85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2955 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2955  meta-pathway phenol degradation-like protein  100 
 
 
300 aa  615  1e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148613  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6101  putative lipoprotein  45.87 
 
 
316 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70300  putative enzyme  45.72 
 
 
316 aa  255  7e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3168  hypothetical protein  40.32 
 
 
315 aa  233  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30840  hypothetical protein  41.82 
 
 
294 aa  221  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.856206  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2732  hypothetical protein  39.8 
 
 
301 aa  212  7.999999999999999e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.206778  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3157  meta-pathway phenol degradation-like protein  39.4 
 
 
295 aa  202  7e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4501  MetA-pathway phenol degradation-like protein  41.43 
 
 
295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3305  MetA-pathway phenol degradation-like protein  35.37 
 
 
299 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.853243 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1588  hypothetical protein  37.29 
 
 
320 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.232894  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3482  meta-pathway phenol degradation-like protein  36.36 
 
 
318 aa  186  4e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4488  protein involved in meta-pathway of phenol degradation  36.93 
 
 
302 aa  176  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.796292  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08780  hypothetical protein  36.47 
 
 
268 aa  175  9e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299934  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2982  hypothetical protein  35.17 
 
 
299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000220614  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1833  putative signal peptide protein  36 
 
 
297 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.714906  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0883  hypothetical protein  33.44 
 
 
309 aa  170  3e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00462477  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32260  signal peptide protein  32.74 
 
 
303 aa  157  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1838  phenol metabolism protein  35.29 
 
 
310 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.394031  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33380  hypothetical protein  33.45 
 
 
306 aa  142  6e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.72965  normal  0.084061 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5460  hypothetical protein  32.98 
 
 
296 aa  139  6e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2838  hypothetical protein  33.22 
 
 
306 aa  139  7e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2107  putative signal peptide protein  33.67 
 
 
309 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1272  meta-pathway phenol degradation-like protein  33.33 
 
 
325 aa  132  5e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03076  putative signal peptide protein  33.23 
 
 
311 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3195  hypothetical protein  33.33 
 
 
313 aa  123  4e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7181  protein involved in meta-pathway of phenol degradation-like  31.23 
 
 
318 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0516478 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5489  protein involved in MetA-pathway of phenol degradation-like  30.91 
 
 
318 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6775  protein involved in MetA-pathway of phenol degradation-like protein  30.91 
 
 
318 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.617497 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6363  MetA-pathway-like protein  30.91 
 
 
318 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6009  protein involved in MetA-pathway of phenol degradation-like protein  31.02 
 
 
319 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0355  hypothetical protein  31.8 
 
 
295 aa  112  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6305  protein involved in MetA-pathway of phenol degradation-like protein  31.02 
 
 
319 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.477506  normal  0.244867 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2127  phenol degradation-like protein  27.4 
 
 
307 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0368  hypothetical protein  30.53 
 
 
295 aa  108  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6752  hypothetical protein  30.28 
 
 
337 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00609082 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0608  hypothetical protein  28.35 
 
 
330 aa  107  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2845  phenol degradation-like protein  26.13 
 
 
306 aa  105  9e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2732  putative signal peptide  28.57 
 
 
315 aa  105  9e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235663  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0190  hypothetical protein  27.15 
 
 
307 aa  104  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4267  hypothetical protein  31.56 
 
 
297 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0341  hypothetical protein  29.96 
 
 
295 aa  102  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.225999  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32640  hypothetical protein  27.61 
 
 
303 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00101125  hitchhiker  0.00152263 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2763  hypothetical protein  26.49 
 
 
301 aa  99  9e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1931  hypothetical protein  26.27 
 
 
327 aa  98.6  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.903227  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4527  hypothetical protein  30.48 
 
 
310 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6407  hypothetical protein  28.75 
 
 
312 aa  95.9  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.579544 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0164  hypothetical protein  24.15 
 
 
306 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.433262  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3274  hypothetical protein  28.85 
 
 
312 aa  92.8  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0193485 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4890  hypothetical protein  28.85 
 
 
312 aa  92.8  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6119  hypothetical protein  28.53 
 
 
312 aa  92.4  9e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6917  hypothetical protein  28.85 
 
 
312 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1047  MetA-pathway of phenol degradation-like protein  24.62 
 
 
307 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.379936 
 
 
-
 
NC_003296  RS05192  putative signal peptide protein  30.69 
 
 
319 aa  90.1  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00268581  normal  0.960066 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5144  hypothetical protein  27.65 
 
 
331 aa  89  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62916  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1728  hypothetical protein  26.1 
 
 
334 aa  87  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000180313 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0531  hypothetical protein  27.76 
 
 
345 aa  85.5  9e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0092  hypothetical protein  27.83 
 
 
334 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.672977  normal  0.778879 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2975  hypothetical protein  33.33 
 
 
331 aa  82.4  0.000000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3846  hypothetical protein  28.67 
 
 
334 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1191  hypothetical protein  26.48 
 
 
350 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.161242  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4832  hypothetical protein  25 
 
 
304 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.922561 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3122  hypothetical protein  26.09 
 
 
326 aa  78.2  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0598  hypothetical protein  34.29 
 
 
364 aa  77.8  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.161242  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1377  MetA-pathway phenol degradation-like protein  25.84 
 
 
324 aa  75.1  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.351343  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2098  hypothetical protein  24.24 
 
 
269 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.591796  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2795  hypothetical protein  27.74 
 
 
327 aa  71.2  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8068  hypothetical protein  28.12 
 
 
341 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2404  hypothetical protein  26.83 
 
 
329 aa  70.5  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.147622  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1956  hypothetical protein  29.5 
 
 
322 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.235366  hitchhiker  0.00028826 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3413  hypothetical protein  25.61 
 
 
328 aa  65.5  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.591496  normal  0.708141 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2099  Protein involved in meta-pathway of phenol degradation  27.4 
 
 
319 aa  63.9  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119201  normal  0.245606 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7148  protein involved in meta-pathway of phenol degradation  27.92 
 
 
304 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00536985  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3839  regulation of phenolics degradation protein  26.32 
 
 
298 aa  60.8  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1376  meta-pathway phenol degradation protein  26.24 
 
 
309 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0632  meta-pathway phenol degradation-like protein  24.05 
 
 
316 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6970  hypothetical protein  31.12 
 
 
340 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000157214  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2388  hypothetical protein  25.56 
 
 
310 aa  56.6  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.806824 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1676  hypothetical protein  26.35 
 
 
328 aa  55.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.275603  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0295  hypothetical protein  22.58 
 
 
256 aa  54.3  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000520717 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1148  meta-pathway phenol degradation-like protein  24.84 
 
 
324 aa  52.8  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5224  hypothetical protein  30.37 
 
 
322 aa  49.7  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.347235 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4536  phenol degradation protein  28.63 
 
 
318 aa  49.7  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375555  normal  0.225823 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1768  meta-pathway phenol degradation-like protein  24.68 
 
 
316 aa  47.4  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2203  hypothetical protein  26.71 
 
 
349 aa  45.8  0.0009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2000  putative signal peptide  22.58 
 
 
291 aa  44.3  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>