92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_08780 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_08780  hypothetical protein  100 
 
 		 268 aa  551  1e-156  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299934  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32260  signal peptide protein  59.62 
 
 		 303 aa  352  2.9999999999999997e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3305  MetA-pathway phenol degradation-like protein  58.11 
 
 		 299 aa  338  8e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.853243 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1833  putative signal peptide protein  44.49 
 
 		 297 aa  266  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.714906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3157  meta-pathway phenol degradation-like protein  47.17 
 
 		 295 aa  258  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4501  MetA-pathway phenol degradation-like protein  47.55 
 
 		 295 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2732  hypothetical protein  46.49 
 
 		 301 aa  231  1e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.206778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2982  hypothetical protein  42.8 
 
 		 299 aa  205  6e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000220614  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0883  hypothetical protein  42.69 
 
 		 309 aa  191  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00462477  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30840  hypothetical protein  35.88 
 
 		 294 aa  187  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.856206  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3482  meta-pathway phenol degradation-like protein  36.14 
 
 		 318 aa  184  9e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70300  putative enzyme  37.16 
 
 		 316 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6101  putative lipoprotein  37.16 
 
 		 316 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2955  meta-pathway phenol degradation-like protein  36.47 
 
 		 300 aa  175  8e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2107  putative signal peptide protein  39.19 
 
 		 309 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3168  hypothetical protein  34.52 
 
 		 315 aa  171  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5460  hypothetical protein  34.73 
 
 		 296 aa  169  6e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1838  phenol metabolism protein  35.46 
 
 		 310 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.394031  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1588  hypothetical protein  34.43 
 
 		 320 aa  151  8.999999999999999e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.232894  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2127  phenol degradation-like protein  31.48 
 
 		 307 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03076  putative signal peptide protein  29.17 
 
 		 311 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1931  hypothetical protein  29.79 
 
 		 327 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.903227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6752  hypothetical protein  31.12 
 
 		 337 aa  126  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00609082 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4832  hypothetical protein  30.86 
 
 		 304 aa  126  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.922561 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2845  phenol degradation-like protein  31.6 
 
 		 306 aa  124  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3195  hypothetical protein  31.52 
 
 		 313 aa  124  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4488  protein involved in meta-pathway of phenol degradation  30.6 
 
 		 302 aa  123  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3122  hypothetical protein  31.1 
 
 		 326 aa  121  9e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32640  hypothetical protein  31.84 
 
 		 303 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00101125  hitchhiker  0.00152263 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0164  hypothetical protein  26.39 
 
 		 306 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.433262  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2838  hypothetical protein  30.62 
 
 		 306 aa  118  9e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5144  hypothetical protein  32.03 
 
 		 331 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0531  hypothetical protein  30.31 
 
 		 345 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2763  hypothetical protein  30.34 
 
 		 301 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1272  meta-pathway phenol degradation-like protein  29.81 
 
 		 325 aa  116  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4267  hypothetical protein  32.43 
 
 		 297 aa  116  5e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1191  hypothetical protein  30.07 
 
 		 350 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.161242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0190  hypothetical protein  28.95 
 
 		 307 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33380  hypothetical protein  29.46 
 
 		 306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.72965  normal  0.084061 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6407  hypothetical protein  31.15 
 
 		 312 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.579544 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0355  hypothetical protein  30.88 
 
 		 295 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05192  putative signal peptide protein  29.37 
 
 		 319 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00268581  normal  0.960066 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6119  hypothetical protein  30.77 
 
 		 312 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3274  hypothetical protein  29.46 
 
 		 312 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0193485 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4890  hypothetical protein  29.46 
 
 		 312 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4527  hypothetical protein  31.45 
 
 		 310 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6917  hypothetical protein  29.46 
 
 		 312 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0368  hypothetical protein  29.41 
 
 		 295 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0341  hypothetical protein  29.78 
 
 		 295 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.225999  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1728  hypothetical protein  29.93 
 
 		 334 aa  102  6e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000180313 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2795  hypothetical protein  29.66 
 
 		 327 aa  100  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2732  putative signal peptide  29.89 
 
 		 315 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235663  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7181  protein involved in meta-pathway of phenol degradation-like  27.37 
 
 		 318 aa  96.3  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0516478 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6305  protein involved in MetA-pathway of phenol degradation-like protein  28.72 
 
 		 319 aa  96.3  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.477506  normal  0.244867 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6009  protein involved in MetA-pathway of phenol degradation-like protein  28.72 
 
 		 319 aa  95.9  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2404  hypothetical protein  25.87 
 
 		 329 aa  95.1  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.147622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3413  hypothetical protein  28.47 
 
 		 328 aa  92.8  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.591496  normal  0.708141 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6775  protein involved in MetA-pathway of phenol degradation-like protein  27.02 
 
 		 318 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.617497 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5489  protein involved in MetA-pathway of phenol degradation-like  27.02 
 
 		 318 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2203  hypothetical protein  26.71 
 
 		 349 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2098  hypothetical protein  27.88 
 
 		 269 aa  91.3  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.591796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0598  hypothetical protein  33.78 
 
 		 364 aa  90.5  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.161242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6363  MetA-pathway-like protein  26.67 
 
 		 318 aa  90.1  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8068  hypothetical protein  26.86 
 
 		 341 aa  87  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2388  hypothetical protein  27.44 
 
 		 310 aa  83.6  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.806824 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0608  hypothetical protein  23.68 
 
 		 330 aa  82.8  0.000000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2975  hypothetical protein  25.27 
 
 		 331 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7148  protein involved in meta-pathway of phenol degradation  26.22 
 
 		 304 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00536985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5224  hypothetical protein  29.53 
 
 		 322 aa  76.6  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.347235 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4536  phenol degradation protein  31.11 
 
 		 318 aa  75.5  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375555  normal  0.225823 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1676  hypothetical protein  30.6 
 
 		 328 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.275603  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0092  hypothetical protein  30.16 
 
 		 334 aa  72  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.672977  normal  0.778879 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0295  hypothetical protein  25.59 
 
 		 256 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000520717 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1768  meta-pathway phenol degradation-like protein  23.86 
 
 		 316 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3846  hypothetical protein  28.74 
 
 		 334 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3839  regulation of phenolics degradation protein  25.56 
 
 		 298 aa  67.4  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1956  hypothetical protein  26.09 
 
 		 322 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.235366  hitchhiker  0.00028826 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1047  MetA-pathway of phenol degradation-like protein  22.06 
 
 		 307 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.379936 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1377  MetA-pathway phenol degradation-like protein  23.94 
 
 		 324 aa  61.2  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.351343  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6970  hypothetical protein  28.57 
 
 		 340 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000157214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2000  putative signal peptide  26.17 
 
 		 291 aa  58.5  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5600  hypothetical protein  23 
 
 		 383 aa  52.4  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00091534  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0005  hypothetical protein  25.77 
 
 		 295 aa  52  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.489422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0632  meta-pathway phenol degradation-like protein  27.68 
 
 		 316 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1376  meta-pathway phenol degradation protein  25.97 
 
 		 309 aa  48.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2725  meta-pathway phenol degradation-like protein  27.67 
 
 		 288 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3232  hypothetical protein  28.57 
 
 		 297 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.389417  normal  0.383811 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4285  hypothetical protein  28.57 
 
 		 298 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46217  normal  0.974652 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4081  hypothetical protein  28.57 
 
 		 298 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1158  putative signal peptide  29.23 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2099  Protein involved in meta-pathway of phenol degradation  24.39 
 
 		 319 aa  43.9  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119201  normal  0.245606 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1468  hypothetical protein  22.16 
 
 		 296 aa  43.1  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.649512  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>