More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1336 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1336  ABC transporter related  100 
 
 		 234 aa  436  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.256607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1297  ABC transporter related  97.44 
 
 		 234 aa  423  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0935  ABC transporter related  91.45 
 
 		 234 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0302332  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1417  ABC transporter related  91.45 
 
 		 234 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1395  ABC transporter related  92.31 
 
 		 234 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.858988 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4561  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  91.45 
 
 		 234 aa  380  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.474601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1898  ABC transporter related  86.75 
 
 		 234 aa  375  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.202766 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2651  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  68.8 
 
 		 234 aa  280  1e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1827  putative branched amino acid related transport system protein  69.66 
 
 		 234 aa  275  6e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.32321  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1651  ABC transporter, ATP-binding protein  69.66 
 
 		 234 aa  275  6e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1673  ABC transporter, ATP-binding protein  69.66 
 
 		 234 aa  275  6e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.836277  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0909  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  69.23 
 
 		 234 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0440  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  69.23 
 
 		 234 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0722  ABC transporter, ATP-binding protein  69.23 
 
 		 234 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.452485  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1440  ABC transporter, ATP-binding protein  69.23 
 
 		 234 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.333973  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1321  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  56.96 
 
 		 237 aa  240  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2814  ABC transporter related  56.54 
 
 		 237 aa  237  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0747835 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1604  ABC transporter related  55.27 
 
 		 237 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3312  ABC transporter related  51.08 
 
 		 231 aa  223  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000555614  hitchhiker  0.00984182 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1754  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  49.57 
 
 		 239 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1403  ABC transporter related  48.71 
 
 		 237 aa  218  7.999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668018  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1450  ABC transporter related  47.01 
 
 		 239 aa  218  8.999999999999998e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0957848  hitchhiker  0.000807382 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1491  ABC transporter related  47.01 
 
 		 239 aa  218  8.999999999999998e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318894  normal  0.254571 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1793  ABC transporter related  48.72 
 
 		 235 aa  216  2.9999999999999998e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1858  ABC transporter-related protein  50 
 
 		 237 aa  214  9e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4171  ABC transporter related  48.05 
 
 		 231 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2574  ABC transporter related  47.62 
 
 		 231 aa  209  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.261355  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2926  ABC transporter related  46.32 
 
 		 231 aa  208  7e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.103898  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1841  ABC transporter related  48.48 
 
 		 231 aa  208  7e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.373128 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1577  ABC transporter related  48.09 
 
 		 238 aa  207  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.787524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2021  ABC transporter related  47.62 
 
 		 231 aa  206  2e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0684522  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2387  ABC transporter related  48.48 
 
 		 231 aa  206  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0332278  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1774  putative amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  51.71 
 
 		 236 aa  205  6e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.328885  normal  0.085306 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0025  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.35 
 
 		 238 aa  204  8e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1683  ABC transporter related  47.62 
 
 		 231 aa  204  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0028  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.92 
 
 		 238 aa  203  2e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4568  ABC transporter related  45.02 
 
 		 232 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.272221  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2930  ABC transporter-related protein  49.35 
 
 		 231 aa  201  6e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.208893  normal  0.372931 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1570  ABC transporter related  44.59 
 
 		 232 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.687597 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1576  ABC transporter related  44.59 
 
 		 231 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1853  ABC transporter-related protein  50.46 
 
 		 235 aa  199  3.9999999999999996e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3165  ABC transporter related  44.4 
 
 		 241 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.317931  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0222  ABC transporter related  46.54 
 
 		 243 aa  186  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  42.92 
 
 		 231 aa  176  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0545  ABC transporter related  44.64 
 
 		 234 aa  175  6e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.756199 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1819  ABC transporter related protein  40.62 
 
 		 234 aa  172  5.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.527395  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0362  ABC transporter related  46.72 
 
 		 243 aa  171  7.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.960542  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  45.12 
 
 		 233 aa  170  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  41.85 
 
 		 236 aa  169  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1284  ABC transporter related  43.11 
 
 		 234 aa  170  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.275207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1446  ABC transporter related  43.11 
 
 		 234 aa  170  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0771597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3423  ABC transporter related  43.52 
 
 		 237 aa  169  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  45.58 
 
 		 233 aa  169  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1979  ABC transporter related  43.83 
 
 		 236 aa  169  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3737  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.73 
 
 		 234 aa  169  4e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.548098  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4754  ABC transporter-related protein  47.44 
 
 		 234 aa  169  4e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5338  ABC transporter related  45.09 
 
 		 823 aa  168  6e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.591038  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3827  ABC transporter related  43.3 
 
 		 237 aa  168  6e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  41.41 
 
 		 236 aa  168  6e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4904  ABC transporter related  43.3 
 
 		 237 aa  168  6e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5821  ABC transporter related  42.4 
 
 		 233 aa  168  9e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.602049  normal  0.151305 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4818  ABC transporter related  42.59 
 
 		 243 aa  167  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2027  ABC transporter related  43.11 
 
 		 234 aa  166  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813889  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2768  ABC transporter related  38.67 
 
 		 237 aa  166  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0458182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3554  ABC transporter related  43.11 
 
 		 234 aa  166  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.256863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4906  ABC transporter related  42.42 
 
 		 229 aa  167  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.463566 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3664  ABC transporter component  47.47 
 
 		 230 aa  166  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2518  ABC transporter related  41.51 
 
 		 248 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.778502  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  45.29 
 
 		 233 aa  166  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  45.12 
 
 		 234 aa  166  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  45.29 
 
 		 233 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0736  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  40.91 
 
 		 234 aa  166  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  45.29 
 
 		 233 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3170  ABC transporter-related protein  46.46 
 
 		 236 aa  166  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00314839  normal  0.639262 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4851  ABC transporter related  45.09 
 
 		 823 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0084  ABC transporter related  45.75 
 
 		 251 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.911043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3131  ABC transporter related  40.93 
 
 		 237 aa  166  4e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1400  ABC transporter related  41.12 
 
 		 239 aa  166  4e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.656641  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2420  ABC transporter related  39.56 
 
 		 242 aa  165  5e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0355  ABC transporter related  42.86 
 
 		 234 aa  165  5.9999999999999996e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1244  ABC transporter related  41.7 
 
 		 236 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193229  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0086  ABC transporter related  45.75 
 
 		 251 aa  164  8e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.610645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0075  ABC transporter related  45.75 
 
 		 251 aa  164  8e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0102  ABC transporter related  45.28 
 
 		 251 aa  164  9e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1673  ABC transporter related  40.57 
 
 		 251 aa  164  9e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2971  ABC transporter related  45.28 
 
 		 251 aa  164  9e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0084  ABC transporter related  45.28 
 
 		 251 aa  164  9e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2063  ABC transporter related  42.79 
 
 		 241 aa  164  9e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.773711  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5755  ABC transporter related  41.67 
 
 		 235 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.805145  normal  0.982959 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5998  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.69 
 
 		 235 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355908  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0149  ABC transporter related  42.86 
 
 		 247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.744689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  41.01 
 
 		 232 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2330  ABC transporter related  39.72 
 
 		 248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0157  ABC transporter related  41.3 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3486  ABC transporter related  41.47 
 
 		 238 aa  164  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.265059  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3462  ABC transporter related  43.04 
 
 		 235 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  41.2 
 
 		 231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2866  ABC transporter related  40 
 
 		 233 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.699047 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  41.2 
 
 		 231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1585  ABC transporter related  47.49 
 
 		 237 aa  163  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>