More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4659 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4659  MFS family multidrug resistance protein  100 
 
 		 408 aa  764    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4170  major facilitator superfamily MFS_1  59.41 
 
 		 420 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4282  major facilitator superfamily MFS_1  59.41 
 
 		 420 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.522642 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3134  major facilitator superfamily MFS_1  57.49 
 
 		 417 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2600  hypothetical protein  53.33 
 
 		 415 aa  335  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1452  major facilitator family transporter  53.09 
 
 		 415 aa  331  1e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1367  major facilitator family transporter  53.09 
 
 		 415 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1230  putative transporter  54.4 
 
 		 378 aa  323  2e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0199  putative transporter  54.4 
 
 		 378 aa  323  2e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0474  putative transporter  54.4 
 
 		 378 aa  323  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2902  major facilitator superfamily MFS_1  54.36 
 
 		 406 aa  316  5e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21173  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  33.5 
 
 		 417 aa  157  4e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6664  major facilitator transporter  35.19 
 
 		 414 aa  142  9e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2968  major facilitator superfamily MFS_1  33.24 
 
 		 441 aa  129  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0982222 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1403  transporter, putative  60 
 
 		 148 aa  127  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.726678  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1093  major facilitator superfamily MFS_1  32.98 
 
 		 408 aa  126  7e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2303  major facilitator transporter  32.01 
 
 		 435 aa  123  5e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.533597  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  32.9 
 
 		 420 aa  123  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8013  major facilitator transporter  33.16 
 
 		 408 aa  123  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0689  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 439 aa  115  1.0000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2409  major facilitator transporter  33.62 
 
 		 402 aa  114  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0925995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4491  major facilitator superfamily MFS_1  30.47 
 
 		 423 aa  114  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  31.81 
 
 		 427 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0189  major facilitator superfamily MFS_1  28.53 
 
 		 426 aa  113  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0572831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0417  major facilitator transporter  29.56 
 
 		 420 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934872 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1041  major facilitator transporter  31.12 
 
 		 428 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3278  major facilitator transporter  31.17 
 
 		 415 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471566  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  30.25 
 
 		 444 aa  109  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  28.81 
 
 		 430 aa  107  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4496  major facilitator superfamily MFS_1  29.34 
 
 		 450 aa  106  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0239349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4378  major facilitator transporter  29.11 
 
 		 431 aa  106  8e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1193  major facilitator superfamily MFS_1  29.38 
 
 		 412 aa  104  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3246  permease, putative  22.66 
 
 		 417 aa  103  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277963  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6327  major facilitator transporter  32.09 
 
 		 461 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.400788 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0347  major facilitator transporter  29.43 
 
 		 425 aa  100  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2064  major facilitator transporter  31.34 
 
 		 426 aa  99.8  8e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2429  major facilitator superfamily MFS_1  32.84 
 
 		 418 aa  99.8  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945021  normal  0.699098 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3257  tetracycline resistance determinant TetV  22.4 
 
 		 414 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0719  hypothetical protein  34.14 
 
 		 418 aa  99.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.384757  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2987  permease; tetracycline resistance determinant  21.88 
 
 		 414 aa  98.6  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1671  putative transporter  33.61 
 
 		 418 aa  99  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1912  putative transporter  33.61 
 
 		 417 aa  98.6  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0586  putative transporter  33.61 
 
 		 417 aa  98.6  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6539  major facilitator superfamily MFS_1  29.89 
 
 		 415 aa  98.6  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6945  normal  0.0125799 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1705  putative transporter  33.61 
 
 		 418 aa  99  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.167293  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2244  major facilitator transporter  34.77 
 
 		 397 aa  97.8  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2325  major facilitator superfamily permease  34.48 
 
 		 397 aa  97.4  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0197346  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1861  major facilitator transporter  31.42 
 
 		 413 aa  97.1  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051281 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2261  major facilitator superfamily MFS_1  33.13 
 
 		 411 aa  95.9  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0656  major facilitator transporter  32.78 
 
 		 435 aa  94.7  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  25.29 
 
 		 405 aa  94  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  25.29 
 
 		 405 aa  94  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0234  major facilitator superfamily MFS_1  30.11 
 
 		 442 aa  94  5e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  31.37 
 
 		 432 aa  93.6  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6746  hypothetical protein  34.34 
 
 		 427 aa  92.8  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.869375  normal  0.283343 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1471  major facilitator transporter  33.62 
 
 		 420 aa  92.4  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.981301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4269  major facilitator transporter  28.27 
 
 		 436 aa  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.935574 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1438  major facilitator superfamily MFS_1  29.78 
 
 		 416 aa  92  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4101  major facilitator superfamily MFS_1  29.37 
 
 		 432 aa  91.7  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.438153 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5398  major facilitator superfamily MFS_1  28.88 
 
 		 401 aa  91.3  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.154835  normal  0.293524 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  26.13 
 
 		 413 aa  90.5  4e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  26.13 
 
 		 413 aa  90.5  4e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7117  major facilitator superfamily MFS_1  27.5 
 
 		 432 aa  90.5  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3353  major facilitator transporter  25.41 
 
 		 421 aa  90.1  7e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05030  Major Facilitator Superfamily transporter  27.12 
 
 		 414 aa  89.4  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1603  major facilitator superfamily MFS_1  26.94 
 
 		 432 aa  89  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0347546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2820  major facilitator superfamily MFS_1  27.11 
 
 		 421 aa  88.6  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.549151  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4174  major facilitator superfamily MFS_1  27.39 
 
 		 414 aa  88.6  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.176115  normal  0.788258 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6250  major facilitator superfamily MFS_1  30.09 
 
 		 433 aa  87.8  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.220883  normal  0.159364 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1728  major facilitator superfamily MFS_1  28.03 
 
 		 417 aa  85.9  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8802  major facilitator superfamily MFS_1  26.44 
 
 		 405 aa  85.9  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.953446 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4089  major facilitator transporter  30.1 
 
 		 439 aa  85.9  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4165  major facilitator transporter  30.41 
 
 		 416 aa  84  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0148559  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2962  major facilitator superfamily MFS_1  29.4 
 
 		 461 aa  83.6  0.000000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.470581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  25.14 
 
 		 440 aa  79.7  0.00000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5351  major facilitator superfamily MFS_1  29.51 
 
 		 401 aa  79  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.804378  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0885  major facilitator transporter  30.38 
 
 		 415 aa  79.3  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7391  major facilitator transporter  31 
 
 		 434 aa  79  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.671193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3970  protein of unknown function DUF894 DitE  29.41 
 
 		 535 aa  76.3  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4481  major facilitator transporter  32.57 
 
 		 416 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8782  major facilitator superfamily MFS_1  30.45 
 
 		 429 aa  75.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.753165 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  26.3 
 
 		 436 aa  75.5  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3508  protein of unknown function DUF894, DitE  31.64 
 
 		 526 aa  75.5  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5208  major facilitator superfamily MFS_1  30.53 
 
 		 432 aa  74.7  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377398  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  25.31 
 
 		 408 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5006  major facilitator transporter  32.29 
 
 		 416 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.641572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2668  protein of unknown function DUF894, DitE  30.93 
 
 		 541 aa  73.9  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7428  antibiotic efflux protein  27.46 
 
 		 406 aa  73.6  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0620213 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2989  putative permease  22.87 
 
 		 362 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  27.51 
 
 		 420 aa  72.8  0.000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4138  major facilitator superfamily MFS_1  29.39 
 
 		 435 aa  73.2  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.496821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1670  protein of unknown function DUF894 DitE  27.63 
 
 		 532 aa  72.8  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0165754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2302  major facilitator superfamily MFS_1  31.72 
 
 		 390 aa  72.8  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000026904  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  25.85 
 
 		 408 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1012  protein of unknown function DUF894, DitE  31.87 
 
 		 409 aa  72.4  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.171336 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  24.38 
 
 		 408 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0598  major facilitator transporter  25.87 
 
 		 427 aa  71.6  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000170409  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0762  protein of unknown function DUF894, DitE  30.32 
 
 		 560 aa  71.6  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446257 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5163  protein of unknown function DUF894, DitE  31.9 
 
 		 530 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0799644 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2707  macrolide efflux protein  23.61 
 
 		 406 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0968867  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>