63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6752 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6752  hypothetical protein  100 
 
 		 337 aa  677    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00609082 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0531  hypothetical protein  71.77 
 
 		 345 aa  503  1e-141  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1191  hypothetical protein  65.57 
 
 		 350 aa  434  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.161242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2404  hypothetical protein  50.61 
 
 		 329 aa  340  2e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.147622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8068  hypothetical protein  53.14 
 
 		 341 aa  330  1e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3413  hypothetical protein  49.31 
 
 		 328 aa  291  8e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.591496  normal  0.708141 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5144  hypothetical protein  45.51 
 
 		 331 aa  273  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3122  hypothetical protein  42.42 
 
 		 326 aa  230  3e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2795  hypothetical protein  38.2 
 
 		 327 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2203  hypothetical protein  33.84 
 
 		 349 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2975  hypothetical protein  31.56 
 
 		 331 aa  146  6e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0598  hypothetical protein  33.64 
 
 		 364 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.161242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2732  hypothetical protein  33.13 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.206778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3305  MetA-pathway phenol degradation-like protein  30.67 
 
 		 299 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.853243 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08780  hypothetical protein  31.12 
 
 		 268 aa  126  5e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299934  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2982  hypothetical protein  30 
 
 		 299 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000220614  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3157  meta-pathway phenol degradation-like protein  30.91 
 
 		 295 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30840  hypothetical protein  30.48 
 
 		 294 aa  110  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.856206  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4501  MetA-pathway phenol degradation-like protein  31.08 
 
 		 295 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2955  meta-pathway phenol degradation-like protein  30.28 
 
 		 300 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1588  hypothetical protein  30.41 
 
 		 320 aa  96.7  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.232894  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3482  meta-pathway phenol degradation-like protein  29.06 
 
 		 318 aa  95.9  9e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0883  hypothetical protein  29.45 
 
 		 309 aa  94  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00462477  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1833  putative signal peptide protein  27.86 
 
 		 297 aa  93.2  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.714906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6101  putative lipoprotein  30.65 
 
 		 316 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70300  putative enzyme  28.42 
 
 		 316 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2107  putative signal peptide protein  28.88 
 
 		 309 aa  88.2  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5460  hypothetical protein  29.14 
 
 		 296 aa  87  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32260  signal peptide protein  27.52 
 
 		 303 aa  85.9  8e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3168  hypothetical protein  28.99 
 
 		 315 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4536  phenol degradation protein  29.78 
 
 		 318 aa  79.3  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375555  normal  0.225823 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1838  phenol metabolism protein  26.6 
 
 		 310 aa  76.6  0.0000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.394031  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6970  hypothetical protein  29.97 
 
 		 340 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000157214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5224  hypothetical protein  35.33 
 
 		 322 aa  72.4  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.347235 
 
 
-
 
NC_003296  RS03076  putative signal peptide protein  29.96 
 
 		 311 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1676  hypothetical protein  32.28 
 
 		 328 aa  69.3  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.275603  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0092  hypothetical protein  27.56 
 
 		 334 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.672977  normal  0.778879 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6407  hypothetical protein  27.3 
 
 		 312 aa  67  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.579544 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3846  hypothetical protein  27.24 
 
 		 334 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6119  hypothetical protein  26.98 
 
 		 312 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2388  hypothetical protein  34.31 
 
 		 310 aa  64.3  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.806824 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0190  hypothetical protein  29.13 
 
 		 307 aa  63.5  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4527  hypothetical protein  31.64 
 
 		 310 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6917  hypothetical protein  27.6 
 
 		 312 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4267  hypothetical protein  31.97 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3195  hypothetical protein  27.83 
 
 		 313 aa  58.5  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3274  hypothetical protein  27.24 
 
 		 312 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0193485 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4890  hypothetical protein  27.24 
 
 		 312 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2127  phenol degradation-like protein  23.05 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1728  hypothetical protein  26.32 
 
 		 334 aa  55.1  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000180313 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4488  protein involved in meta-pathway of phenol degradation  24.92 
 
 		 302 aa  55.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0341  hypothetical protein  23.57 
 
 		 295 aa  53.5  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.225999  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2845  phenol degradation-like protein  23.97 
 
 		 306 aa  52.4  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0355  hypothetical protein  23.91 
 
 		 295 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0632  meta-pathway phenol degradation-like protein  25 
 
 		 316 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3839  regulation of phenolics degradation protein  27.64 
 
 		 298 aa  51.2  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1148  meta-pathway phenol degradation-like protein  23.53 
 
 		 324 aa  49.7  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1931  hypothetical protein  27.38 
 
 		 327 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.903227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2098  hypothetical protein  22.3 
 
 		 269 aa  48.5  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.591796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0368  hypothetical protein  23.57 
 
 		 295 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32640  hypothetical protein  25.21 
 
 		 303 aa  47  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00101125  hitchhiker  0.00152263 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2763  hypothetical protein  25.21 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0164  hypothetical protein  25.62 
 
 		 306 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.433262  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>