146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5265 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_5265  YCII-related  100 
 
 		 123 aa  248  1e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1065  DGPFAETKE family protein  41.59 
 
 		 123 aa  95.1  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1007  DGPFAETKE domain-containing protein  42.48 
 
 		 123 aa  94.4  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1068  YCII-related  41.59 
 
 		 123 aa  94.7  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4025  hypothetical protein  38.28 
 
 		 149 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0232  hypothetical protein  41.41 
 
 		 137 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0534  DGPF domain-containing protein  38.28 
 
 		 137 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.362719  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0021  hypothetical protein  45.36 
 
 		 137 aa  81.6  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.512817 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2634  DGPF domain-containing protein  44.33 
 
 		 137 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.821675  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2496  DGPF domain-containing protein  44.33 
 
 		 137 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0929  DGPF domain-containing protein  44.33 
 
 		 137 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2284  hypothetical protein  44.33 
 
 		 139 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7113  DGPFAETKE family protein  39.2 
 
 		 137 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730513  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0261  hypothetical protein  43.3 
 
 		 137 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4551  hypothetical protein  44.33 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.626002  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3812  DGPFAETKE family protein  44.33 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1442  DGPF domain-containing protein  43.3 
 
 		 137 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1639  DGPF domain-containing protein  43.3 
 
 		 137 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0294  DGPF domain-containing protein  43.3 
 
 		 137 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.360873  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3712  DGPFAETKE family protein  44.33 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0283  YCII-related protein  39.67 
 
 		 116 aa  78.6  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5538  DGPFAETKE family protein  44.33 
 
 		 140 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3713  DGPFAETKE family protein  44.33 
 
 		 140 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.794137  normal  0.315323 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4927  DGPFAETKE family protein  44.33 
 
 		 140 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0785882 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2519  DGPFAETKE  33.87 
 
 		 141 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.278396  normal  0.095455 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3657  YCII-related  36 
 
 		 147 aa  77  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5743  YCII-related protein  41.11 
 
 		 118 aa  75.9  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3588  DGPFAETKE family protein  35.2 
 
 		 147 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1702  YCII-related protein  37.1 
 
 		 146 aa  75.5  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3500  DGPFAETKE  38.54 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.161886  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2421  DGPFAETKE domain-containing protein  36.29 
 
 		 145 aa  74.3  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4099  DGPFAETKE family protein  36 
 
 		 137 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5462  YCII-related protein  43.3 
 
 		 146 aa  73.6  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.330293 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5048  DGPFAETKE family protein  37.8 
 
 		 143 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.291625  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03730  hypothetical protein  37.5 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.988914  normal  0.724741 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3924  hypothetical protein  39.6 
 
 		 141 aa  72.8  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.762923  normal  0.122571 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3256  hypothetical protein  42.71 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46770  hypothetical protein  37.9 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0208952  decreased coverage  0.000000131045 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5112  DGPFAETKE family protein  42.71 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4029  hypothetical protein  37.9 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1458  YCII-related  35.77 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4525  DGPFAETKE family protein  37.8 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0528  hypothetical protein  41.67 
 
 		 143 aa  72  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252797  normal  0.454149 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5169  DGPFAETKE family protein  41.67 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0803026 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3123  DGPFAETKE family protein  35.48 
 
 		 141 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.265819  normal  0.0263064 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4212  DGPFAETKE family protein  40.62 
 
 		 144 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380376 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2458  YCII-related  44.79 
 
 		 140 aa  70.1  0.000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8315  YCII-related  42.71 
 
 		 140 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11198  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0349  YCII-related protein  43.16 
 
 		 136 aa  69.3  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0677816 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0580  DGPFAETKE family protein  43.53 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3531  DGPFAETKE family protein  37.1 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2831  DGPFAETKE family protein  33.87 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.618861  normal  0.707195 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4361  DGPFAETKE family protein  36.72 
 
 		 137 aa  67.8  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2197  DGPFAETKE domain-containing protein  36.51 
 
 		 138 aa  67  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.936751  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0199  DGPFAETKE domain-containing protein  36.73 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.301875 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3708  DGPFAETKE family protein  32.8 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.229966  normal  0.769344 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0868  YCII-related protein  44.32 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.247388  normal  0.218022 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3488  DGPFAETKE  39.58 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0795  hypothetical protein  39.58 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.999252  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2452  DGPFAETKE family protein  39.58 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0408545 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1126  DGPF domain-containing protein  38.54 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0193856  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1484  hypothetical protein  36.36 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.786004 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6888  hypothetical protein  39.8 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235266  normal  0.0297541 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6196  YCII-related protein  31.71 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1804  DGPF protein  38.78 
 
 		 136 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3518  hypothetical protein  38.78 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.382158  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1584  DGPFAETKE  33.59 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1303  DGPFAETKE family protein  36.73 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1750  DGPF domain-containing protein  38.54 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.605944  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0988  DGPF domain-containing protein  38.54 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1459  YCII-related  39.39 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0384  DGPF domain-containing protein  38.54 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391971  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19760  hypothetical protein  35.2 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.113314  hitchhiker  0.00158371 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1835  DGPF domain-containing protein  38.54 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.565065  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1339  DGPF domain-containing protein  38.54 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.071027  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5551  YCII-related protein  32.26 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.622924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0310  DGPF domain-containing protein  38.54 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.471649  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4155  hypothetical protein  38.38 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0734985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0256  DGPF domain-containing protein  38.54 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.162797  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2572  DGPFAETKE family protein  36.46 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.725199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8414  YCII-related  34.34 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8235  YCII-related protein  36.46 
 
 		 139 aa  57  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4225  DGPF domain-containing protein  46.48 
 
 		 105 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.81583  hitchhiker  0.00855962 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3785  DGPFAETKE family protein  38.64 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3319  YCII-related  38.54 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3654  YCII-related protein  32 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.046895  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2116  DGPFAETKE family protein  32.38 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.323809  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1320  DGPFAETKE family protein  35.35 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.746126  normal  0.587484 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2256  YCII-related protein  37.23 
 
 		 115 aa  54.3  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4024  hypothetical protein  36.56 
 
 		 117 aa  51.2  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3642  DGPFAETKE family protein  27.42 
 
 		 154 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5826  hypothetical protein  33.67 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.924088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3416  YCII-related protein  32.99 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162675  hitchhiker  0.00509587 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0694  hypothetical protein  29.17 
 
 		 279 aa  49.3  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0969715  unclonable  0.00000000507336 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18250  hypothetical protein  31.63 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1521  YCII-related protein  30.61 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000673434 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3321  histidine kinase  31.25 
 
 		 284 aa  47.8  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000411841 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6889  putative glutathione S-transferase  29.03 
 
 		 391 aa  47.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0839725  normal  0.0391413 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2503  YCII-related protein  34.62 
 
 		 122 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0231  hypothetical protein  32.26 
 
 		 117 aa  47.8  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>