59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0256 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0256  phage integrase family site specific recombinase  100 
 
 		 584 aa  1195    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1478  integrase family protein  31.03 
 
 		 529 aa  232  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0818  integrase family protein  31.15 
 
 		 529 aa  226  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0243  integrase family protein  31.08 
 
 		 509 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1486  integrase domain-containing protein  29.62 
 
 		 515 aa  197  5.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0284  phage integrase  27.56 
 
 		 563 aa  190  7e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7504  integrase family protein  28.83 
 
 		 538 aa  173  6.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1030  integrase family protein  36.27 
 
 		 424 aa  160  5e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5385  integrase family protein  32.62 
 
 		 599 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.449593 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0190  hypothetical protein  32.47 
 
 		 558 aa  143  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4247  integrase family protein  28.27 
 
 		 567 aa  141  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4209  integrase domain-containing protein  27.04 
 
 		 310 aa  109  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.50745 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003902  integrase  26.24 
 
 		 566 aa  107  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0349  integrase family protein  28.08 
 
 		 560 aa  97.8  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4889  integrase family protein  26.79 
 
 		 441 aa  95.1  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.467938  normal  0.240701 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3316  Phage integrase  27.42 
 
 		 566 aa  91.3  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4261  hypothetical protein  24.58 
 
 		 564 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.157557  hitchhiker  0.00000000178827 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0888  integrase family protein  22 
 
 		 687 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00241878  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3007  integrase family protein  33.33 
 
 		 436 aa  71.2  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2367  integrase family protein  26.44 
 
 		 602 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.211693  normal  0.0605063 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5416  integrase family protein  24.12 
 
 		 588 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.659753  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43140  phage integrase-like protein  28.5 
 
 		 602 aa  65.5  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1730  hypothetical protein  23.08 
 
 		 616 aa  65.1  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2130  phage integrase  24.17 
 
 		 563 aa  63.5  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2470  phage integrase  26.12 
 
 		 564 aa  62  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3997  integrase family protein  23.96 
 
 		 581 aa  61.6  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1411  hypothetical protein  24.53 
 
 		 527 aa  61.6  0.00000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.576963 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1333  hypothetical protein  29.45 
 
 		 381 aa  60.5  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0100601  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1749  integrase family protein  28.18 
 
 		 434 aa  59.7  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000110171  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1072  hypothetical protein  23.1 
 
 		 401 aa  58.5  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.175611  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0674  Phage integrase  25.85 
 
 		 386 aa  58.2  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1447  integrase family protein  28.29 
 
 		 430 aa  57  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6546  hypothetical protein  23.53 
 
 		 441 aa  55.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207505  hitchhiker  0.00680658 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3302  putative integrase  29.92 
 
 		 535 aa  55.1  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2641  phage integrase family protein  25.63 
 
 		 426 aa  55.5  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.466932 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1802  phage integrase family protein  20.08 
 
 		 538 aa  54.3  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06825  integrase  20.67 
 
 		 386 aa  54.3  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6757  lambda integrase-like/ DNA breaking-rejoining enzyme, catalytic core  23.91 
 
 		 618 aa  53.9  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3428  integrase family protein  25.62 
 
 		 646 aa  53.5  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0346151  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1344  phage integrase family site specific recombinase  22.76 
 
 		 358 aa  53.1  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2460  phage integrase family protein  25.42 
 
 		 593 aa  53.1  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0793889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1505  phage integrase family protein  27.78 
 
 		 582 aa  52  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0668751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2361  putative integrase/resolvase recombinase protein phage-related integrase  22.66 
 
 		 605 aa  52  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3951  hypothetical protein  23.3 
 
 		 472 aa  51.6  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0236614 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6399  integrase family protein  24.72 
 
 		 509 aa  50.4  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.346311 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4608  site-specific recombinase, phage integrase family  26.49 
 
 		 320 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.764652  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1475  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  26.49 
 
 		 320 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.04346  normal  0.165942 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1799  integrase family protein  23.94 
 
 		 531 aa  49.3  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0370566  normal  0.65053 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4646  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  26.02 
 
 		 317 aa  47.8  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0646  integrase family protein  22.05 
 
 		 456 aa  47.8  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0135958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0868  integrase family protein  25.98 
 
 		 498 aa  47.4  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0954  integrase family protein  29.53 
 
 		 388 aa  47.4  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1508  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  26.7 
 
 		 319 aa  47  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1492  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  25 
 
 		 320 aa  47  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5789  site-specific recombinase, phage integrase family  22.64 
 
 		 556 aa  44.7  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.171322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3526  Phage integrase  29.73 
 
 		 559 aa  44.7  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00532036  hitchhiker  0.00586759 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3046  Phage integrase  23.5 
 
 		 548 aa  44.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1569  hypothetical protein  21.93 
 
 		 348 aa  44.3  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4527  phage integrase family site specific recombinase  22.83 
 
 		 649 aa  43.5  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.259982  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>