55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1607 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1607  hypothetical protein  100 
 
 		 428 aa  875    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1512  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  27.31 
 
 		 561 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226395 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2653  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  25.87 
 
 		 572 aa  79  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  27.27 
 
 		 999 aa  71.6  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5465  SARP family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 775 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0173  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  28.97 
 
 		 1111 aa  68.9  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0366  transcriptional activator domain protein  24.43 
 
 		 1097 aa  65.9  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.37715 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  28.64 
 
 		 1190 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0495  response regulator receiver and SARP domain protein  27.35 
 
 		 365 aa  63.5  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108458  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0590  transcriptional activator domain protein  24.81 
 
 		 1163 aa  62.8  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.422877 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0253  response regulator receiver and SARP domain protein  27.8 
 
 		 661 aa  62  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.52601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2600  transcriptional activator domain protein  26.51 
 
 		 1108 aa  61.2  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2768  SARP family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 1050 aa  58.9  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3347  transcriptional activator domain-containing protein  27.67 
 
 		 1109 aa  57  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1624  SARP family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 349 aa  57  0.0000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3806  SARP family transcriptional regulator  22.86 
 
 		 423 aa  55.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0119583  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2405  transcriptional activator domain protein  28.24 
 
 		 1025 aa  56.2  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.375799  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2121  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  25.2 
 
 		 333 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.782958 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3322  transcriptional activator domain-containing protein  23.77 
 
 		 1204 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.11039  normal  0.190141 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2470  response regulator receiver and SARP domain protein  23.21 
 
 		 242 aa  55.1  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3289  SARP family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 1116 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16943  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1222  transcriptional activator domain protein  28.38 
 
 		 1018 aa  53.9  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.983461  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3491  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  23.98 
 
 		 360 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3460  transcriptional activator domain-containing protein  23.86 
 
 		 1061 aa  52.8  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1697  SARP family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 349 aa  53.1  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000546308  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1015  SARP family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 1216 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1835  SARP family transcriptional regulator  23.04 
 
 		 343 aa  50.1  0.00009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.338537  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  24.14 
 
 		 1126 aa  49.3  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3421  response regulator receiver and SARP domain protein  27.85 
 
 		 300 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1953  transcriptional activator domain protein  28.1 
 
 		 1083 aa  48.9  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247822 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05450  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  30.63 
 
 		 907 aa  48.9  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1291  transcriptional regulator, SARP family  24.68 
 
 		 1011 aa  48.1  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.475725 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4139  SARP family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 309 aa  48.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  27.03 
 
 		 993 aa  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  25.93 
 
 		 1148 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0060  transcriptional activator domain-containing protein  23.68 
 
 		 1145 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  26.4 
 
 		 921 aa  47.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0284  transcriptional regulator, SARP family  24.67 
 
 		 689 aa  47.8  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3523  transcriptional activator domain  22.26 
 
 		 1055 aa  47  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1211  transcriptional regulator, SARP family  24.9 
 
 		 378 aa  46.6  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705954  normal  0.54501 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1911  transcriptional regulator domain protein  28.06 
 
 		 990 aa  45.8  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.345318  decreased coverage  0.000588756 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3364  transcriptional activator domain  28.77 
 
 		 1118 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  27.64 
 
 		 1067 aa  46.2  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0497  response regulator receiver and SARP domain protein  25.15 
 
 		 363 aa  46.2  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000475999  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2694  response regulator receiver and SARP domain protein  23.04 
 
 		 435 aa  46.6  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3408  transcriptional activator domain protein  28.77 
 
 		 1118 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3701  SARP family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 1064 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000037794 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  26.29 
 
 		 1075 aa  45.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3143  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.37 
 
 		 614 aa  45.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5030  transcriptional activator domain-containing protein  22.71 
 
 		 1056 aa  45.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.311949  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1110  transcriptional activator domain-containing protein  22.39 
 
 		 1082 aa  44.3  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2896  response regulator receiver and SARP domain-containing protein  24.69 
 
 		 268 aa  43.5  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.264133 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4345  transcriptional activator domain-containing protein  20.38 
 
 		 1095 aa  43.5  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00663384 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1118  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.6 
 
 		 614 aa  43.5  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2987  SARP family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 282 aa  43.1  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.232638 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>