72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2763 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2763  hypothetical protein  100 
 
 
301 aa  610  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32640  hypothetical protein  96.44 
 
 
303 aa  559  1e-158  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00101125  hitchhiker  0.00152263 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2838  hypothetical protein  53.08 
 
 
306 aa  300  1e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33380  hypothetical protein  51.03 
 
 
306 aa  293  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.72965  normal  0.084061 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1272  meta-pathway phenol degradation-like protein  43.62 
 
 
325 aa  245  8e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2732  putative signal peptide  39.16 
 
 
315 aa  192  5e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235663  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6775  protein involved in MetA-pathway of phenol degradation-like protein  37.62 
 
 
318 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.617497 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5489  protein involved in MetA-pathway of phenol degradation-like  37.62 
 
 
318 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7181  protein involved in meta-pathway of phenol degradation-like  35.86 
 
 
318 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0516478 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6009  protein involved in MetA-pathway of phenol degradation-like protein  37.54 
 
 
319 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6305  protein involved in MetA-pathway of phenol degradation-like protein  37.87 
 
 
319 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.477506  normal  0.244867 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6363  MetA-pathway-like protein  37.63 
 
 
318 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05192  putative signal peptide protein  33.22 
 
 
319 aa  140  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00268581  normal  0.960066 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0608  hypothetical protein  31.74 
 
 
330 aa  132  9e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03076  putative signal peptide protein  31.13 
 
 
311 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3305  MetA-pathway phenol degradation-like protein  30.82 
 
 
299 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.853243 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2732  hypothetical protein  29.32 
 
 
301 aa  118  9e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.206778  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1838  phenol metabolism protein  31.01 
 
 
310 aa  118  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.394031  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08780  hypothetical protein  30.34 
 
 
268 aa  116  3.9999999999999997e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299934  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2982  hypothetical protein  28.85 
 
 
299 aa  112  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000220614  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3195  hypothetical protein  29.25 
 
 
313 aa  111  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2107  putative signal peptide protein  29.24 
 
 
309 aa  107  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0883  hypothetical protein  28.01 
 
 
309 aa  104  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00462477  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4267  hypothetical protein  29.68 
 
 
297 aa  102  8e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2955  meta-pathway phenol degradation-like protein  26.13 
 
 
300 aa  99.4  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148613  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4527  hypothetical protein  28.9 
 
 
310 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32260  signal peptide protein  27.45 
 
 
303 aa  94.4  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0190  hypothetical protein  27.76 
 
 
307 aa  91.7  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1588  hypothetical protein  29.46 
 
 
320 aa  90.5  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.232894  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3482  meta-pathway phenol degradation-like protein  24.18 
 
 
318 aa  90.1  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6407  hypothetical protein  29.24 
 
 
312 aa  89.4  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.579544 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6119  hypothetical protein  29.71 
 
 
312 aa  88.2  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2098  hypothetical protein  26.28 
 
 
269 aa  88.6  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.591796  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3168  hypothetical protein  26.75 
 
 
315 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2845  phenol degradation-like protein  28.25 
 
 
306 aa  87  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1728  hypothetical protein  26.03 
 
 
334 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000180313 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3274  hypothetical protein  28.15 
 
 
312 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0193485 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4890  hypothetical protein  28.15 
 
 
312 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6917  hypothetical protein  28.15 
 
 
312 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1931  hypothetical protein  24.16 
 
 
327 aa  80.1  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.903227  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6101  putative lipoprotein  25.33 
 
 
316 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2127  phenol degradation-like protein  25.45 
 
 
307 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4488  protein involved in meta-pathway of phenol degradation  25.75 
 
 
302 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.796292  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70300  putative enzyme  25.8 
 
 
316 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3157  meta-pathway phenol degradation-like protein  25.87 
 
 
295 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0295  hypothetical protein  24.91 
 
 
256 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000520717 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5460  hypothetical protein  24.1 
 
 
296 aa  72.8  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0355  hypothetical protein  23.66 
 
 
295 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4501  MetA-pathway phenol degradation-like protein  25.48 
 
 
295 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0164  hypothetical protein  22.92 
 
 
306 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.433262  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30840  hypothetical protein  26.28 
 
 
294 aa  67.4  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.856206  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1956  hypothetical protein  32.59 
 
 
322 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.235366  hitchhiker  0.00028826 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0341  hypothetical protein  23.51 
 
 
295 aa  65.9  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.225999  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7148  protein involved in meta-pathway of phenol degradation  24.28 
 
 
304 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00536985  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1833  putative signal peptide protein  24.34 
 
 
297 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.714906  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0368  hypothetical protein  23.19 
 
 
295 aa  63.5  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5144  hypothetical protein  24.65 
 
 
331 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62916  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4832  hypothetical protein  22.09 
 
 
304 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.922561 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1158  putative signal peptide  26.09 
 
 
298 aa  50.4  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0632  meta-pathway phenol degradation-like protein  24.87 
 
 
316 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3839  regulation of phenolics degradation protein  23.92 
 
 
298 aa  48.5  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2203  hypothetical protein  26.45 
 
 
349 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2795  hypothetical protein  28.48 
 
 
327 aa  48.1  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4520  putative signal peptide  24.9 
 
 
298 aa  47.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1377  MetA-pathway phenol degradation-like protein  22.12 
 
 
324 aa  47.4  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.351343  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0598  hypothetical protein  29.49 
 
 
364 aa  46.6  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.161242  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2975  hypothetical protein  27.1 
 
 
331 aa  46.2  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3413  hypothetical protein  26.71 
 
 
328 aa  45.8  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.591496  normal  0.708141 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1148  meta-pathway phenol degradation-like protein  23.36 
 
 
324 aa  45.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6752  hypothetical protein  24.45 
 
 
337 aa  45.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00609082 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3122  hypothetical protein  26.06 
 
 
326 aa  45.1  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1047  MetA-pathway of phenol degradation-like protein  21 
 
 
307 aa  43.9  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.379936 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>