  33.75 
 
 		 117 aa  43.9  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0813146 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1484  hypothetical protein  32.98 
 
 		 143 aa  43.5  0.0008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.786004 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0580  DGPFAETKE family protein  29.27 
 
 		 261 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1459  YCII-related  36 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6196  YCII-related protein  35.87 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4024  hypothetical protein  33.33 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0022  hypothetical protein  36.99 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.346854 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0960  DGPFAETKE family protein  35.94 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4218  DGPFAETKE family protein  35.06 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.780161 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5356  YCII-related protein  36.36 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6888  hypothetical protein  33.33 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235266  normal  0.0297541 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3925  hypothetical protein  33.33 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.123958 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2210  YCII-related protein  34.62 
 
 		 133 aa  42  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.822068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0961  DGPFAETKE family protein  45 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6650  DGPFAETKE family protein  36.84 
 
 		 123 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.96352  normal  0.40787 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2236  YCII-related protein  34.85 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.352695  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2519  DGPFAETKE  28.89 
 
 		 141 aa  40.8  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.278396  normal  0.095455 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2336  YCII-related  40 
 
 		 118 aa  40.8  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000398459  hitchhiker  0.000316604 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1111  YCII-related  31.68 
 
 		 119 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0493804 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4360  DGPFAETKE family protein  47.5 
 
 		 389 aa  40.8  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19760  hypothetical protein  29.67 
 
 		 145 aa  40.4  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.113314  hitchhiker  0.00158371 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1754  YCII-related protein  28.43 
 
 		 116 aa  40.8  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.261368  normal  0.926785 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1112  YCII-related  42.5 
 
 		 118 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0499919 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3654  YCII-related protein  34.78 
 
 		 141 aa  40.4  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.046895  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3531  DGPFAETKE family protein  32.88 
 
 		 143 aa  40.4  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0868  YCII-related protein  31.17 
 
 		 108 aa  40.4  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.247388  normal  0.218022 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3319  YCII-related  35.21 
 
 		 251 aa  40  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>