202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2421 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2421  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  334  2.9999999999999997e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.11336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3420  hypothetical protein  58.82 
 
 		 159 aa  198  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.82049  normal  0.0336552 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6838  protein of unknown function UPF0066  59.33 
 
 		 151 aa  189  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4335  putative transcriptional regulator  49.67 
 
 		 156 aa  158  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518263  normal  0.598505 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0302  hypothetical protein  45.33 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2007  hypothetical protein  46 
 
 		 157 aa  141  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2008  hypothetical protein  46 
 
 		 157 aa  141  4e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.120607  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2068  hypothetical protein  45.33 
 
 		 157 aa  141  5e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2224  hypothetical protein  45.33 
 
 		 157 aa  141  5e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2049  hypothetical protein  42.68 
 
 		 157 aa  141  5e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0141829  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3119  hypothetical protein  46 
 
 		 157 aa  141  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.322422  hitchhiker  0.0000104071 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2254  hypothetical protein  45.03 
 
 		 159 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0608346  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2206  hypothetical protein  45.33 
 
 		 157 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.953877  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2336  hypothetical protein  44.67 
 
 		 157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.23741  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2252  hypothetical protein  44.67 
 
 		 157 aa  134  4e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.89628e-27 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1550  protein of unknown function UPF0066  41.06 
 
 		 153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1630  hypothetical protein  39.33 
 
 		 157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00729863  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0545  protein of unknown function UPF0066  40 
 
 		 154 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1303  protein of unknown function UPF0066  42.68 
 
 		 155 aa  101  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3133  putative transcriptional regulator  39.87 
 
 		 155 aa  97.1  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2292  hypothetical protein  38.46 
 
 		 265 aa  86.3  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3384  hypothetical protein  32.09 
 
 		 152 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.208867  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1613  hypothetical protein  35 
 
 		 147 aa  75.1  0.0000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1495  hypothetical protein  31.97 
 
 		 147 aa  73.6  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.524483  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1466  hypothetical protein  36.28 
 
 		 182 aa  73.6  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00269022  normal  0.108849 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3087  hypothetical protein  30.87 
 
 		 160 aa  72  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245386  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0402  hypothetical protein  38.24 
 
 		 182 aa  72.4  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1359  hypothetical protein  33.1 
 
 		 147 aa  71.6  0.000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0258  hypothetical protein  42.86 
 
 		 163 aa  69.7  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1519  hypothetical protein  36.27 
 
 		 182 aa  67  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00122931 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0270  hypothetical protein  37.96 
 
 		 160 aa  67  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.460305  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2088  hypothetical protein  37.04 
 
 		 183 aa  66.2  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1889  protein of unknown function UPF0066  39.56 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1275  hypothetical protein  44.44 
 
 		 160 aa  65.1  0.0000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.147453 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2475  protein of unknown function UPF0066  43.88 
 
 		 294 aa  65.1  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1338  protein of unknown function UPF0066  35.43 
 
 		 172 aa  64.7  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000553044 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2646  hypothetical protein  36.44 
 
 		 167 aa  64.7  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2812  hypothetical protein  38.74 
 
 		 251 aa  64.3  0.0000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1700  hypothetical protein  42.22 
 
 		 160 aa  63.5  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.03303 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0796  hypothetical protein  33.33 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1087  Sodium-transporting two-sector ATPase  32.82 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0423  hypothetical protein  41.11 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.237616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1184  hypothetical protein  33.11 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.545015 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0910  protein of unknown function UPF0066  33.64 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000186983  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2886  protein of unknown function UPF0066  33.86 
 
 		 196 aa  61.2  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1885  hypothetical protein  36.54 
 
 		 167 aa  60.8  0.000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4023  hypothetical protein  38.89 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1388  hypothetical protein  40 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.767988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1722  hypothetical protein  40 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.579056 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0760  hypothetical protein  43.02 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1328  hypothetical protein  26.09 
 
 		 180 aa  59.7  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00949818  decreased coverage  0.00397758 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3346  hypothetical protein  36.84 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00404428  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1424  hypothetical protein  37.04 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.817545  normal  0.0319557 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1705  hypothetical protein  38.89 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.19397 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1277  hypothetical protein  32.81 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.241962  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0222  hypothetical protein  35.05 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00354115  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38460  hypothetical protein  37.78 
 
 		 240 aa  58.5  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3464  hypothetical protein  40.66 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0426  hypothetical protein  40.7 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.088537  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0843  protein of unknown function UPF0066  36.19 
 
 		 235 aa  57.8  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000863698  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2411  hypothetical protein  34.91 
 
 		 182 aa  57.8  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.543009  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3497  protein of unknown function UPF0066  35.16 
 
 		 271 aa  57.8  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2362  regulator protein  35.19 
 
 		 237 aa  57.4  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00194  hypothetical protein  37.89 
 
 		 235 aa  57  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.043388  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3407  protein of unknown function UPF0066  37.89 
 
 		 235 aa  57  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000511594  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1186  hypothetical protein  35.56 
 
 		 235 aa  57  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0207  hypothetical protein  37.89 
 
 		 235 aa  57  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.9755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1333  hypothetical protein  38.95 
 
 		 181 aa  57  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.481113  normal  0.0143479 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0202  hypothetical protein  37.89 
 
 		 235 aa  57  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000993842  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3409  hypothetical protein  37.39 
 
 		 235 aa  57  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0939148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0199  hypothetical protein  37.89 
 
 		 235 aa  57  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0201514  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3317  hypothetical protein  37.5 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.524788  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00193  hypothetical protein  37.89 
 
 		 235 aa  57  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0320479  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1018  protein of unknown function UPF0066  38.3 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1092  hypothetical protein  37.39 
 
 		 235 aa  57  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3464  hypothetical protein  37.89 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0230966  normal  0.865335 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0552  hypothetical protein  38.54 
 
 		 162 aa  57  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1388  hypothetical protein  37.63 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108578  hitchhiker  0.00000533919 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0189  hypothetical protein  37.89 
 
 		 235 aa  57  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0457219  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0206  hypothetical protein  37.89 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0519396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1968  hypothetical protein  37.23 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00329257  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0464  hypothetical protein  32.2 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3757  hypothetical protein  39.32 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000742092  normal  0.0834525 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0110  protein of unknown function UPF0066  38.54 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1039  hypothetical protein  37.39 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0011739  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0733  hypothetical protein  37.89 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0409036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0760  hypothetical protein  41.51 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000599137  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0874  protein of unknown function UPF0066  37.5 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0588086  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1090  vacuolar H+-transporting two-sector ATPase, F subunit  38.89 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0736  hypothetical protein  41.51 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000191321  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3241  hypothetical protein  33.68 
 
 		 240 aa  55.1  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.488613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4020  hypothetical protein  37.78 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012325 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0989  protein of unknown function UPF0066  35.11 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000019612  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10437  predicted protein  34.55 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0024  protein of unknown function UPF0066  37.18 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1581  hypothetical protein  33.82 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329162  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0337  hypothetical protein  30.43 
 
 		 183 aa  54.7  0.0000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0758106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1908  hypothetical protein  38.1 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.117769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0281  hypothetical protein  36.84 
 
 		 246 aa  54.3  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.236696 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0265  hypothetical protein  36.84 
 
 		 246 aa  54.3  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.222677 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>