296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2627 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2627  putative thiamine biosynthesis lipoprotein APBE transmembrane  100 
 
 		 292 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0956093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3433  ApbE family lipoprotein  40.97 
 
 		 287 aa  168  1e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.216077 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0611  thiamine biosynthesis lipoprotein apbE precursor transmembrane  43.9 
 
 		 298 aa  160  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.54431 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1565  ApbE family lipoprotein  34.78 
 
 		 277 aa  152  8e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5381  ApbE family lipoprotein  40.45 
 
 		 282 aa  149  5e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.191484 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1846  ApbE family lipoprotein  40.45 
 
 		 282 aa  149  5e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000243371 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1180  ApbE-like lipoprotein  40.6 
 
 		 286 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1886  ApbE family lipoprotein  40 
 
 		 259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00789462  normal  0.699766 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1557  ApbE family lipoprotein  39.55 
 
 		 259 aa  132  5e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.232124 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1216  thiamine biosynthesis lipoprotein  35.56 
 
 		 336 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0708  thiamine biosynthesis lipoprotein apbE precursor transmembrane  38.83 
 
 		 287 aa  129  6e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.314159  normal  0.115861 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4057  ApbE family lipoprotein  35.49 
 
 		 346 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.807087  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4169  ApbE family lipoprotein  35.49 
 
 		 346 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0035  hypothetical protein  34.47 
 
 		 331 aa  109  6e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0921  ApbE family protein, putative  35.81 
 
 		 282 aa  105  9e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0949043  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1366  thiamine biosynthesis APBE transmembrane protein  36.26 
 
 		 340 aa  104  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3383  ApbE family lipoprotein  36.33 
 
 		 281 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1800  ApbE family lipoprotein  34.53 
 
 		 279 aa  104  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000665627  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0957  ApbE family protein, putative  35.47 
 
 		 282 aa  104  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.76647  normal  0.566735 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  29.38 
 
 		 363 aa  104  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1484  ApbE family lipoprotein  31.37 
 
 		 369 aa  103  4e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0759035 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3569  membrane protein  30.11 
 
 		 336 aa  103  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3580  ApbE family protein, putative  36.23 
 
 		 281 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.169906 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3962  ApbE family lipoprotein  33.56 
 
 		 327 aa  102  6e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.376919  normal  0.0354055 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0552  ApbE family lipoprotein  31.34 
 
 		 351 aa  102  7e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0416  ApbE-like lipoprotein  32.33 
 
 		 277 aa  101  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00253803  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0922  ApbE family protein, putative  35.14 
 
 		 282 aa  101  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0767638  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0906  ApbE family protein, putative  34.72 
 
 		 281 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00687299  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3457  ApbE family protein, putative  34.72 
 
 		 281 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000973965  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4919  membrane-associated ApbE-like lipoprotein  31.89 
 
 		 340 aa  100  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104223 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  27.42 
 
 		 345 aa  100  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0609  ApbE family lipoprotein  33.1 
 
 		 316 aa  99.4  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0104099 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2638  ApbE family lipoprotein  29.37 
 
 		 344 aa  98.6  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.489922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1499  ApbE family lipoprotein  28.51 
 
 		 380 aa  98.2  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152679  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  31.78 
 
 		 336 aa  97.8  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1244  ApbE family lipoprotein  27.24 
 
 		 348 aa  97.8  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462864  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1825  ApbE family lipoprotein  29.11 
 
 		 336 aa  97.1  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2363  putative thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  25.5 
 
 		 343 aa  96.7  4e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4070  ApbE family lipoprotein  24.25 
 
 		 335 aa  96.3  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.785623  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2875  ApbE family lipoprotein  28.83 
 
 		 338 aa  94  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1571  ApbE-like lipoprotein  32.4 
 
 		 331 aa  92.8  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2657  ApbE family protein, putative  31.3 
 
 		 273 aa  92.4  8e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00549568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4038  ApbE family lipoprotein  34.76 
 
 		 386 aa  92  9e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1090  ApbE family protein, putative  33.08 
 
 		 279 aa  91.3  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1063  ApbE family lipoprotein  31 
 
 		 362 aa  90.9  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1142  ApbE family lipoprotein  30.18 
 
 		 362 aa  90.5  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0809507  normal  0.548232 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4467  ApbE family lipoprotein  24.35 
 
 		 309 aa  90.1  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0976  ApbE family lipoprotein  29.97 
 
 		 346 aa  90.1  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.402435  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2292  ApbE family lipoprotein  31.77 
 
 		 365 aa  89.7  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.715586  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2380  ApbE family lipoprotein  31.77 
 
 		 368 aa  89.4  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4425  ApbE family lipoprotein  31.88 
 
 		 309 aa  89.4  7e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.205443  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1595  ApbE/NosX family protein  29.51 
 
 		 344 aa  89  8e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000126725  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0752  ApbE family lipoprotein  28.08 
 
 		 344 aa  88.6  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1874  ApbE family lipoprotein  26.2 
 
 		 317 aa  87.8  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0211225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2739  ApbE family lipoprotein  30.68 
 
 		 321 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  24.16 
 
 		 339 aa  87.8  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1144  ApbE family lipoprotein  28.52 
 
 		 338 aa  87  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.301499  normal  0.219283 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0561  ApbE-like lipoprotein  28.67 
 
 		 348 aa  86.7  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1387  ApbE-like lipoprotein  27.42 
 
 		 350 aa  86.7  4e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.184425  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1342  ApbE family lipoprotein  29.51 
 
 		 344 aa  86.3  5e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000274029  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1597  ApbE family lipoprotein  32.2 
 
 		 305 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.727207 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1835  ApbE family lipoprotein  34.16 
 
 		 310 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1478  thiamine biosynthesis lipoprotein  29.77 
 
 		 357 aa  85.1  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000175227  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1664  ApbE family lipoprotein  23.18 
 
 		 328 aa  84.3  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.517464 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00751  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  26.27 
 
 		 350 aa  84  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.182367  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3767  ApbE family lipoprotein  30.47 
 
 		 417 aa  83.2  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.301189  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1504  ApbE family lipoprotein  25.25 
 
 		 366 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2326  ApbE family protein  29.97 
 
 		 352 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.211712  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  29.27 
 
 		 355 aa  82.4  0.000000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0587  hypotehtical protein  26.49 
 
 		 342 aa  82.4  0.000000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1717  ApbE family lipoprotein  26.17 
 
 		 337 aa  81.6  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117102  normal  0.0292335 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3196  ApbE-like lipoprotein  29.37 
 
 		 344 aa  82  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.764413  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2878  ApbE family lipoprotein  31.58 
 
 		 348 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0536  ApbE family lipoprotein  28.52 
 
 		 345 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2693  ApbE family lipoprotein  25.75 
 
 		 352 aa  81.3  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390804 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2058  ApbE family protein  28.92 
 
 		 370 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.673444  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0930  ApbE family lipoprotein  29.28 
 
 		 348 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.67844  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3557  ApbE family lipoprotein  29.28 
 
 		 348 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0055272  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0996  ApbE family protein  28.92 
 
 		 352 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.167823  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  26.53 
 
 		 353 aa  80.5  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  0.000000000324218 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2113  ApbE family protein  28.92 
 
 		 352 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0226  ApbE family lipoprotein  30.66 
 
 		 305 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.965789  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3360  ApbE family lipoprotein  29.28 
 
 		 348 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00766501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0237  ApbE family lipoprotein  28.52 
 
 		 335 aa  80.5  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3432  ApbE family lipoprotein  29.28 
 
 		 348 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0771789  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0936  ApbE family lipoprotein  30.97 
 
 		 349 aa  80.1  0.00000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0317624  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0980  ApbE family lipoprotein  28.24 
 
 		 374 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.84365  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2411  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE, putative  30.32 
 
 		 310 aa  79.7  0.00000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.39462  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  28.3 
 
 		 350 aa  79.7  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5069  ApbE family lipoprotein  27.96 
 
 		 336 aa  80.1  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1109  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  28.63 
 
 		 347 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1954  ApbE family lipoprotein  28.08 
 
 		 337 aa  79.3  0.00000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.355281  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1878  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  29.41 
 
 		 367 aa  78.2  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1826  ApbE-like lipoprotein  24 
 
 		 351 aa  78.6  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3758  ApbE family lipoprotein  22.3 
 
 		 316 aa  78.6  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.390614  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1239  ApbE family lipoprotein  28.18 
 
 		 349 aa  77.8  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2563  ApbE family lipoprotein  27.03 
 
 		 329 aa  77.8  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5765  ApbE family lipoprotein  23.9 
 
 		 315 aa  77.8  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.734986 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0955  ApbE family lipoprotein  25.86 
 
 		 337 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0462769  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0946  ApbE family lipoprotein  28.24 
 
 		 347 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>