79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4488 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4488  protein involved in meta-pathway of phenol degradation  100 
 
 		 302 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2955  meta-pathway phenol degradation-like protein  36.93 
 
 		 300 aa  179  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1588  hypothetical protein  33.91 
 
 		 320 aa  152  7e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.232894  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2982  hypothetical protein  32.19 
 
 		 299 aa  150  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000220614  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5460  hypothetical protein  30.77 
 
 		 296 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3305  MetA-pathway phenol degradation-like protein  32.21 
 
 		 299 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.853243 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30840  hypothetical protein  33.99 
 
 		 294 aa  142  6e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.856206  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4501  MetA-pathway phenol degradation-like protein  34.43 
 
 		 295 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3157  meta-pathway phenol degradation-like protein  33.22 
 
 		 295 aa  140  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2732  hypothetical protein  34.29 
 
 		 301 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.206778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3168  hypothetical protein  31.92 
 
 		 315 aa  132  9e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08780  hypothetical protein  30.6 
 
 		 268 aa  130  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299934  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6101  putative lipoprotein  35.29 
 
 		 316 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3482  meta-pathway phenol degradation-like protein  29.29 
 
 		 318 aa  127  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70300  putative enzyme  34.8 
 
 		 316 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0883  hypothetical protein  31.51 
 
 		 309 aa  125  7e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00462477  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1931  hypothetical protein  31.83 
 
 		 327 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.903227  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32260  signal peptide protein  27.36 
 
 		 303 aa  115  8.999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1838  phenol metabolism protein  29.05 
 
 		 310 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.394031  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0164  hypothetical protein  27.74 
 
 		 306 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.433262  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1833  putative signal peptide protein  29.8 
 
 		 297 aa  102  8e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.714906  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03076  putative signal peptide protein  28.96 
 
 		 311 aa  99.8  6e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6119  hypothetical protein  28.67 
 
 		 312 aa  94  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2107  putative signal peptide protein  28.71 
 
 		 309 aa  92.8  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6407  hypothetical protein  28.67 
 
 		 312 aa  92.8  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.579544 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3846  hypothetical protein  29.75 
 
 		 334 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0092  hypothetical protein  30.29 
 
 		 334 aa  90.9  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.672977  normal  0.778879 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4832  hypothetical protein  28.62 
 
 		 304 aa  90.5  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.922561 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2732  putative signal peptide  26.3 
 
 		 315 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235663  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0190  hypothetical protein  26.96 
 
 		 307 aa  88.6  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4890  hypothetical protein  27.67 
 
 		 312 aa  86.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3274  hypothetical protein  27.67 
 
 		 312 aa  86.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0193485 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6917  hypothetical protein  27.67 
 
 		 312 aa  85.9  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0355  hypothetical protein  28.48 
 
 		 295 aa  85.9  8e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6009  protein involved in MetA-pathway of phenol degradation-like protein  27.19 
 
 		 319 aa  85.5  9e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3195  hypothetical protein  29.37 
 
 		 313 aa  85.5  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6305  protein involved in MetA-pathway of phenol degradation-like protein  27.19 
 
 		 319 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.477506  normal  0.244867 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33380  hypothetical protein  28.93 
 
 		 306 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.72965  normal  0.084061 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0341  hypothetical protein  27.62 
 
 		 295 aa  84  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.225999  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2838  hypothetical protein  28.1 
 
 		 306 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7181  protein involved in meta-pathway of phenol degradation-like  27.73 
 
 		 318 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0516478 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0368  hypothetical protein  27.33 
 
 		 295 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32640  hypothetical protein  27.52 
 
 		 303 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00101125  hitchhiker  0.00152263 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1728  hypothetical protein  28.26 
 
 		 334 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000180313 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2763  hypothetical protein  26.61 
 
 		 301 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2975  hypothetical protein  32.04 
 
 		 331 aa  79.7  0.00000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1272  meta-pathway phenol degradation-like protein  26.3 
 
 		 325 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6775  protein involved in MetA-pathway of phenol degradation-like protein  27.1 
 
 		 318 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.617497 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5489  protein involved in MetA-pathway of phenol degradation-like  27.1 
 
 		 318 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6363  MetA-pathway-like protein  27.1 
 
 		 318 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4527  hypothetical protein  26.56 
 
 		 310 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2795  hypothetical protein  26.28 
 
 		 327 aa  74.3  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0608  hypothetical protein  25.43 
 
 		 330 aa  74.3  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5144  hypothetical protein  25.58 
 
 		 331 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0598  hypothetical protein  33.77 
 
 		 364 aa  66.2  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.161242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2388  hypothetical protein  23.23 
 
 		 310 aa  65.9  0.0000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.806824 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2098  hypothetical protein  24.71 
 
 		 269 aa  63.9  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.591796  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2845  phenol degradation-like protein  24.36 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05192  putative signal peptide protein  27.63 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00268581  normal  0.960066 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1676  hypothetical protein  25.17 
 
 		 328 aa  63.2  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.275603  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2127  phenol degradation-like protein  24 
 
 		 307 aa  62.8  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7148  protein involved in meta-pathway of phenol degradation  32.05 
 
 		 304 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00536985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3413  hypothetical protein  24.68 
 
 		 328 aa  61.2  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.591496  normal  0.708141 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1047  MetA-pathway of phenol degradation-like protein  23.88 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.379936 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1191  hypothetical protein  31.37 
 
 		 350 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.161242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4267  hypothetical protein  28.57 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6970  hypothetical protein  26.67 
 
 		 340 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000157214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3122  hypothetical protein  25.72 
 
 		 326 aa  59.3  0.00000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4536  phenol degradation protein  25.71 
 
 		 318 aa  59.3  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375555  normal  0.225823 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1956  hypothetical protein  24.72 
 
 		 322 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.235366  hitchhiker  0.00028826 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2203  hypothetical protein  30 
 
 		 349 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6752  hypothetical protein  25.15 
 
 		 337 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00609082 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8068  hypothetical protein  24.51 
 
 		 341 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0531  hypothetical protein  24.46 
 
 		 345 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0295  hypothetical protein  25.74 
 
 		 256 aa  49.7  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000520717 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2404  hypothetical protein  23.91 
 
 		 329 aa  49.3  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.147622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1376  meta-pathway phenol degradation protein  23.02 
 
 		 309 aa  47.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1377  MetA-pathway phenol degradation-like protein  25.53 
 
 		 324 aa  48.5  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.351343  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5224  hypothetical protein  25 
 
 		 322 aa  46.6  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.347235 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>