68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_0164 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_0164  hypothetical protein  100 
 
 		 306 aa  617  1e-176  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.433262  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4832  hypothetical protein  66.45 
 
 		 304 aa  407  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.922561 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1931  hypothetical protein  43.31 
 
 		 327 aa  250  3e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.903227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2388  hypothetical protein  36.52 
 
 		 310 aa  177  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.806824 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5460  hypothetical protein  31 
 
 		 296 aa  162  9e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2732  hypothetical protein  28.16 
 
 		 301 aa  140  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.206778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3157  meta-pathway phenol degradation-like protein  32.11 
 
 		 295 aa  135  8e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4501  MetA-pathway phenol degradation-like protein  31.1 
 
 		 295 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2982  hypothetical protein  27.92 
 
 		 299 aa  127  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000220614  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3305  MetA-pathway phenol degradation-like protein  28.03 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.853243 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1588  hypothetical protein  31.58 
 
 		 320 aa  122  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.232894  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08780  hypothetical protein  26.39 
 
 		 268 aa  119  7.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299934  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4488  protein involved in meta-pathway of phenol degradation  27.91 
 
 		 302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3482  meta-pathway phenol degradation-like protein  28.07 
 
 		 318 aa  115  8.999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32260  signal peptide protein  27.08 
 
 		 303 aa  112  6e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0883  hypothetical protein  27.65 
 
 		 309 aa  109  5e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00462477  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1833  putative signal peptide protein  31.32 
 
 		 297 aa  107  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.714906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0368  hypothetical protein  30.98 
 
 		 295 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1838  phenol metabolism protein  25.52 
 
 		 310 aa  102  6e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.394031  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03076  putative signal peptide protein  28.16 
 
 		 311 aa  102  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2955  meta-pathway phenol degradation-like protein  24.83 
 
 		 300 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0355  hypothetical protein  30.51 
 
 		 295 aa  99  8e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30840  hypothetical protein  25.36 
 
 		 294 aa  94.7  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.856206  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0341  hypothetical protein  29.12 
 
 		 295 aa  92.4  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.225999  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0190  hypothetical protein  27.34 
 
 		 307 aa  92.4  9e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4267  hypothetical protein  29.37 
 
 		 297 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2107  putative signal peptide protein  25.49 
 
 		 309 aa  89.4  6e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6407  hypothetical protein  27.12 
 
 		 312 aa  87  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.579544 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6119  hypothetical protein  27.03 
 
 		 312 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3195  hypothetical protein  27.5 
 
 		 313 aa  85.5  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4527  hypothetical protein  29.17 
 
 		 310 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3168  hypothetical protein  23.26 
 
 		 315 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1377  MetA-pathway phenol degradation-like protein  25.57 
 
 		 324 aa  82.8  0.000000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.351343  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6917  hypothetical protein  26.76 
 
 		 312 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0632  meta-pathway phenol degradation-like protein  24.26 
 
 		 316 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3274  hypothetical protein  26.29 
 
 		 312 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0193485 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4890  hypothetical protein  26.29 
 
 		 312 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5144  hypothetical protein  28.12 
 
 		 331 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1047  MetA-pathway of phenol degradation-like protein  27.7 
 
 		 307 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.379936 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1956  hypothetical protein  30.41 
 
 		 322 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.235366  hitchhiker  0.00028826 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6101  putative lipoprotein  23.38 
 
 		 316 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70300  putative enzyme  22.01 
 
 		 316 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1272  meta-pathway phenol degradation-like protein  21.64 
 
 		 325 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7148  protein involved in meta-pathway of phenol degradation  25.16 
 
 		 304 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00536985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2763  hypothetical protein  22.92 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32640  hypothetical protein  23.32 
 
 		 303 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00101125  hitchhiker  0.00152263 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1728  hypothetical protein  25.35 
 
 		 334 aa  62.8  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000180313 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0295  hypothetical protein  23.95 
 
 		 256 aa  62  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000520717 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2098  hypothetical protein  24.02 
 
 		 269 aa  59.7  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.591796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5600  hypothetical protein  21.49 
 
 		 383 aa  56.2  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00091534  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2845  phenol degradation-like protein  23.21 
 
 		 306 aa  55.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2975  hypothetical protein  28.11 
 
 		 331 aa  53.5  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1191  hypothetical protein  26.97 
 
 		 350 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.161242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0531  hypothetical protein  24.23 
 
 		 345 aa  52.8  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2127  phenol degradation-like protein  21.3 
 
 		 307 aa  51.2  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4536  phenol degradation protein  21.83 
 
 		 318 aa  50.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375555  normal  0.225823 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0598  hypothetical protein  30.69 
 
 		 364 aa  50.4  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.161242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2838  hypothetical protein  22.31 
 
 		 306 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2099  Protein involved in meta-pathway of phenol degradation  24.43 
 
 		 319 aa  48.9  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119201  normal  0.245606 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8068  hypothetical protein  25.82 
 
 		 341 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2732  putative signal peptide  22.8 
 
 		 315 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235663  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0092  hypothetical protein  25.82 
 
 		 334 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.672977  normal  0.778879 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2795  hypothetical protein  24.75 
 
 		 327 aa  44.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3839  regulation of phenolics degradation protein  23.73 
 
 		 298 aa  44.3  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33380  hypothetical protein  21.54 
 
 		 306 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.72965  normal  0.084061 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6752  hypothetical protein  25.62 
 
 		 337 aa  43.9  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00609082 
 
 
-
 
NC_003296  RS05192  putative signal peptide protein  28.97 
 
 		 319 aa  43.1  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00268581  normal  0.960066 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2404  hypothetical protein  25.68 
 
 		 329 aa  42.7  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.147622  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>