54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4832 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4832  hypothetical protein  100 
 
 		 304 aa  608  1e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.922561 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0164  hypothetical protein  66.45 
 
 		 306 aa  394  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.433262  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1931  hypothetical protein  44.41 
 
 		 327 aa  258  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.903227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2388  hypothetical protein  34.75 
 
 		 310 aa  168  8e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.806824 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5460  hypothetical protein  31.99 
 
 		 296 aa  155  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3157  meta-pathway phenol degradation-like protein  34.41 
 
 		 295 aa  148  9e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4501  MetA-pathway phenol degradation-like protein  34.05 
 
 		 295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2732  hypothetical protein  30.42 
 
 		 301 aa  139  7e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.206778  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32260  signal peptide protein  32.25 
 
 		 303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3305  MetA-pathway phenol degradation-like protein  30.77 
 
 		 299 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.853243 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08780  hypothetical protein  30.86 
 
 		 268 aa  126  4.0000000000000003e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299934  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1833  putative signal peptide protein  31.06 
 
 		 297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.714906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2982  hypothetical protein  27.53 
 
 		 299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000220614  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3482  meta-pathway phenol degradation-like protein  28.15 
 
 		 318 aa  108  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1588  hypothetical protein  29.73 
 
 		 320 aa  98.6  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.232894  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0632  meta-pathway phenol degradation-like protein  26.67 
 
 		 316 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4527  hypothetical protein  30.48 
 
 		 310 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30840  hypothetical protein  25.37 
 
 		 294 aa  97.4  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.856206  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03076  putative signal peptide protein  26.82 
 
 		 311 aa  96.3  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4488  protein involved in meta-pathway of phenol degradation  28.62 
 
 		 302 aa  90.5  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3195  hypothetical protein  27.44 
 
 		 313 aa  90.1  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0883  hypothetical protein  25.99 
 
 		 309 aa  89.4  7e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00462477  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2107  putative signal peptide protein  28.03 
 
 		 309 aa  89.4  8e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4267  hypothetical protein  28.75 
 
 		 297 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1838  phenol metabolism protein  26.74 
 
 		 310 aa  89  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.394031  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0368  hypothetical protein  27.39 
 
 		 295 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0190  hypothetical protein  26.28 
 
 		 307 aa  81.6  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3168  hypothetical protein  23.26 
 
 		 315 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0355  hypothetical protein  27.67 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6407  hypothetical protein  27.89 
 
 		 312 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.579544 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2955  meta-pathway phenol degradation-like protein  25 
 
 		 300 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6101  putative lipoprotein  23.34 
 
 		 316 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1377  MetA-pathway phenol degradation-like protein  25.47 
 
 		 324 aa  79.3  0.00000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.351343  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6119  hypothetical protein  27.89 
 
 		 312 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0341  hypothetical protein  26.33 
 
 		 295 aa  76.6  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.225999  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3274  hypothetical protein  26.09 
 
 		 312 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0193485 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4890  hypothetical protein  26.09 
 
 		 312 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6917  hypothetical protein  26.09 
 
 		 312 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70300  putative enzyme  22.08 
 
 		 316 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1047  MetA-pathway of phenol degradation-like protein  25.84 
 
 		 307 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.379936 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1272  meta-pathway phenol degradation-like protein  23.37 
 
 		 325 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1956  hypothetical protein  30.3 
 
 		 322 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.235366  hitchhiker  0.00028826 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2763  hypothetical protein  22.09 
 
 		 301 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7148  protein involved in meta-pathway of phenol degradation  25.5 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00536985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32640  hypothetical protein  22.09 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00101125  hitchhiker  0.00152263 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5144  hypothetical protein  27.27 
 
 		 331 aa  53.9  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0295  hypothetical protein  25.82 
 
 		 256 aa  52.8  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000520717 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2127  phenol degradation-like protein  23.96 
 
 		 307 aa  49.7  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2845  phenol degradation-like protein  23.96 
 
 		 306 aa  49.7  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1728  hypothetical protein  25.37 
 
 		 334 aa  47.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000180313 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3839  regulation of phenolics degradation protein  25.56 
 
 		 298 aa  47.4  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2098  hypothetical protein  23.4 
 
 		 269 aa  44.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.591796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33380  hypothetical protein  22.12 
 
 		 306 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.72965  normal  0.084061 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2975  hypothetical protein  24.84 
 
 		 331 aa  42.7  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>