71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_32640 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_32640  hypothetical protein  100 
 
 		 303 aa  616  1e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00101125  hitchhiker  0.00152263 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2763  hypothetical protein  93.07 
 
 		 301 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2838  hypothetical protein  53.56 
 
 		 306 aa  305  7e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33380  hypothetical protein  50.33 
 
 		 306 aa  293  3e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.72965  normal  0.084061 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1272  meta-pathway phenol degradation-like protein  44.26 
 
 		 325 aa  251  1e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2732  putative signal peptide  40.62 
 
 		 315 aa  192  8e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235663  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5489  protein involved in MetA-pathway of phenol degradation-like  37.8 
 
 		 318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6009  protein involved in MetA-pathway of phenol degradation-like protein  37.13 
 
 		 319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6305  protein involved in MetA-pathway of phenol degradation-like protein  37.46 
 
 		 319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.477506  normal  0.244867 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6775  protein involved in MetA-pathway of phenol degradation-like protein  37.8 
 
 		 318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.617497 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7181  protein involved in meta-pathway of phenol degradation-like  37.37 
 
 		 318 aa  163  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0516478 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6363  MetA-pathway-like protein  37.46 
 
 		 318 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05192  putative signal peptide protein  34.25 
 
 		 319 aa  144  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00268581  normal  0.960066 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0608  hypothetical protein  31.77 
 
 		 330 aa  130  3e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3305  MetA-pathway phenol degradation-like protein  31.9 
 
 		 299 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.853243 
 
 
-
 
NC_003296  RS03076  putative signal peptide protein  33.08 
 
 		 311 aa  124  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08780  hypothetical protein  31.84 
 
 		 268 aa  122  8e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299934  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1838  phenol metabolism protein  32.06 
 
 		 310 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.394031  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2732  hypothetical protein  30.08 
 
 		 301 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.206778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2982  hypothetical protein  29.97 
 
 		 299 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000220614  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3195  hypothetical protein  30.57 
 
 		 313 aa  111  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0883  hypothetical protein  29.08 
 
 		 309 aa  110  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00462477  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2107  putative signal peptide protein  29.6 
 
 		 309 aa  109  5e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4267  hypothetical protein  30.77 
 
 		 297 aa  106  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2955  meta-pathway phenol degradation-like protein  27.61 
 
 		 300 aa  99.4  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0190  hypothetical protein  28.52 
 
 		 307 aa  97.1  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4527  hypothetical protein  30.48 
 
 		 310 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3168  hypothetical protein  26.75 
 
 		 315 aa  92  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32260  signal peptide protein  26.67 
 
 		 303 aa  91.3  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1728  hypothetical protein  27.76 
 
 		 334 aa  91.3  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000180313 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6407  hypothetical protein  31.49 
 
 		 312 aa  90.5  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.579544 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2098  hypothetical protein  26.64 
 
 		 269 aa  90.1  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.591796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3482  meta-pathway phenol degradation-like protein  24.26 
 
 		 318 aa  88.6  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6119  hypothetical protein  30.13 
 
 		 312 aa  87.4  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2845  phenol degradation-like protein  29.15 
 
 		 306 aa  87  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1588  hypothetical protein  29.46 
 
 		 320 aa  87  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.232894  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3274  hypothetical protein  28.99 
 
 		 312 aa  86.3  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0193485 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4890  hypothetical protein  28.99 
 
 		 312 aa  86.3  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6917  hypothetical protein  28.99 
 
 		 312 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2127  phenol degradation-like protein  27.23 
 
 		 307 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0295  hypothetical protein  26.02 
 
 		 256 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000520717 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1931  hypothetical protein  23.99 
 
 		 327 aa  81.6  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.903227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70300  putative enzyme  26.86 
 
 		 316 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6101  putative lipoprotein  26.86 
 
 		 316 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3157  meta-pathway phenol degradation-like protein  26.64 
 
 		 295 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5460  hypothetical protein  25.24 
 
 		 296 aa  78.2  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4501  MetA-pathway phenol degradation-like protein  27.03 
 
 		 295 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4488  protein involved in meta-pathway of phenol degradation  27.4 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30840  hypothetical protein  24.68 
 
 		 294 aa  73.2  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.856206  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0355  hypothetical protein  23.66 
 
 		 295 aa  70.5  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1956  hypothetical protein  33.33 
 
 		 322 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.235366  hitchhiker  0.00028826 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0164  hypothetical protein  22.92 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.433262  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7148  protein involved in meta-pathway of phenol degradation  24.28 
 
 		 304 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00536985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0341  hypothetical protein  23.51 
 
 		 295 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.225999  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1833  putative signal peptide protein  25.22 
 
 		 297 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.714906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0368  hypothetical protein  22.81 
 
 		 295 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5144  hypothetical protein  23.94 
 
 		 331 aa  60.1  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4832  hypothetical protein  21.57 
 
 		 304 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.922561 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2203  hypothetical protein  28.39 
 
 		 349 aa  53.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1158  putative signal peptide  26.32 
 
 		 298 aa  51.6  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2795  hypothetical protein  29.7 
 
 		 327 aa  50.4  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0598  hypothetical protein  30.77 
 
 		 364 aa  50.4  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.161242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4520  putative signal peptide  25.77 
 
 		 298 aa  50.1  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0632  meta-pathway phenol degradation-like protein  23.62 
 
 		 316 aa  49.7  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1377  MetA-pathway phenol degradation-like protein  22.41 
 
 		 324 aa  49.7  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.351343  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1148  meta-pathway phenol degradation-like protein  23.13 
 
 		 324 aa  49.7  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2975  hypothetical protein  28.39 
 
 		 331 aa  48.5  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6752  hypothetical protein  25.21 
 
 		 337 aa  47  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00609082 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3839  regulation of phenolics degradation protein  23.25 
 
 		 298 aa  47  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3413  hypothetical protein  26.71 
 
 		 328 aa  46.6  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.591496  normal  0.708141 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3122  hypothetical protein  26.2 
 
 		 326 aa  43.1  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>