83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4501 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4501  MetA-pathway phenol degradation-like protein  100 
 
 		 295 aa  603  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3157  meta-pathway phenol degradation-like protein  91.19 
 
 		 295 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3305  MetA-pathway phenol degradation-like protein  55.82 
 
 		 299 aa  341  9e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.853243 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32260  signal peptide protein  46.76 
 
 		 303 aa  262  4.999999999999999e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1833  putative signal peptide protein  47.48 
 
 		 297 aa  259  4e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.714906  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08780  hypothetical protein  47.55 
 
 		 268 aa  252  5.000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299934  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3482  meta-pathway phenol degradation-like protein  43.39 
 
 		 318 aa  228  9e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2982  hypothetical protein  41.84 
 
 		 299 aa  207  1e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000220614  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2732  hypothetical protein  43.51 
 
 		 301 aa  207  2e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.206778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2955  meta-pathway phenol degradation-like protein  41.43 
 
 		 300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148613  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30840  hypothetical protein  38.14 
 
 		 294 aa  190  2.9999999999999997e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.856206  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2107  putative signal peptide protein  39.53 
 
 		 309 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5460  hypothetical protein  34.35 
 
 		 296 aa  168  9e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0883  hypothetical protein  37.88 
 
 		 309 aa  168  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00462477  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1588  hypothetical protein  36.49 
 
 		 320 aa  155  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.232894  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4832  hypothetical protein  34.05 
 
 		 304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.922561 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70300  putative enzyme  31.05 
 
 		 316 aa  142  6e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3168  hypothetical protein  30.49 
 
 		 315 aa  140  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6101  putative lipoprotein  31.23 
 
 		 316 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4488  protein involved in meta-pathway of phenol degradation  34.43 
 
 		 302 aa  139  6e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03076  putative signal peptide protein  31.67 
 
 		 311 aa  137  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1838  phenol metabolism protein  33.23 
 
 		 310 aa  135  8e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.394031  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2127  phenol degradation-like protein  28.06 
 
 		 307 aa  124  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1931  hypothetical protein  29.17 
 
 		 327 aa  120  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.903227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0164  hypothetical protein  29.96 
 
 		 306 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.433262  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0355  hypothetical protein  31.19 
 
 		 295 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0341  hypothetical protein  30.71 
 
 		 295 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.225999  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0368  hypothetical protein  29.79 
 
 		 295 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4267  hypothetical protein  33.73 
 
 		 297 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2845  phenol degradation-like protein  26.52 
 
 		 306 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5144  hypothetical protein  31.21 
 
 		 331 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6752  hypothetical protein  31.08 
 
 		 337 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00609082 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3195  hypothetical protein  30.25 
 
 		 313 aa  107  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6407  hypothetical protein  30.74 
 
 		 312 aa  105  9e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.579544 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1272  meta-pathway phenol degradation-like protein  30.35 
 
 		 325 aa  103  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4890  hypothetical protein  30.74 
 
 		 312 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3274  hypothetical protein  30.74 
 
 		 312 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0193485 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6119  hypothetical protein  30.41 
 
 		 312 aa  102  9e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6917  hypothetical protein  31.68 
 
 		 312 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1728  hypothetical protein  30 
 
 		 334 aa  97.1  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000180313 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7181  protein involved in meta-pathway of phenol degradation-like  27.94 
 
 		 318 aa  96.7  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0516478 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0190  hypothetical protein  26.09 
 
 		 307 aa  95.1  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6009  protein involved in MetA-pathway of phenol degradation-like protein  28.1 
 
 		 319 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4527  hypothetical protein  29.72 
 
 		 310 aa  94  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6305  protein involved in MetA-pathway of phenol degradation-like protein  28.1 
 
 		 319 aa  94  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.477506  normal  0.244867 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6363  MetA-pathway-like protein  27.94 
 
 		 318 aa  93.6  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5489  protein involved in MetA-pathway of phenol degradation-like  27.94 
 
 		 318 aa  93.6  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6775  protein involved in MetA-pathway of phenol degradation-like protein  27.94 
 
 		 318 aa  93.6  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.617497 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0531  hypothetical protein  30.36 
 
 		 345 aa  92.4  7e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2388  hypothetical protein  25.5 
 
 		 310 aa  87.4  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.806824 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2404  hypothetical protein  27.44 
 
 		 329 aa  87.4  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.147622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2732  putative signal peptide  25.93 
 
 		 315 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235663  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2795  hypothetical protein  31.13 
 
 		 327 aa  85.5  9e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8068  hypothetical protein  29.8 
 
 		 341 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3413  hypothetical protein  29.15 
 
 		 328 aa  82  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.591496  normal  0.708141 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3122  hypothetical protein  28.48 
 
 		 326 aa  82  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05192  putative signal peptide protein  25.37 
 
 		 319 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00268581  normal  0.960066 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4536  phenol degradation protein  33.9 
 
 		 318 aa  80.5  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375555  normal  0.225823 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1676  hypothetical protein  30.08 
 
 		 328 aa  80.1  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.275603  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1047  MetA-pathway of phenol degradation-like protein  25.51 
 
 		 307 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.379936 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2975  hypothetical protein  34.44 
 
 		 331 aa  79  0.00000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2098  hypothetical protein  28.94 
 
 		 269 aa  79  0.00000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.591796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1191  hypothetical protein  29.49 
 
 		 350 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.161242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2838  hypothetical protein  28.19 
 
 		 306 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32640  hypothetical protein  27.03 
 
 		 303 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00101125  hitchhiker  0.00152263 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3839  regulation of phenolics degradation protein  27.53 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5224  hypothetical protein  31.07 
 
 		 322 aa  73.9  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.347235 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33380  hypothetical protein  26.87 
 
 		 306 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.72965  normal  0.084061 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6970  hypothetical protein  33.54 
 
 		 340 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000157214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2763  hypothetical protein  25.48 
 
 		 301 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0632  meta-pathway phenol degradation-like protein  26.44 
 
 		 316 aa  68.9  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0608  hypothetical protein  26.1 
 
 		 330 aa  68.9  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1377  MetA-pathway phenol degradation-like protein  28.57 
 
 		 324 aa  67.4  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.351343  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0598  hypothetical protein  36.11 
 
 		 364 aa  65.5  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.161242  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1956  hypothetical protein  32.19 
 
 		 322 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.235366  hitchhiker  0.00028826 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2203  hypothetical protein  28.24 
 
 		 349 aa  63.5  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0295  hypothetical protein  25.22 
 
 		 256 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000520717 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0092  hypothetical protein  29.78 
 
 		 334 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.672977  normal  0.778879 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7148  protein involved in meta-pathway of phenol degradation  24.76 
 
 		 304 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00536985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3846  hypothetical protein  27.92 
 
 		 334 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1768  meta-pathway phenol degradation-like protein  22.15 
 
 		 316 aa  47.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2000  putative signal peptide  25 
 
 		 291 aa  43.5  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1088  hypothetical protein  28.97 
 
 		 285 aa  42.7  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.454901 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>