More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0102 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0102  membrane protease-like protein  100 
 
 
299 aa  605  9.999999999999999e-173  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0132  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  45.29 
 
 
294 aa  248  1e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000566467  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1007  band 7 protein  43.01 
 
 
327 aa  241  1e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.226884  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0649  membrane protease family stomatin/prohibitin-like protein  43.32 
 
 
300 aa  241  1e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06060  membrane protease subunit, stomatin/prohibitin  42.16 
 
 
378 aa  231  1e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1141  band 7 protein  39.78 
 
 
304 aa  227  2e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03380  hypothetical protein  43.12 
 
 
322 aa  227  2e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06520  membrane protease subunit, stomatin/prohibitin  38.41 
 
 
311 aa  208  9e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000843271  normal  0.35726 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26530  membrane protease subunit, stomatin/prohibitin  37.96 
 
 
304 aa  198  7e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.149484  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19805  predicted protein  36.15 
 
 
279 aa  177  1e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000518484  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49504  predicted protein  37.22 
 
 
297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00000612167  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11673  predicted protein  36.71 
 
 
292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.874367  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0050  hypothetical protein  37.06 
 
 
176 aa  115  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.409998  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2364  band 7 protein  30.4 
 
 
286 aa  110  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1188  band 7 protein  28.29 
 
 
310 aa  106  6e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.283944  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1620  band 7 protein  28.57 
 
 
284 aa  102  8e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000904409  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3110  band 7 protein  24.65 
 
 
282 aa  102  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00709216  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2127  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  28.46 
 
 
286 aa  101  1e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.458205  normal  0.678014 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0260  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.83 
 
 
286 aa  101  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2451  band 7 protein  28.46 
 
 
286 aa  101  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0462  band 7 protein  27.1 
 
 
304 aa  101  1e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0055  hypothetical protein  44.55 
 
 
118 aa  99  9e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0086  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.91 
 
 
281 aa  95.9  8e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0051  band 7 protein  32.1 
 
 
317 aa  95.5  9e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4843  band 7 protein  31.43 
 
 
336 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1364  band 7 protein  28.8 
 
 
309 aa  93.6  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.216615  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4626  band 7 protein  29.11 
 
 
284 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.137042 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19780  SPFH domain, Band 7 family protein  26.74 
 
 
456 aa  92.8  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.295891  hitchhiker  0.000474854 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1423  putative transmembrane protein  28.8 
 
 
308 aa  92.8  7e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.169777  decreased coverage  0.00134863 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0608  band 7 protein  27.27 
 
 
286 aa  92.4  9e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1300  band 7 protein  28.48 
 
 
308 aa  91.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4890  band 7 protein  30.1 
 
 
284 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.152851  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2227  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.69 
 
 
359 aa  91.3  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491741  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3992  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.47 
 
 
296 aa  90.9  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2578  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.46 
 
 
376 aa  90.9  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4834  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  30.1 
 
 
284 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.220458  normal  0.54169 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4712  band 7 protein  30.1 
 
 
284 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.21194 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1179  band 7 protein  26.95 
 
 
403 aa  90.1  4e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.473377  decreased coverage  0.000901683 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0929  Band 7 protein  28.21 
 
 
332 aa  89.7  5e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3244  band 7 protein  25.52 
 
 
369 aa  89.7  6e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2313  band 7 protein  26.39 
 
 
398 aa  88.6  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3018  band 7 protein  25.63 
 
 
369 aa  88.2  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.506434  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0139  band 7 protein  25.78 
 
 
289 aa  87.8  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.889576  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17332  predicted protein  26.44 
 
 
385 aa  87.8  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0626089  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0705  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  31.75 
 
 
309 aa  87  3e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00195694  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004150  stomatin family protein  25 
 
 
305 aa  87.4  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5109  band 7 protein  27.27 
 
 
326 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.000505876  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3684  band 7 protein  25.64 
 
 
327 aa  87  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1359  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  28.27 
 
 
334 aa  86.7  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0198882 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2189  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.73 
 
 
328 aa  86.3  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0577591  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1902  band 7 protein  26.25 
 
 
311 aa  86.3  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2033  band 7 protein  26.25 
 
 
311 aa  86.3  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.295777  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4807  band 7 protein  24.64 
 
 
336 aa  85.9  7e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1446  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.67 
 
 
305 aa  85.9  7e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0162555  normal  0.124024 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01317  hypothetical protein  24.75 
 
 
304 aa  85.9  7e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2064  SPFH domain/Band 7 family protein  27.66 
 
 
322 aa  85.9  8e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101789  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8850  SPFH/band 7 domain protein  24.5 
 
 
356 aa  85.1  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1100  band 7 protein  25.72 
 
 
304 aa  84.7  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3533  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.71 
 
 
316 aa  85.1  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4303  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.61 
 
 
311 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1924  band 7 protein  25.31 
 
 
322 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159861  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14640  band 7 protein  22.95 
 
 
326 aa  84.3  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000590764  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2174  SPFH domain/Band 7 family protein  28.09 
 
 
322 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.268114  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2146  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  28.09 
 
 
322 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0965  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.81 
 
 
304 aa  84.3  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.543775  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3243  SPFH domain/Band 7 family protein  27.23 
 
 
322 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000635475  normal  0.334624 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1928  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  28.09 
 
 
321 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1890  stomatin-like protein  28.09 
 
 
322 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1880  stomatin-like protein  28.09 
 
 
322 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2075  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  28.09 
 
 
321 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3071  band 7 protein  26.21 
 
 
314 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0976397  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3439  band 7 protein  27.84 
 
 
361 aa  84.7  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717632  normal  0.970499 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2106  SPFH domain/Band 7 family protein  28.09 
 
 
321 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0416  band 7 protein  26.09 
 
 
304 aa  84.7  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1560  band 7 protein  28.09 
 
 
322 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.140523  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1572  band 7 protein  25.89 
 
 
307 aa  84.3  0.000000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1429  band 7 protein  26.01 
 
 
394 aa  84.7  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1153  band 7 protein  26.35 
 
 
301 aa  84.7  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.294255  hitchhiker  0.000000366449 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21690  SPFH domain, Band 7 family protein  25.37 
 
 
429 aa  84.7  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.389538  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2048  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26 
 
 
315 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.010338  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0944  band 7 protein  29.81 
 
 
331 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.188485  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1055  band 7 protein  28.57 
 
 
312 aa  84  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5310  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.49 
 
 
311 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0621487  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1455  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  28.7 
 
 
312 aa  83.6  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.362022 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3075  band 7 protein  25.78 
 
 
319 aa  83.6  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0686773 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1533  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.25 
 
 
315 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.32562  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1304  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.25 
 
 
315 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.26064  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2559  membrane protein GNA1220  26.25 
 
 
315 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3279  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.25 
 
 
315 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.571401  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2215  band 7 protein  28.01 
 
 
304 aa  83.2  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00993156  normal  0.0579 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2468  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.25 
 
 
315 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4419  band 7 protein  26.35 
 
 
319 aa  83.2  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2033  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.25 
 
 
315 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.30035  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1701  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.24 
 
 
310 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564295  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2413  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.25 
 
 
315 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764976  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0565  band 7 protein  25.57 
 
 
305 aa  82.4  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0555  band 7 protein  25.57 
 
 
305 aa  82.4  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.857194  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1276  band 7 protein  25.73 
 
 
317 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.887258 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0550  band 7 protein  25.57 
 
 
305 aa  82.4  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.531066  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2809  band 7 protein  26.39 
 
 
293 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.361864  normal  0.174393 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>