208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II0302 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II0302  hypothetical protein  100 
 
 
155 aa  315  1e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6838  protein of unknown function UPF0066  55.7 
 
 
151 aa  179  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3420  hypothetical protein  54.42 
 
 
159 aa  176  7e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.82049  normal  0.0336552 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1550  protein of unknown function UPF0066  48.99 
 
 
153 aa  159  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0545  protein of unknown function UPF0066  48.32 
 
 
154 aa  158  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3119  hypothetical protein  44.22 
 
 
157 aa  150  7e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.322422  hitchhiker  0.0000104071 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2049  hypothetical protein  44.9 
 
 
157 aa  150  8.999999999999999e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0141829  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2254  hypothetical protein  44.9 
 
 
159 aa  149  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0608346  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2007  hypothetical protein  44.22 
 
 
157 aa  149  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2008  hypothetical protein  44.22 
 
 
157 aa  149  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.120607  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2336  hypothetical protein  44.22 
 
 
157 aa  149  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.23741  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2206  hypothetical protein  43.54 
 
 
157 aa  148  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.953877  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2068  hypothetical protein  43.54 
 
 
157 aa  148  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2224  hypothetical protein  43.54 
 
 
157 aa  148  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1630  hypothetical protein  43.54 
 
 
157 aa  147  6e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00729863  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2421  hypothetical protein  45.33 
 
 
163 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.11336  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2252  hypothetical protein  42.47 
 
 
157 aa  142  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.89628e-27 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4335  putative transcriptional regulator  42.18 
 
 
156 aa  134  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518263  normal  0.598505 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1303  protein of unknown function UPF0066  47.33 
 
 
155 aa  131  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3133  putative transcriptional regulator  44.67 
 
 
155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3087  hypothetical protein  40.27 
 
 
160 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245386  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3384  hypothetical protein  38.26 
 
 
152 aa  110  6e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.208867  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1466  hypothetical protein  41.44 
 
 
182 aa  94.4  5e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00269022  normal  0.108849 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0402  hypothetical protein  41.28 
 
 
182 aa  91.3  5e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1519  hypothetical protein  42.2 
 
 
182 aa  90.1  9e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00122931 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0760  hypothetical protein  42.31 
 
 
150 aa  87.8  5e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0464  hypothetical protein  38.06 
 
 
173 aa  87.8  6e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1328  hypothetical protein  35.65 
 
 
180 aa  83.2  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00949818  decreased coverage  0.00397758 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3464  hypothetical protein  39.42 
 
 
153 aa  82.8  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1885  hypothetical protein  46.32 
 
 
167 aa  82.4  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1613  hypothetical protein  38.74 
 
 
147 aa  82  0.000000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1359  hypothetical protein  36.64 
 
 
147 aa  82  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2411  hypothetical protein  39.55 
 
 
182 aa  80.9  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.543009  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3030  protein of unknown function UPF0066  39.55 
 
 
172 aa  80.5  0.000000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000046144  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1495  hypothetical protein  38.6 
 
 
147 aa  79.7  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.524483  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2292  hypothetical protein  38.35 
 
 
265 aa  77.8  0.00000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0258  hypothetical protein  42.16 
 
 
163 aa  77.8  0.00000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1275  hypothetical protein  36.67 
 
 
160 aa  77.8  0.00000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.147453 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0512  hypothetical protein  40 
 
 
151 aa  77  0.00000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.140743  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1700  hypothetical protein  35.37 
 
 
160 aa  77  0.00000000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.03303 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1722  hypothetical protein  36.61 
 
 
160 aa  76.3  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.579056 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1388  hypothetical protein  39.2 
 
 
133 aa  75.9  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108578  hitchhiker  0.00000533919 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0426  hypothetical protein  31.88 
 
 
162 aa  75.5  0.0000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.088537  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4759  hypothetical protein  43.16 
 
 
162 aa  75.5  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.637583  normal  0.317582 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0796  hypothetical protein  36.15 
 
 
144 aa  74.7  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0423  hypothetical protein  38.32 
 
 
158 aa  73.9  0.0000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.237616  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0222  hypothetical protein  34.13 
 
 
240 aa  73.6  0.0000000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00354115  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0535  hypothetical protein  38.73 
 
 
160 aa  73.6  0.000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.498449 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1338  protein of unknown function UPF0066  37.31 
 
 
172 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000553044 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0910  protein of unknown function UPF0066  38.53 
 
 
124 aa  72  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000186983  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1424  hypothetical protein  38.32 
 
 
139 aa  71.6  0.000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.817545  normal  0.0319557 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2812  hypothetical protein  38.57 
 
 
251 aa  71.2  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1254  hypothetical protein  41.28 
 
 
162 aa  71.2  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0270  hypothetical protein  36.64 
 
 
160 aa  70.9  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.460305  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1820  protein of unknown function UPF0066  41.12 
 
 
162 aa  70.5  0.000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.958931  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2886  protein of unknown function UPF0066  35.82 
 
 
196 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0340  hypothetical protein  39.23 
 
 
145 aa  69.7  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.634355  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1277  hypothetical protein  37.3 
 
 
251 aa  68.9  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.241962  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5324  hypothetical protein  34.4 
 
 
162 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3047  hypothetical protein  44.94 
 
 
153 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0597  hypothetical protein  43.96 
 
 
142 aa  67.8  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.662069  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0552  hypothetical protein  36.57 
 
 
162 aa  68.2  0.00000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0281  hypothetical protein  41.75 
 
 
246 aa  67.8  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.236696 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0682  protein of unknown function UPF0066  33.6 
 
 
167 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225791  normal  0.354835 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2088  hypothetical protein  34.09 
 
 
183 aa  67.8  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0270  hypothetical protein  41.75 
 
 
246 aa  67.8  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0768014 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0284  hypothetical protein  41.75 
 
 
235 aa  67.8  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0265  hypothetical protein  41.75 
 
 
246 aa  67.8  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.485834  normal  0.889458 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0265  hypothetical protein  41.75 
 
 
246 aa  67.8  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.222677 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1908  hypothetical protein  43.33 
 
 
131 aa  67.4  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.336096  unclonable  0.00000890078 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2238  protein of unknown function UPF0066  34.03 
 
 
233 aa  67  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2475  protein of unknown function UPF0066  41.3 
 
 
294 aa  67.4  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1581  hypothetical protein  33.57 
 
 
145 aa  66.6  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329162  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0760  hypothetical protein  40.78 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000599137  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0722  protein of unknown function UPF0066  35.58 
 
 
168 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0604494  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0736  hypothetical protein  40.78 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000191321  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3241  hypothetical protein  33.86 
 
 
240 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.488613  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1186  hypothetical protein  34.91 
 
 
235 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3550  protein of unknown function UPF0066  45.56 
 
 
153 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.410233  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1584  protein of unknown function UPF0066  40.82 
 
 
166 aa  65.9  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467198  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3503  protein of unknown function UPF0066  37.5 
 
 
238 aa  65.9  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0149186  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2452  hypothetical protein  40 
 
 
163 aa  65.5  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1908  hypothetical protein  36.7 
 
 
142 aa  65.9  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.117769  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2403  hypothetical protein  44.94 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0181895  normal  0.750924 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1333  hypothetical protein  36.56 
 
 
181 aa  65.1  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.481113  normal  0.0143479 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0453  hypothetical protein  35.71 
 
 
165 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.276022  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3317  hypothetical protein  42.05 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.524788  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1440  hypothetical protein  34.29 
 
 
241 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00194  hypothetical protein  39.81 
 
 
235 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.043388  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3407  protein of unknown function UPF0066  39.81 
 
 
235 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000511594  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0199  hypothetical protein  39.81 
 
 
235 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0201514  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0189  hypothetical protein  39.81 
 
 
235 aa  64.7  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0457219  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0202  hypothetical protein  39.81 
 
 
235 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000993842  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00193  hypothetical protein  39.81 
 
 
235 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0320479  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2344  protein of unknown function UPF0066  35.29 
 
 
231 aa  64.3  0.0000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.183412  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0733  hypothetical protein  36.22 
 
 
235 aa  64.3  0.0000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0409036  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0207  hypothetical protein  38.61 
 
 
235 aa  64.7  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.9755  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0206  hypothetical protein  39.81 
 
 
235 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0519396  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0843  protein of unknown function UPF0066  36.51 
 
 
235 aa  64.3  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000863698  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3346  hypothetical protein  37.5 
 
 
238 aa  64.3  0.0000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00404428  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>