196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2057 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2057  transcriptional regulator-like protein  100 
 
 		 320 aa  620  1e-177  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.090135  normal  0.188447 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1866  transcriptional regulator protein-like protein  52.57 
 
 		 354 aa  277  2e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00621522  normal  0.291628 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18560  predicted transcriptional regulator  49.4 
 
 		 361 aa  264  2e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.0049611  normal  0.0116825 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1783  transcriptional regulator protein-like protein  50.91 
 
 		 337 aa  259  3e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  unclonable  0.000000000261192  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1879  transcriptional regulator-like  46.84 
 
 		 352 aa  217  2e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1287  putative transcriptional regulator protein  41.49 
 
 		 334 aa  205  1e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.271739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2316  DeoR family transcriptional regulator  43.65 
 
 		 331 aa  195  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000471902  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1200  transcriptional regulator-like  45.13 
 
 		 315 aa  192  9e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.386828  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1501  transcriptional regulator  39.16 
 
 		 683 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.634725  decreased coverage  0.0000677289 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3091  hypothetical protein  40.91 
 
 		 359 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.727496  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3444  hypothetical protein  40.61 
 
 		 335 aa  182  8.000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5862  transcriptional regulator protein-like protein  41.46 
 
 		 318 aa  180  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.167693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2434  hypothetical protein  38.51 
 
 		 361 aa  177  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2610  transcriptional regulator-like  40 
 
 		 361 aa  177  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000080301  normal  0.16283 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1826  transcriptional regulator protein-like protein  41.67 
 
 		 313 aa  177  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21980  predicted transcriptional regulator  42.41 
 
 		 327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.143715  normal  0.382871 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12131  hypothetical protein  38.6 
 
 		 332 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000529286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2249  putative transcriptional regulator protein  41.08 
 
 		 327 aa  173  3.9999999999999995e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1771  transcriptional regulator  39.05 
 
 		 675 aa  172  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.193993  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2472  hypothetical protein  39.75 
 
 		 326 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2517  hypothetical protein  39.75 
 
 		 326 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2509  hypothetical protein  40.25 
 
 		 326 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.308334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2686  hypothetical protein  40.88 
 
 		 327 aa  161  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13990  predicted transcriptional regulator  39.94 
 
 		 348 aa  160  2e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0412748  normal  0.158003 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2367  hypothetical protein  38.75 
 
 		 330 aa  159  9e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1924  transcriptional regulator-like protein  38.26 
 
 		 663 aa  156  4e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000155311 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4456  transcriptional regulator,-like protein  36.57 
 
 		 335 aa  156  5.0000000000000005e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.427678  normal  0.167477 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2466  transcriptional regulator protein-like protein  37.04 
 
 		 331 aa  154  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0245457  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2959  transcriptional regulator protein-like protein  36.45 
 
 		 364 aa  154  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000346913  hitchhiker  0.00472926 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2181  transcriptional regulator-like protein  36.81 
 
 		 663 aa  150  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117971  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2249  hypothetical protein  39.06 
 
 		 330 aa  147  3e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00588148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2650  transcriptional regulator-like  36.12 
 
 		 323 aa  142  8e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.535773  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2167  hypothetical protein  34.57 
 
 		 325 aa  125  8.000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.175858  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4872  hypothetical protein  35.05 
 
 		 401 aa  125  9e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16040  predicted transcriptional regulator  34.66 
 
 		 664 aa  107  3e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5753  putative DeoR-family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 369 aa  72.8  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3107  Helix-turn-helix type 11 domain protein  31.09 
 
 		 324 aa  72.4  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.786544  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11950  predicted transcriptional regulator  35.62 
 
 		 699 aa  68.6  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.308253  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4015  transcriptional regulator protein-like protein  30 
 
 		 512 aa  65.9  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4738  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  33.5 
 
 		 313 aa  65.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.947562  normal  0.956989 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6729  Helix-turn-helix type 11 domain protein  33.33 
 
 		 324 aa  65.1  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.41486 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3553  helix-turn-helix, type 11  27.93 
 
 		 238 aa  63.9  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5785  transcriptional regulator protein-like protein  28.45 
 
 		 687 aa  63.2  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.611435 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3646  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.61 
 
 		 309 aa  63.2  0.000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000392325  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5106  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  30.24 
 
 		 319 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.505458  normal  0.201643 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4041  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.68 
 
 		 316 aa  61.2  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3513  Helix-turn-helix type 11 domain protein  31.78 
 
 		 322 aa  59.7  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4095  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 333 aa  59.7  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4104  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  31.63 
 
 		 316 aa  59.7  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3867  Helix-turn-helix type 11 domain protein  33.8 
 
 		 335 aa  58.9  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1946  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  31.12 
 
 		 321 aa  58.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1446  putative transcriptional regulator  31.58 
 
 		 332 aa  57.4  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00684408  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4059  helix-turn-helix, type 11  32.31 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.348793  normal  0.0202879 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0988  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  29.86 
 
 		 317 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0499  hypothetical protein  30.05 
 
 		 229 aa  57  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.477682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0960  helix-turn-helix, type 11  29.86 
 
 		 317 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.386939  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4033  transcriptional regulator protein-like protein  30.37 
 
 		 511 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.559835  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0978  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  29.86 
 
 		 317 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.318116  normal  0.0703128 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4065  transcriptional regulator protein-like protein  30.37 
 
 		 511 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0615  putative DeoR-family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 334 aa  56.2  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1185  hypothetical protein  27.31 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0249  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  33.7 
 
 		 324 aa  56.2  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6203  DeoR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 318 aa  55.8  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1347  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  31.16 
 
 		 339 aa  56.2  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.469049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2673  hypothetical protein  51.67 
 
 		 698 aa  55.8  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.749079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3925  transcriptional regulator-like  26.77 
 
 		 345 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.836948  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0607  putative DeoR-family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 334 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0920  Helix-turn-helix type 11 domain protein  30.77 
 
 		 327 aa  54.7  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.711136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02350  predicted transcriptional regulator  32.34 
 
 		 327 aa  55.1  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2687  transcriptional regulator-like protein  29.81 
 
 		 331 aa  54.3  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1247  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  31.63 
 
 		 317 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161645 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4172  Helix-turn-helix type 11 domain protein  32.3 
 
 		 317 aa  53.9  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.917159  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1808  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  33.87 
 
 		 327 aa  53.9  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.503322  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0284  Helix-turn-helix type 11 domain protein  33.51 
 
 		 332 aa  53.5  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.527195 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1067  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  32.97 
 
 		 320 aa  53.5  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1001  hypothetical protein  26.87 
 
 		 313 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3926  transcriptional regulator-like  32.49 
 
 		 323 aa  53.1  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.816323  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5463  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  31.69 
 
 		 313 aa  53.1  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.364956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0713  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.15 
 
 		 319 aa  53.1  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.677583  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4323  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  29.86 
 
 		 327 aa  52.8  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.807083  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0623  DeoR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 335 aa  53.1  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0977  DeoR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 360 aa  52.8  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.226699  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1823  Helix-turn-helix type 11 domain protein  30.9 
 
 		 237 aa  52.8  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406304  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1092  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.5 
 
 		 315 aa  52  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.206539  normal  0.830453 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2974  DeoR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 319 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.779274  normal  0.781562 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8630  DeoR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 322 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0094  Helix-turn-helix type 11 domain protein  31.35 
 
 		 325 aa  52.4  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1244  HTH domain family  27.75 
 
 		 313 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5212  Helix-turn-helix type 11 domain protein  32.47 
 
 		 317 aa  51.6  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000701081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0998  transcriptional regulator  25.99 
 
 		 313 aa  51.6  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5244  DeoR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 337 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.288323 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0991  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  24.16 
 
 		 302 aa  51.2  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3900  hypothetical protein  30.94 
 
 		 326 aa  50.4  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3062  Helix-turn-helix type 11 domain protein  45.95 
 
 		 313 aa  50.8  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.408718  normal  0.752018 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45460  hypothetical protein  29.77 
 
 		 323 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2021  Helix-turn-helix type 11 domain protein  30.54 
 
 		 317 aa  50.8  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0370713  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1870  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  32.67 
 
 		 337 aa  50.8  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.199317 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5238  transcriptional regulator  24.56 
 
 		 304 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0664508  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3403  transcriptional regulator-like protein  26.39 
 
 		 323 aa  50.4  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0101274  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4016  transcriptional regulator-like protein  35.9 
 
 		 323 aa  50.4  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.620781  normal  0.983747 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>