225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA1046 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA1046  hypothetical protein  100 
 
 		 289 aa  596  1e-169  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0984  hypothetical protein  99.31 
 
 		 289 aa  591  1e-168  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.915194  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1336  NAD-dependent epimerase/dehydratase  82.99 
 
 		 289 aa  508  1e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.282172  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0339  hypothetical protein  53.29 
 
 		 298 aa  328  5.0000000000000004e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4318  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.25 
 
 		 289 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3533  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.78 
 
 		 291 aa  314  9e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.39 
 
 		 290 aa  311  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.221687 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3597  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.23 
 
 		 291 aa  308  5e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.76 
 
 		 291 aa  268  5.9999999999999995e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1385  hypothetical protein  48.96 
 
 		 279 aa  265  5e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2793  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.47 
 
 		 279 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0053  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.26 
 
 		 279 aa  260  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3315  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  46.34 
 
 		 291 aa  256  3e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.454656  normal  0.502777 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3291  hypothetical protein  47.57 
 
 		 290 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0273  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.29 
 
 		 282 aa  252  6e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5421  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.18 
 
 		 293 aa  249  3e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.625366  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0978  hypothetical protein  47.24 
 
 		 283 aa  248  6e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479439  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2932  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.88 
 
 		 301 aa  248  6e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.487981  normal  0.740729 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0212  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.64 
 
 		 283 aa  242  7e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0507401  normal  0.496454 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3683  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.15 
 
 		 291 aa  239  4e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.170441 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0402  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.24 
 
 		 287 aa  237  2e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0946501 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2341  hypothetical protein  43.9 
 
 		 289 aa  235  6e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.908657 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.15 
 
 		 285 aa  234  9e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0955775  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1818  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.77 
 
 		 288 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.180368  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2661  hypothetical protein  42.81 
 
 		 289 aa  229  5e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2384  hypothetical protein  42.81 
 
 		 289 aa  228  7e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0313191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3131  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.6 
 
 		 287 aa  224  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.671139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1200  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.25 
 
 		 294 aa  215  9e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3378  hypothetical protein  39.8 
 
 		 308 aa  211  1e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.697299  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0222  hypothetical protein  39.66 
 
 		 288 aa  206  4e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.54 
 
 		 287 aa  196  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.478902 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.02 
 
 		 286 aa  191  1e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  37.5 
 
 		 298 aa  185  9e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3884  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.04 
 
 		 296 aa  184  1.0000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.841243  normal  0.708537 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1356  NAD dependent epimerase/dehydratase  38.73 
 
 		 298 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1005  hypothetical protein  36.97 
 
 		 268 aa  181  8.000000000000001e-45  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0036  hypothetical protein  39.33 
 
 		 317 aa  181  2e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00341  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  37.09 
 
 		 306 aa  180  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  34.35 
 
 		 292 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  35.02 
 
 		 292 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.232249  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0029  hypothetical protein  35.07 
 
 		 292 aa  172  6.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00301  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  36.81 
 
 		 302 aa  170  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.979033  normal  0.104273 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0032  hypothetical protein  36.03 
 
 		 307 aa  166  4e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0474  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.88 
 
 		 262 aa  163  3e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.357708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2753  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.37 
 
 		 260 aa  159  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.699934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0297  hypothetical protein  34.15 
 
 		 272 aa  158  1e-37  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  32.87 
 
 		 293 aa  157  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.755474  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3269  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.71 
 
 		 282 aa  154  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0706  hypothetical protein  34.17 
 
 		 273 aa  154  2e-36  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0540  hypothetical protein  32.53 
 
 		 313 aa  119  6e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2776  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.1 
 
 		 292 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.36 
 
 		 289 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.28982  normal  0.261949 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1723  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.6 
 
 		 298 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1441  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.71 
 
 		 295 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_41088  predicted protein  32.47 
 
 		 344 aa  109  7.000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.309401  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5305  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.33 
 
 		 285 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.622115  normal  0.159546 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0024  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  36.36 
 
 		 289 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.156484  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1198  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.9 
 
 		 299 aa  107  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0547097  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5214  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.33 
 
 		 285 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.304626 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0823  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.66 
 
 		 299 aa  107  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158805 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1346  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.99 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2244  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 301 aa  104  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.46 
 
 		 318 aa  103  4e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.81 
 
 		 291 aa  103  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.29 
 
 		 285 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0296892 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.46 
 
 		 318 aa  102  6e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3050  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.89 
 
 		 297 aa  101  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.861172  normal  0.107005 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48420  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  27.3 
 
 		 286 aa  99.8  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.727055  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0378  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.18 
 
 		 287 aa  99.8  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.151733  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.51 
 
 		 327 aa  99.4  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0566866 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0206  hypothetical protein  28.04 
 
 		 282 aa  99  7e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.72 
 
 		 285 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.181734 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2647  hypothetical protein  29.18 
 
 		 289 aa  97.8  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3719  phosphate ABC transporter permease  26.4 
 
 		 296 aa  96.7  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.93 
 
 		 302 aa  96.7  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2562  putative oxidoreductase protein  29.39 
 
 		 291 aa  96.3  5e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0070  hypothetical protein  27.36 
 
 		 282 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.22 
 
 		 285 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703361 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2224  hypothetical protein  26.2 
 
 		 280 aa  94.4  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0188  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.4 
 
 		 309 aa  93.6  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1294  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 		 313 aa  93.6  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2196  hypothetical protein  26.3 
 
 		 280 aa  92.8  6e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0535  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.37 
 
 		 283 aa  92.4  7e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  0.040657 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1096  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.26 
 
 		 275 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95945 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2045  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.7 
 
 		 277 aa  90.9  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.82 
 
 		 291 aa  91.3  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2193  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.67 
 
 		 313 aa  89.4  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.169967  normal  0.952388 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0902  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.34 
 
 		 301 aa  89  9e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.76 
 
 		 292 aa  88.6  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3723  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.41 
 
 		 291 aa  88.2  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.51364  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0702  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 		 292 aa  88.2  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.94 
 
 		 302 aa  87.4  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1782  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.96 
 
 		 280 aa  87.4  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370358  normal  0.55049 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0280  NAD-dependent epimerase/dehydratase:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.23 
 
 		 296 aa  86.7  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.288428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0793  hypothetical protein  26.73 
 
 		 361 aa  86.3  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.95 
 
 		 307 aa  85.9  8e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2407  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.2 
 
 		 345 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.239653 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2893  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25.89 
 
 		 274 aa  84  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000508224 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0993  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.63 
 
 		 286 aa  82.8  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00435885 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3298  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.17 
 
 		 305 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>