More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_44050 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_44050  multidrug efflux pump membrane fusion protein  100 
 
 		 427 aa  855    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5503  RND family efflux transporter MFP subunit  63.87 
 
 		 445 aa  472  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00522591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0647  RND family efflux transporter MFP subunit  63.69 
 
 		 425 aa  472  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1229  RND efflux system membrane fusion protein  64.31 
 
 		 428 aa  461  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0847833 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0849  secretion protein HlyD  59.38 
 
 		 441 aa  444  1e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3063  secretion protein HlyD  54.57 
 
 		 412 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000572272  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4148  efflux transporter, RND family, MFP subunit  53.76 
 
 		 560 aa  395  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1701  secretion protein HlyD  52.41 
 
 		 412 aa  380  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.17328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0410  RND family efflux transporter MFP subunit  49.17 
 
 		 407 aa  358  9.999999999999999e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1074  RND family efflux transporter MFP subunit  49.33 
 
 		 405 aa  352  7e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.151684  normal  0.62301 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2665  RND family efflux transporter MFP subunit  50.56 
 
 		 410 aa  343  4e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1391  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.9 
 
 		 401 aa  317  3e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217202  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0825  RND family efflux transporter MFP subunit  41.95 
 
 		 383 aa  277  2e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.74 
 
 		 405 aa  272  1e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2901  RND family efflux transporter MFP subunit  43.14 
 
 		 394 aa  265  2e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3492  RND family efflux transporter MFP subunit  37.86 
 
 		 405 aa  248  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0689  secretion protein HlyD  36.27 
 
 		 411 aa  241  2e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1458  RND family efflux transporter MFP subunit  40.92 
 
 		 422 aa  237  3e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.235103  hitchhiker  0.000537348 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5940  HlyD family secretion protein  36.19 
 
 		 425 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591185  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2050  secretion protein HlyD  37.87 
 
 		 426 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0569  RND family efflux transporter MFP subunit  40.33 
 
 		 381 aa  234  3e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0680  RND family efflux transporter MFP subunit  36.7 
 
 		 420 aa  233  3e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.557778  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1593  secretion protein HlyD  39.14 
 
 		 400 aa  233  5e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000034507  unclonable  0.000000261884 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2066  secretion protein HlyD  36.34 
 
 		 428 aa  233  7.000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.567226  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6204  RND family efflux transporter MFP subunit  36.34 
 
 		 412 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103192  hitchhiker  0.00610274 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1127  RND family efflux transporter MFP subunit  35.96 
 
 		 395 aa  231  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.295973  unclonable  0.0000000230672 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1018  RND family efflux transporter MFP subunit  37.47 
 
 		 420 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.91 
 
 		 395 aa  231  2e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.279031  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5837  secretion protein HlyD  36.34 
 
 		 412 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.91911  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0547  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.26 
 
 		 410 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0315  RND family efflux transporter MFP subunit  37.47 
 
 		 420 aa  230  3e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0610  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  37.47 
 
 		 420 aa  230  3e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.80065  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0058  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  37.47 
 
 		 420 aa  230  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0523497  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2445  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  37.47 
 
 		 420 aa  230  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0854  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  37.47 
 
 		 420 aa  230  3e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.719076  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0859  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  37.2 
 
 		 420 aa  230  4e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0809  secretion protein HlyD  34.92 
 
 		 392 aa  230  4e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.165865 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0323  RND family efflux transporter MFP subunit  37.4 
 
 		 433 aa  229  7e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1356  AcrA/E family efflux transporter MFP subunit  35.93 
 
 		 407 aa  228  2e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2638  RND family efflux transporter MFP subunit  35.92 
 
 		 424 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1999  secretion protein HlyD  35.92 
 
 		 424 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.931394  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2609  RND family efflux transporter MFP subunit  35.92 
 
 		 424 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0518  secretion protein HlyD  37.77 
 
 		 412 aa  227  4e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0551  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.4 
 
 		 411 aa  226  6e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.856573  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2035  secretion protein HlyD  37.27 
 
 		 430 aa  226  9e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.789986  hitchhiker  0.00327746 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0501  RND family efflux transporter MFP subunit  38.29 
 
 		 430 aa  225  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3207  RND family efflux transporter MFP subunit  34.41 
 
 		 395 aa  224  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.474787  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3067  acriflavine resistance protein A  34.41 
 
 		 395 aa  224  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.018659  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0688  RND family efflux transporter MFP subunit  36.58 
 
 		 431 aa  224  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.921638  normal  0.624256 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2880  multidrug efflux protein  34.41 
 
 		 388 aa  224  2e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.876487 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6607  HlyD family secretion protein  36.49 
 
 		 418 aa  224  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.032922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4070  secretion protein HlyD  37.18 
 
 		 405 aa  224  3e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.409958  normal  0.154431 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6680  RND family efflux transporter MFP subunit  36.24 
 
 		 412 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231623  normal  0.121297 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2238  secretion protein HlyD  36.91 
 
 		 431 aa  223  4e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2656  RND family efflux transporter MFP subunit  37.27 
 
 		 432 aa  223  4e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.444245  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1166  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.97 
 
 		 383 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000507809  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0318  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.61 
 
 		 436 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.199682  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0389  RND family efflux transporter MFP subunit  36.89 
 
 		 434 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2529  RND family efflux transporter MFP subunit  36.73 
 
 		 432 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.210606 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1448  secretion protein HlyD  38.1 
 
 		 376 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3680  secretion protein HlyD family protein  34.43 
 
 		 405 aa  219  6e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3468  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35 
 
 		 393 aa  219  7e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.143252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2607  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.8 
 
 		 422 aa  219  7e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.113369  normal  0.140751 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0828  RND family efflux transporter MFP subunit  34.54 
 
 		 396 aa  219  7e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4831  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.34 
 
 		 424 aa  219  7.999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.630346  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0932  precursor of drug resistance protein  34.54 
 
 		 396 aa  218  1e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0011  acriflavin resistance lipoprotein A precursor  36.73 
 
 		 398 aa  218  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.511373  normal  0.0259122 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0478  RND family efflux transporter MFP subunit  38.22 
 
 		 416 aa  218  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  normal  0.0228976 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2427  RND family efflux transporter MFP subunit  37.5 
 
 		 380 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.412114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0525  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  35.84 
 
 		 442 aa  218  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.88 
 
 		 422 aa  217  2e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00425578 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0692  secretion protein HlyD  36.67 
 
 		 412 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000417324  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05530  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  35.96 
 
 		 383 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4061  RND family efflux transporter MFP subunit  33.43 
 
 		 383 aa  216  5e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000265031  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38395  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  37.77 
 
 		 396 aa  216  8e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0159861 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1455  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.57 
 
 		 403 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3258  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.55 
 
 		 410 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2160  secretion protein HlyD  36.97 
 
 		 391 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.879337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1418  secretion protein HlyD  35.58 
 
 		 400 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3241  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.66 
 
 		 398 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3269  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  37.7 
 
 		 396 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3745  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.6 
 
 		 423 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4472  RND family efflux transporter MFP subunit  34.14 
 
 		 447 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0821721 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1870  secretion protein HlyD  35.14 
 
 		 428 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1070  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.02 
 
 		 397 aa  213  7.999999999999999e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00558937  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2758  secretion protein HlyD  35.38 
 
 		 385 aa  212  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0287  acridine efflux pump  34.99 
 
 		 394 aa  212  1e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3422  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.6 
 
 		 469 aa  212  1e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0910  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.55 
 
 		 393 aa  212  1e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2697  multidrug resistance protein  35.47 
 
 		 400 aa  211  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3440  secretion protein HlyD  36.13 
 
 		 415 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2283  secretion protein HlyD  39.26 
 
 		 386 aa  210  4e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00947214 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0841  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.4 
 
 		 393 aa  210  4e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.85215 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2369  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.15 
 
 		 433 aa  209  7e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.137399  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0331  RND family efflux transporter MFP subunit  33.6 
 
 		 394 aa  208  1e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109026  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4212  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.24 
 
 		 381 aa  208  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4251  RND family efflux transporter MFP subunit  33.24 
 
 		 381 aa  208  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.397426  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3601  secretion protein HlyD  32.98 
 
 		 386 aa  207  2e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.804898  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2894  RND family efflux transporter MFP subunit  31.48 
 
 		 397 aa  208  2e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.781676  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2866  secretion protein HlyD  33.78 
 
 		 400 aa  207  3e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.21396  normal  0.0804187 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>