176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1429 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1429  N-acetylglucosamine-binding protein A  100 
 
 		 486 aa  1009    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3879  N-acetylglucosamine-binding protein A  39.22 
 
 		 477 aa  310  5e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000531215  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3466  N-acetylglucosamine-binding protein A  39.61 
 
 		 481 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.266116  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3589  N-acetylglucosamine-binding protein A  39.61 
 
 		 481 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0896  N-acetylglucosamine-binding protein A  39.61 
 
 		 481 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3390  N-acetylglucosamine-binding protein A  39.61 
 
 		 481 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1072  N-acetylglucosamine-binding protein A  37.5 
 
 		 491 aa  296  8e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3027  N-acetylglucosamine-binding protein A  36.46 
 
 		 491 aa  294  2e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.483728 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0947  N-acetylglucosamine-binding protein A  39.04 
 
 		 491 aa  293  4e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.809737  normal  0.0565044 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0134  N-acetylglucosamine-binding protein A  40.65 
 
 		 491 aa  279  8e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271889  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4108  N-acetylglucosamine-binding protein A  34.9 
 
 		 473 aa  268  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1030  N-acetylglucosamine-binding protein A  38.44 
 
 		 481 aa  264  3e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1419  N-acetylglucosamine-binding protein A  34.84 
 
 		 497 aa  264  3e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.28582  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001124  chitin binding protein  39.11 
 
 		 487 aa  254  2.0000000000000002e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.177583  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04739  N-acetylglucosamine-binding protein A  36.24 
 
 		 487 aa  251  2e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0423  N-acetylglucosamine-binding protein A  37.87 
 
 		 485 aa  247  4e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0208095  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4239  N-acetylglucosamine-binding protein A  32.89 
 
 		 471 aa  221  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.225029 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2455  putative chitin binding protein  46.15 
 
 		 221 aa  189  8e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2838  putative chitin binding protein  45.64 
 
 		 221 aa  188  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1926  chitin-binding domain-containing protein  48.44 
 
 		 216 aa  188  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00415605  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2855  chitin binding protein, putative  46.43 
 
 		 221 aa  187  5e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2586  chitin-binding protein  46.43 
 
 		 221 aa  187  5e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00109431  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2876  putative chitin binding protein  46.43 
 
 		 221 aa  187  5e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00584171  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2636  chitin binding protein  45.92 
 
 		 221 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.218903  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2552  chitin-binding protein  45.92 
 
 		 221 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2827  chitin binding protein  45.92 
 
 		 221 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2833  putative chitin binding protein  45.92 
 
 		 221 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000729775 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2627  chitin-binding domain-containing protein  46.35 
 
 		 221 aa  183  7e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0865441  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  48.09 
 
 		 455 aa  182  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  47.54 
 
 		 455 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3478  chitin-binding domain-containing protein  46.97 
 
 		 197 aa  180  4e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.499275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  45.99 
 
 		 455 aa  180  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  45.99 
 
 		 455 aa  179  7e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  31.53 
 
 		 455 aa  178  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  46.45 
 
 		 455 aa  178  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  46.99 
 
 		 455 aa  178  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  46.99 
 
 		 455 aa  178  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  44.39 
 
 		 456 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  46.45 
 
 		 455 aa  177  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  42.44 
 
 		 459 aa  177  5e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  45.45 
 
 		 455 aa  176  6e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  45.45 
 
 		 455 aa  176  6e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  44.09 
 
 		 458 aa  172  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0276  chitin-binding protein  42.71 
 
 		 456 aa  172  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281673  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1712  chitin-binding domain protein  41.54 
 
 		 458 aa  159  9e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000111699 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04370  hypothetical protein  36.72 
 
 		 445 aa  155  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1611  chitin-binding domain 3 protein  42.08 
 
 		 201 aa  153  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0398981 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2657  chitin-binding domain 3 protein  42.08 
 
 		 201 aa  147  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2206  hypothetical protein  38.92 
 
 		 220 aa  145  2e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3184  chitin-binding domain 3 protein  39.23 
 
 		 197 aa  139  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0613231  hitchhiker  0.000000000626319 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3877  chitin-binding domain 3 protein  30.84 
 
 		 390 aa  124  3e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.770078 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6726  chitin-binding protein  36.87 
 
 		 236 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4667  chitin-binding protein CbpD precursor  27.3 
 
 		 388 aa  111  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.353514  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53250  chitin-binding protein CbpD precursor  28.12 
 
 		 389 aa  110  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.889986 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3878  chitin-binding domain 3 protein  28.75 
 
 		 391 aa  110  5e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2456  chitin-binding domain-containing protein  31.07 
 
 		 266 aa  99.8  9e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.361389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5107  chitin-binding domain 3 protein  31.5 
 
 		 171 aa  98.2  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.687229  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0257  hypothetical protein  29.73 
 
 		 378 aa  97.1  6e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4858  chitin-binding domain-containing protein  31.47 
 
 		 266 aa  95.9  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.667508  normal  0.0771656 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1647  chitin-binding domain-containing protein  32.16 
 
 		 356 aa  93.6  7e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0765002  normal  0.540301 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5334  chitin-binding domain 3 protein  32.63 
 
 		 262 aa  92.4  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509642  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5303  chitin-binding domain 3 protein  34.2 
 
 		 172 aa  91.3  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.43185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3599  hypothetical protein  30 
 
 		 245 aa  88.6  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.488922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5855  chitin-binding domain-containing protein  31.05 
 
 		 192 aa  88.2  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.78659  normal  0.147977 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1632  chitin-binding domain-containing protein  31.31 
 
 		 338 aa  86.7  9e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3219  chitin binding protein, putative  31.07 
 
 		 214 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0610  fibronectin type III domain-containing protein/ chitin binding domain-containing protein  28.5 
 
 		 464 aa  85.9  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0692  fibronectin type III domain-containing protein  29.19 
 
 		 465 aa  85.5  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0797  chitin-binding domain-containing protein  32.5 
 
 		 211 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.515634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1381  Chitinase  30.57 
 
 		 651 aa  84  0.000000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.456861  normal  0.0706322 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2896  chitin binding protein, putative  31.07 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.555035  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0114  chitin binding domain-containing protein  31.07 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.116887  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1645  putative chitin binding protein  31.07 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3979  chitin-binding domain-containing protein  31.07 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.173041  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3076  putative chitin binding protein  31.07 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7565  hypothetical protein  33.5 
 
 		 359 aa  83.6  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3898  chitin-binding domain-containing protein  31.07 
 
 		 233 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.633676  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4281  chitin-binding domain 3 protein  32.04 
 
 		 183 aa  82.4  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1483  chitin-binding domain-containing protein  29.51 
 
 		 244 aa  80.9  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.815729  hitchhiker  0.000167974 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3474  putative chitin binding protein  34.46 
 
 		 185 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3569  chitin-binding domain-containing protein  28.17 
 
 		 211 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.833618  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1372  chitin-binding domain 3 protein  25.11 
 
 		 393 aa  76.6  0.0000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.507673 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0490  chitin-binding domain 3 protein  30.69 
 
 		 313 aa  74.7  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0145571 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4057  carbohydrate-binding family V/XII protein  50.85 
 
 		 600 aa  73.9  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770883  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2856  chitin-binding domain-containing protein  25.91 
 
 		 247 aa  73.6  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0288918 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0283  chitin-binding protein  28.96 
 
 		 251 aa  71.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  28.05 
 
 		 438 aa  70.5  0.00000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4286  chitin-binding domain 3 protein  28.26 
 
 		 347 aa  69.3  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3037  chitin-binding domain-containing protein  29.76 
 
 		 360 aa  68.9  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.245182  normal  0.198398 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7908  hypothetical protein  27.18 
 
 		 285 aa  67.4  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.921269  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1040  chitin-binding domain 3 protein  27.45 
 
 		 372 aa  65.5  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0290504 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3263  chitin-binding domain-containing protein  28.78 
 
 		 358 aa  65.5  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.175629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2647  chitin-binding domain-containing protein  27.39 
 
 		 307 aa  65.1  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0138367  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2718  chitin-binding domain-containing protein  23.92 
 
 		 405 aa  65.1  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279999  hitchhiker  0.00241809 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2978  chitin-binding protein, putative  28.79 
 
 		 249 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00351674  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0175  chitin-binding domain 3 protein  23.73 
 
 		 400 aa  62.4  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242955 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3518  chitin-binding domain 3 protein  25.33 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4405  chitinase  51.92 
 
 		 353 aa  60.1  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2047  chitin binding domain-containing protein  22.94 
 
 		 417 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0759  chitin binding domain-containing protein  22.94 
 
 		 408 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>