245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0608 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0608  major facilitator family transporter  100 
 
 		 380 aa  736    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3675  major facilitator transporter  92.11 
 
 		 380 aa  649    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491115  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0573  major facilitator family transporter  99.74 
 
 		 380 aa  733    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1753  MFS permease  53.72 
 
 		 394 aa  400  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.221329  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1292  major facilitator superfamily MFS_1  55 
 
 		 394 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0691449  hitchhiker  0.0026922 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0928  major facilitator transporter  53.83 
 
 		 394 aa  389  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.569755 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1384  major facilitator superfamily MFS_1  55.53 
 
 		 394 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.381678 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4418  major facilitator transporter  43.85 
 
 		 407 aa  279  5e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.39928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4927  major facilitator superfamily MFS_1  44.13 
 
 		 389 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.185526 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7414  major facilitator superfamily MFS_1  46.22 
 
 		 388 aa  270  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.085887  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4881  major facilitator superfamily MFS_1  44.13 
 
 		 389 aa  260  2e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.164966  normal  0.758142 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3861  major facilitator transporter  42.47 
 
 		 388 aa  259  8e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6676  major facilitator transporter  47.03 
 
 		 388 aa  256  4e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.518138 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3843  major facilitator superfamily MFS_1  40.98 
 
 		 397 aa  255  9e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0201188 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3025  major facilitator transporter  42.08 
 
 		 375 aa  255  1.0000000000000001e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2825  major facilitator transporter  42.16 
 
 		 413 aa  253  5.000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122972  normal  0.402197 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3575  major facilitator transporter  43.84 
 
 		 395 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1275  major facilitator transporter  35.11 
 
 		 388 aa  180  4e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0932939  normal  0.823078 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1776  major facilitator superfamily MFS_1  34.33 
 
 		 389 aa  179  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.909315  normal  0.0859175 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1953  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 		 402 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1279  major facilitator transporter  36.68 
 
 		 392 aa  169  1e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.077943 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4144  major facilitator transporter  32.04 
 
 		 392 aa  157  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.30134 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0238  major facilitator transporter  30.29 
 
 		 382 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70120  putative MFS transporter  29.87 
 
 		 387 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6086  MFS family transporter  29.87 
 
 		 387 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1091  major facilitator transporter  30.08 
 
 		 376 aa  138  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.776047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5533  major facilitator transporter  28.97 
 
 		 381 aa  136  5e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.316632  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5329  major facilitator transporter  31.81 
 
 		 379 aa  135  9e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783792 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5277  major facilitator family transporter  31.81 
 
 		 379 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3097  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 421 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0288565 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5187  major facilitator transporter  31.81 
 
 		 379 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0310386 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48020  Major facilitator family transporter protein  31.55 
 
 		 377 aa  134  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0193  major facilitator transporter  29.48 
 
 		 379 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000634988 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1710  major facilitator transporter  32.37 
 
 		 393 aa  130  4.0000000000000003e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.69138  normal  0.65846 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4482  major facilitator transporter  30.08 
 
 		 386 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.937677  normal  0.726 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0703  major facilitator transporter  27.32 
 
 		 386 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0720  major facilitator transporter  27.04 
 
 		 386 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0823919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3915  major facilitator transporter  27.04 
 
 		 386 aa  124  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0339  major facilitator transporter  26.76 
 
 		 386 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0792  major facilitator transporter  26.76 
 
 		 386 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0822  major facilitator transporter  26.76 
 
 		 386 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.426653  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2561  major facilitator transporter  26.91 
 
 		 386 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2433  major facilitator transporter  29.38 
 
 		 385 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0171851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0228  major facilitator transporter  29.36 
 
 		 382 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2970  major facilitator transporter  27.18 
 
 		 418 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0783  major facilitator superfamily MFS_1  28.25 
 
 		 386 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.724774  normal  0.275511 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1616  major facilitator transporter  27.18 
 
 		 418 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0546554 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3941  major facilitator superfamily MFS_1  28.9 
 
 		 383 aa  116  5e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0094  hypothetical protein  29.95 
 
 		 382 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3898  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 386 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.506514 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1813  major facilitator superfamiy transporter  26.62 
 
 		 429 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1094  major facilitator transporter  29.07 
 
 		 424 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1849  major facilitator transporter  27.42 
 
 		 418 aa  113  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.513333 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1598  twin-arginine translocation pathway signal  28.16 
 
 		 426 aa  113  6e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.121654  normal  0.207213 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0702  major facilitator family transporter  30.05 
 
 		 385 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0736  major facilitator transporter  30.24 
 
 		 385 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0735  major facilitator transporter  29.72 
 
 		 385 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.762648  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2043  major facilitator family transporter  25.61 
 
 		 397 aa  108  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0613  major facilitator transporter  26.83 
 
 		 416 aa  107  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0957759  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5688  major facilitator superfamily MFS_1  28.94 
 
 		 418 aa  106  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0510347  normal  0.192354 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1718  major facilitator transporter  25 
 
 		 429 aa  105  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.150429 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1399  transporter, putative  27.45 
 
 		 404 aa  103  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.169631  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0226  major facilitator transporter  27.54 
 
 		 446 aa  103  5e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.200681  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2954  major facilitator transporter  27.56 
 
 		 412 aa  103  7e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.126979 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2053  transporter, putative  26.69 
 
 		 389 aa  102  8e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.198674  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0859  major facilitator family transporter  26.69 
 
 		 389 aa  102  8e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.288984  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2691  putative transporter  26.69 
 
 		 389 aa  102  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3172  major facilitator transporter  26.69 
 
 		 389 aa  102  8e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.162648  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1919  major facilitator family transporter  26.69 
 
 		 389 aa  102  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3226  major facilitator transporter  26.4 
 
 		 389 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.232754  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3311  major facilitator family transporter  24.48 
 
 		 398 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3013  major facilitator transporter  27.63 
 
 		 409 aa  99.4  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.382215  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0644  major facilitator transporter  25.84 
 
 		 429 aa  99.4  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3301  major facilitator family transporter  24.48 
 
 		 398 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.47989  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1931  major facilitator family transporter  24.48 
 
 		 398 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.248992  normal  0.489615 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3097  major facilitator family transporter  24.42 
 
 		 398 aa  97.8  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.399635  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3083  multidrug-efflux protein  23.97 
 
 		 398 aa  97.4  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0261519  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2994  multidrug-efflux protein  24.42 
 
 		 398 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0565692  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3342  major facilitator family transporter  24.42 
 
 		 398 aa  97.8  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3319  major facilitator family transporter  24.68 
 
 		 398 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3009  major facilitator transporter  24.23 
 
 		 398 aa  97.4  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.486174  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3305  major facilitator family transporter  23.97 
 
 		 398 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34670  Transmembrane transport protein  25.44 
 
 		 429 aa  94.7  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0421  major facilitator superfamily MFS_1  26.11 
 
 		 381 aa  95.1  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000714938  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4139  major facilitator superfamily MFS_1  27.4 
 
 		 392 aa  94.7  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3119  major facilitator transporter  27.65 
 
 		 420 aa  94  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.485846  normal  0.0384388 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1821  major facilitator transporter  26.22 
 
 		 444 aa  91.7  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000983336  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1427  major facilitator superfamily MFS_1  28.08 
 
 		 430 aa  91.3  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1301  major facilitator superfamily MFS_1  26.76 
 
 		 377 aa  90.9  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1547  major facilitator transporter  24.07 
 
 		 447 aa  90.5  4e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0419  major facilitator superfamily MFS_1  24.42 
 
 		 417 aa  90.9  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2102  major facilitator transporter  24.59 
 
 		 398 aa  90.5  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000106008  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0618  major facilitator family transporter  25.44 
 
 		 418 aa  88.6  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1380  MFS permease  27.05 
 
 		 410 aa  88.6  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897204  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0091  major facilitator transporter  27.95 
 
 		 471 aa  87.4  4e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0619  major facilitator family transporter  25.09 
 
 		 418 aa  87  5e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.425561  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4752  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 388 aa  87  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2660  major facilitator transporter  26.24 
 
 		 417 aa  85.9  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2704  major facilitator superfamily MFS_1  24 
 
 		 388 aa  84.7  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0156259  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3470  major facilitator transporter  22.25 
 
 		 421 aa  84.7  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>