More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4294 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4294  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 258 aa  506  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.637324  normal  0.0115964 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5150  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  67.48 
 
 		 257 aa  328  4e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.915192  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3000  ABC transporter related  57.26 
 
 		 258 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0662104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0555  ABC transporter related  57.26 
 
 		 253 aa  273  2.0000000000000002e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.917289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0254  ABC transporter related  51.76 
 
 		 291 aa  272  5.000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.59163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1434  ABC transporter related  62.6 
 
 		 265 aa  271  6e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279643  hitchhiker  0.00000367864 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2720  ABC transporter related  54.51 
 
 		 267 aa  271  7e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16627  normal  0.230507 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0120  ABC transporter related  52.87 
 
 		 278 aa  270  1e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2753  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  55.69 
 
 		 257 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0265  ABC transporter related  54.92 
 
 		 271 aa  270  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.535317  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0381  high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein livF  53.91 
 
 		 274 aa  267  1e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.246654  normal  0.90664 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0219  ABC transporter-related protein  53.63 
 
 		 271 aa  267  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4003  ABC transporter related  52.87 
 
 		 276 aa  266  2e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2274  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  52.05 
 
 		 276 aa  262  4e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0949  ABC transporter related  52.05 
 
 		 276 aa  262  4e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2222  ABC transporter related  52.46 
 
 		 276 aa  261  6e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.801254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43710  ABC transporter, LivF family  56.97 
 
 		 258 aa  261  8.999999999999999e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.236667  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3360  ABC transporter related  51.87 
 
 		 271 aa  257  2e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0053  ABC transporter related  51.03 
 
 		 274 aa  257  2e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2986  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.02 
 
 		 258 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.39811  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5011  ABC transporter related  49.02 
 
 		 270 aa  253  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0456  ABC transporter related  49.79 
 
 		 269 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.201413  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1154  ABC transporter related  49.59 
 
 		 281 aa  251  6e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0465  ABC transporter related  49.38 
 
 		 269 aa  250  1e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.225794 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3803  ABC transporter related  54.62 
 
 		 253 aa  249  3e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00979813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0782  ABC transporter-related protein  52.46 
 
 		 274 aa  249  3e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0599  ABC transporter related  48.36 
 
 		 269 aa  248  5e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7161  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  51.21 
 
 		 266 aa  248  6e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3439  ABC transporter-related protein  47.45 
 
 		 270 aa  248  7e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0295626 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3877  ABC transporter related  54.8 
 
 		 254 aa  248  7e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.221149 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3495  ABC transporter related  54.62 
 
 		 253 aa  248  1e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3612  ABC transporter related  48.76 
 
 		 269 aa  247  1e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.513749 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0564  ABC transporter ATP-binding protein  49.8 
 
 		 267 aa  244  6.999999999999999e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202499  normal  0.0280468 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2548  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP-bincing protein  51.02 
 
 		 264 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0518977  normal  0.559012 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3537  ABC transporter related  47.52 
 
 		 269 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.164335  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5034  ABC transporter related  50.82 
 
 		 277 aa  241  1e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1593  ABC transporter related protein  48.13 
 
 		 263 aa  239  2e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0405  ABC transporter related  47.95 
 
 		 270 aa  232  6e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3838  ABC transporter related  45.08 
 
 		 276 aa  231  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.173965  normal  0.93374 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0627  ABC transporter related  46.47 
 
 		 266 aa  231  1e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000399  ABC transporter substrate-binding protein  44.49 
 
 		 273 aa  228  6e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2356  ABC transporter related  46.69 
 
 		 269 aa  227  1e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0860054  normal  0.372011 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0541  ABC transporter related  47.3 
 
 		 266 aa  227  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2428  ABC transporter related  46.06 
 
 		 263 aa  227  2e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0825  ABC transporter related  46.89 
 
 		 263 aa  226  3e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1565  ABC transporter related  46.5 
 
 		 279 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.770039  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_002936  DET0941  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.89 
 
 		 263 aa  225  5.0000000000000005e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.678413  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3412  putative branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.62 
 
 		 260 aa  225  6e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2286  ABC transporter related  46.89 
 
 		 265 aa  224  9e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1555  ABC transporter related  46.09 
 
 		 279 aa  224  9e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4180  ABC transporter related  46.5 
 
 		 279 aa  224  9e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_812  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  46.06 
 
 		 263 aa  224  1e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3132  ABC transporter-related protein  43.8 
 
 		 272 aa  224  1e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1836  ABC transporter related  45.04 
 
 		 273 aa  224  2e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0163403  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2042  ABC transporter related  48.77 
 
 		 247 aa  223  3e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000858552 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1865  ABC transporter related  46.89 
 
 		 299 aa  223  3e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0464  ABC transporter related protein  47.52 
 
 		 236 aa  222  4e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2185  ABC transporter related protein  48.77 
 
 		 247 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0028  ABC transporter related  45.08 
 
 		 272 aa  221  9e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4576  ABC transporter related  46.09 
 
 		 280 aa  221  9e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5719  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP-bincing protein  46.09 
 
 		 279 aa  221  9e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211944  normal  0.668465 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2606  ABC transporter-related protein  44.21 
 
 		 272 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  45.87 
 
 		 237 aa  221  9.999999999999999e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0301  ABC transporter related  46.91 
 
 		 278 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140254  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4066  ABC transporter related  44.26 
 
 		 272 aa  219  3e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.982341  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2304  ABC transporter related  47.74 
 
 		 279 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0386984 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.72 
 
 		 234 aa  219  5e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  48.76 
 
 		 233 aa  217  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  48.94 
 
 		 247 aa  216  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  46.06 
 
 		 233 aa  215  5e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2931  ABC transporter related  47.33 
 
 		 237 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  48.35 
 
 		 235 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5290  ABC transporter related  43.03 
 
 		 283 aa  213  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  44.86 
 
 		 234 aa  212  4.9999999999999996e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1819  ABC transporter-related protein  46.12 
 
 		 247 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3291  hypothetical protein  52.26 
 
 		 237 aa  211  5.999999999999999e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  46.47 
 
 		 233 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.31 
 
 		 247 aa  211  7.999999999999999e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01989  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  48.97 
 
 		 241 aa  211  9e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.259007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  45.75 
 
 		 239 aa  211  1e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3797  ABC transporter related  49.17 
 
 		 241 aa  210  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.166271 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3910  ABC transporter related  49.17 
 
 		 241 aa  210  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.984929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  47.97 
 
 		 235 aa  209  4e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1547  ABC transporter related protein  46.99 
 
 		 276 aa  208  6e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1675  ABC transporter related  47.88 
 
 		 247 aa  208  7e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0140  ABC transporter-like protein  46.8 
 
 		 272 aa  208  9e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0377793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2125  ABC transporter related  46.31 
 
 		 247 aa  207  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  44.53 
 
 		 239 aa  207  2e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  46.28 
 
 		 234 aa  206  3e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0356  ABC transporter related  47.52 
 
 		 240 aa  206  3e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  46.91 
 
 		 245 aa  206  3e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  48.55 
 
 		 235 aa  206  3e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2953  ABC transporter related  48.35 
 
 		 251 aa  205  5e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.680743  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1126  putative amino acid ATP-binding ABC transporter protein  44.08 
 
 		 237 aa  205  7e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  0.0994747 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3007  ABC transporter-related protein  44.81 
 
 		 258 aa  205  7e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0515162  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  45.04 
 
 		 234 aa  204  8e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  46.91 
 
 		 239 aa  204  2e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5393  ABC transporter related protein  47.62 
 
 		 294 aa  203  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.802054  normal  0.157485 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0518  ABC transporter related  44.31 
 
 		 241 aa  204  2e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0593095  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1795  ABC transporter related  46.12 
 
 		 240 aa  203  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.158403 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>