More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA1202 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA1202  replication protein RepA  100 
 
 		 397 aa  823    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0606445  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4456  cobyrinic acid ac-diamide synthase  95.98 
 
 		 398 aa  768    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1104  replication protein RepA  99.5 
 
 		 397 aa  818    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000233941  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6054  plasmid partitioning protein RepA  72.54 
 
 		 398 aa  587  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8703  plasmid partitioning protein RepA  71.21 
 
 		 403 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4689  plasmid partitioning protein RepA  72.7 
 
 		 402 aa  578  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.10454  normal  0.803552 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4190  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  62.53 
 
 		 400 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6501  plasmid partitioning protein RepA  59.9 
 
 		 404 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8000  replication protein A  62.8 
 
 		 371 aa  494  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9800  replication protein A  57.43 
 
 		 409 aa  484  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9001  replication protein A  58.96 
 
 		 399 aa  472  1e-132  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5377  plasmid partitioning protein RepA  57.58 
 
 		 405 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408708  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5873  plasmid partitioning protein RepA  57.33 
 
 		 405 aa  462  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128849  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4281  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  57.14 
 
 		 407 aa  461  9.999999999999999e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4517  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  59.1 
 
 		 401 aa  449  1e-125  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4789  cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.48 
 
 		 387 aa  449  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.076168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4191  cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.64 
 
 		 420 aa  444  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.901272  normal  0.680764 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4023  ATPase, ParA type  57.47 
 
 		 392 aa  442  1e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.845906  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3276  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  54.55 
 
 		 410 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.572814  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3736  plasmid partitioning protein RepA  55.72 
 
 		 408 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5000  replication protein A  55.78 
 
 		 420 aa  437  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4186  RepA partitioning protein/ATPase, ParA type  56.62 
 
 		 394 aa  436  1e-121  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.04151  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7789  plasmid partitioning protein RepA  53.38 
 
 		 405 aa  431  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.45198  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4354  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  55.7 
 
 		 405 aa  432  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4023  cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.84 
 
 		 395 aa  433  1e-120  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.03067  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4671  cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.61 
 
 		 397 aa  433  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4089  cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.58 
 
 		 398 aa  430  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.563893 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7000  replication protein A  55.09 
 
 		 408 aa  429  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4583  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  56.99 
 
 		 397 aa  431  1e-119  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6490  cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.88 
 
 		 404 aa  428  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305992  normal  0.932958 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7172  plasmid partitioning protein RepA  52.84 
 
 		 398 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.300814 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6017  plasmid partitioning protein RepA  52.32 
 
 		 398 aa  421  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0237613  normal  0.19813 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4822  cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.81 
 
 		 408 aa  424  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0379935  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9501  replication protein A  53.57 
 
 		 405 aa  420  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222629  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6317  plasmid partitioning protein RepA  51.76 
 
 		 405 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5463  plasmid partitioning protein RepA  53.77 
 
 		 397 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.328009 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3561  plasmid partitioning protein RepA  52.59 
 
 		 405 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0949194  normal  0.167025 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5193  plasmid partitioning protein RepA  53.51 
 
 		 397 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0372499  normal  0.16282 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4104  cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.17 
 
 		 397 aa  413  1e-114  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.324179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5555  plasmid partitioning protein RepA  51.51 
 
 		 405 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.661673 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4543  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.87 
 
 		 404 aa  414  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0001  putative replication protein A  50.52 
 
 		 408 aa  389  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.323301 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5480  plasmid partitioning protein RepA  49.48 
 
 		 405 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5615  plasmid partitioning protein RepA  50.65 
 
 		 408 aa  377  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.967203  normal  0.199114 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4571  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.68 
 
 		 404 aa  373  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5912  plasmid partitioning protein RepA  49.35 
 
 		 408 aa  363  2e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.334298  normal  0.0281794 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8198  replication protein A  46.63 
 
 		 403 aa  360  2e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4711  cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.46 
 
 		 404 aa  354  1e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6162  plasmid partitioning protein RepA  46.46 
 
 		 404 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.49965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5173  cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.8 
 
 		 391 aa  315  9.999999999999999e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.381021 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.14 
 
 		 400 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3591  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.47 
 
 		 400 aa  183  4.0000000000000006e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3887  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.24 
 
 		 405 aa  182  9.000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6108  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.7 
 
 		 411 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5035  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.26 
 
 		 399 aa  175  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3406  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30 
 
 		 487 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.798032 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5337  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.73 
 
 		 401 aa  173  5e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.684044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4955  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.6 
 
 		 383 aa  172  7.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4213  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.95 
 
 		 466 aa  169  1e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3692  hypothetical protein  28.3 
 
 		 468 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.576535  normal  0.38395 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1423  ParA family ATPase  27.58 
 
 		 468 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.273364  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3840  ATPase, ParA type  29.63 
 
 		 484 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535208  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4082  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.56 
 
 		 484 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.525863  normal  0.173158 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3773  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.82 
 
 		 469 aa  160  3e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.200831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3493  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.58 
 
 		 468 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.770946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4242  hypothetical protein  29.08 
 
 		 484 aa  159  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.514474 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0067  plasmid partition protein A  29.87 
 
 		 406 aa  159  8e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0078  partitioning protein, ParA  28.95 
 
 		 397 aa  159  9e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.980014  hitchhiker  0.00231687 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7204  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.41 
 
 		 383 aa  159  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.442713 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4265  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.71 
 
 		 462 aa  158  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.383224 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0035  putative protein sopA  29.77 
 
 		 406 aa  157  3e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3855  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.04 
 
 		 463 aa  155  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.743489  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0002  hypothetical protein  30.39 
 
 		 402 aa  153  5e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  decreased coverage  0.00393773  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4322  hypothetical protein  28.88 
 
 		 435 aa  152  7e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.131093 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_2483  RepA partitioning protein/ATPase, ParA type  28.88 
 
 		 435 aa  152  7e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.111676  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3918  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.06 
 
 		 401 aa  150  4e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2913  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.68 
 
 		 434 aa  146  6e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.018827  normal  0.268848 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4693  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.97 
 
 		 397 aa  145  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0183804  normal  0.0975853 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6162  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.45 
 
 		 403 aa  139  7.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4250  plasmid-partitioning protein SopA  31.35 
 
 		 388 aa  139  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.100676 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6575  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.55 
 
 		 402 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.199192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0073  plasmid-partitioning protein SopA  29.61 
 
 		 391 aa  138  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000728582 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0045  plasmid-partitioning protein SopA  29.61 
 
 		 385 aa  138  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.257222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0022  plasmid-partitioning protein SopA  29.61 
 
 		 388 aa  138  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.19504  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0007  plasmid-partitioning protein SopA  29.61 
 
 		 391 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0009  plasmid-partitioning protein SopA  27.34 
 
 		 388 aa  126  9e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0766545 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6315  plasmid partitioning ATPase ParA  30.11 
 
 		 396 aa  125  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1369  putative ParA-like partition protein  29.75 
 
 		 347 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3948  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.86 
 
 		 434 aa  117  3.9999999999999997e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0159296  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0095  plasmid partition protein ParA  26.65 
 
 		 399 aa  113  6e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4546  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.23 
 
 		 399 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.931063  normal  0.514808 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4451  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.23 
 
 		 399 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.375885  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.28 
 
 		 253 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0452  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.76 
 
 		 295 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402264  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4366  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.11 
 
 		 399 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00100758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4177  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.41 
 
 		 387 aa  110  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2339  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.66 
 
 		 261 aa  108  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0896384  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0206  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.18 
 
 		 262 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0134114  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1526  parA family protein  41.92 
 
 		 262 aa  108  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.429591  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1380  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.5 
 
 		 258 aa  107  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.71944  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>