61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2404 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2404  hypothetical protein  100 
 
 		 329 aa  662    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.147622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0531  hypothetical protein  52.23 
 
 		 345 aa  340  1e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6752  hypothetical protein  50.61 
 
 		 337 aa  340  2e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00609082 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1191  hypothetical protein  54.25 
 
 		 350 aa  338  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.161242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8068  hypothetical protein  45.45 
 
 		 341 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3413  hypothetical protein  44.67 
 
 		 328 aa  248  1e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.591496  normal  0.708141 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5144  hypothetical protein  39.62 
 
 		 331 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3122  hypothetical protein  35.93 
 
 		 326 aa  189  7e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2795  hypothetical protein  33.33 
 
 		 327 aa  158  9e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2203  hypothetical protein  32.09 
 
 		 349 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0598  hypothetical protein  33.47 
 
 		 364 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.161242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2975  hypothetical protein  29.23 
 
 		 331 aa  127  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3305  MetA-pathway phenol degradation-like protein  26.84 
 
 		 299 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.853243 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08780  hypothetical protein  25.87 
 
 		 268 aa  95.1  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299934  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2732  hypothetical protein  27.53 
 
 		 301 aa  95.1  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.206778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3157  meta-pathway phenol degradation-like protein  28.12 
 
 		 295 aa  92  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2982  hypothetical protein  28.43 
 
 		 299 aa  87.8  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000220614  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4501  MetA-pathway phenol degradation-like protein  27.44 
 
 		 295 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2107  putative signal peptide protein  27.17 
 
 		 309 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3482  meta-pathway phenol degradation-like protein  27.39 
 
 		 318 aa  78.6  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0883  hypothetical protein  26.92 
 
 		 309 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00462477  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6970  hypothetical protein  28.57 
 
 		 340 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000157214  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30840  hypothetical protein  24.61 
 
 		 294 aa  70.9  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.856206  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2955  meta-pathway phenol degradation-like protein  26.83 
 
 		 300 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6101  putative lipoprotein  25.42 
 
 		 316 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70300  putative enzyme  25.42 
 
 		 316 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4536  phenol degradation protein  28.01 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375555  normal  0.225823 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1676  hypothetical protein  27.89 
 
 		 328 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.275603  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5224  hypothetical protein  28.32 
 
 		 322 aa  66.6  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.347235 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5460  hypothetical protein  24.3 
 
 		 296 aa  65.1  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32260  signal peptide protein  22.68 
 
 		 303 aa  62.8  0.000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1833  putative signal peptide protein  24.91 
 
 		 297 aa  62  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.714906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3168  hypothetical protein  30.33 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1588  hypothetical protein  29.31 
 
 		 320 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.232894  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0190  hypothetical protein  26.92 
 
 		 307 aa  60.1  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2127  phenol degradation-like protein  23.79 
 
 		 307 aa  57.4  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03076  putative signal peptide protein  29.6 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2388  hypothetical protein  32.03 
 
 		 310 aa  55.8  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.806824 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1377  MetA-pathway phenol degradation-like protein  25.73 
 
 		 324 aa  55.5  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.351343  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0092  hypothetical protein  25.51 
 
 		 334 aa  53.9  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.672977  normal  0.778879 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0632  meta-pathway phenol degradation-like protein  23.36 
 
 		 316 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4267  hypothetical protein  34.91 
 
 		 297 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4527  hypothetical protein  25.59 
 
 		 310 aa  52  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6407  hypothetical protein  28.12 
 
 		 312 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.579544 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1838  phenol metabolism protein  22.9 
 
 		 310 aa  50.8  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.394031  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3846  hypothetical protein  24.03 
 
 		 334 aa  50.4  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2845  phenol degradation-like protein  23.88 
 
 		 306 aa  49.7  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1417  hypothetical protein  24.39 
 
 		 305 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.344999 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6119  hypothetical protein  27.6 
 
 		 312 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1256  hypothetical protein  24.39 
 
 		 305 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.168978 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1931  hypothetical protein  25.87 
 
 		 327 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.903227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1376  meta-pathway phenol degradation protein  23.02 
 
 		 309 aa  48.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3839  regulation of phenolics degradation protein  23.17 
 
 		 298 aa  47.8  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6917  hypothetical protein  27.23 
 
 		 312 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0341  hypothetical protein  23.91 
 
 		 295 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.225999  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4488  protein involved in meta-pathway of phenol degradation  23.91 
 
 		 302 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3274  hypothetical protein  26.79 
 
 		 312 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0193485 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4890  hypothetical protein  26.79 
 
 		 312 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0355  hypothetical protein  23.57 
 
 		 295 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2838  hypothetical protein  24.09 
 
 		 306 aa  43.1  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3195  hypothetical protein  27.47 
 
 		 313 aa  42.7  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>