56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7148 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7148  protein involved in meta-pathway of phenol degradation  100 
 
 		 304 aa  613  1e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00536985  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1956  hypothetical protein  30.5 
 
 		 322 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.235366  hitchhiker  0.00028826 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3305  MetA-pathway phenol degradation-like protein  27.24 
 
 		 299 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.853243 
 
 
-
 
NC_003296  RS03076  putative signal peptide protein  28.06 
 
 		 311 aa  94.7  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5600  hypothetical protein  27.83 
 
 		 383 aa  91.7  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00091534  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2732  hypothetical protein  27.62 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.206778  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08780  hypothetical protein  26.22 
 
 		 268 aa  78.6  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299934  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2982  hypothetical protein  26.58 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000220614  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70300  putative enzyme  25.42 
 
 		 316 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6101  putative lipoprotein  26.3 
 
 		 316 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4267  hypothetical protein  30.92 
 
 		 297 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3195  hypothetical protein  29.85 
 
 		 313 aa  70.5  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4527  hypothetical protein  30.06 
 
 		 310 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0190  hypothetical protein  25.14 
 
 		 307 aa  65.1  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2763  hypothetical protein  26.19 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32260  signal peptide protein  23.05 
 
 		 303 aa  64.7  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33380  hypothetical protein  30.54 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.72965  normal  0.084061 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7181  protein involved in meta-pathway of phenol degradation-like  24.61 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0516478 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2955  meta-pathway phenol degradation-like protein  27.92 
 
 		 300 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32640  hypothetical protein  26.19 
 
 		 303 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00101125  hitchhiker  0.00152263 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3168  hypothetical protein  23.26 
 
 		 315 aa  62  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1838  phenol metabolism protein  24.7 
 
 		 310 aa  61.6  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.394031  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0164  hypothetical protein  25.18 
 
 		 306 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.433262  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6363  MetA-pathway-like protein  23.92 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5489  protein involved in MetA-pathway of phenol degradation-like  23.17 
 
 		 318 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6775  protein involved in MetA-pathway of phenol degradation-like protein  23.17 
 
 		 318 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.617497 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2838  hypothetical protein  27.54 
 
 		 306 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4488  protein involved in meta-pathway of phenol degradation  32.03 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4832  hypothetical protein  25.5 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.922561 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0632  meta-pathway phenol degradation-like protein  24.63 
 
 		 316 aa  60.1  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6305  protein involved in MetA-pathway of phenol degradation-like protein  23.59 
 
 		 319 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.477506  normal  0.244867 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1377  MetA-pathway phenol degradation-like protein  27.04 
 
 		 324 aa  59.3  0.00000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.351343  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1833  putative signal peptide protein  26.13 
 
 		 297 aa  59.3  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.714906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1588  hypothetical protein  29.66 
 
 		 320 aa  59.7  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.232894  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6009  protein involved in MetA-pathway of phenol degradation-like protein  23.26 
 
 		 319 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0883  hypothetical protein  31.41 
 
 		 309 aa  58.9  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00462477  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6917  hypothetical protein  26.05 
 
 		 312 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6407  hypothetical protein  26.41 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.579544 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3274  hypothetical protein  25.96 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0193485 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4890  hypothetical protein  25.96 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4501  MetA-pathway phenol degradation-like protein  24.76 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6119  hypothetical protein  26.41 
 
 		 312 aa  57  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0341  hypothetical protein  26.7 
 
 		 295 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.225999  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0355  hypothetical protein  27.27 
 
 		 295 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5460  hypothetical protein  21.93 
 
 		 296 aa  53.1  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1931  hypothetical protein  24.32 
 
 		 327 aa  50.4  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.903227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0368  hypothetical protein  25.42 
 
 		 295 aa  49.7  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3157  meta-pathway phenol degradation-like protein  23.84 
 
 		 295 aa  49.7  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5224  hypothetical protein  23.99 
 
 		 322 aa  47.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.347235 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2107  putative signal peptide protein  25 
 
 		 309 aa  48.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05192  putative signal peptide protein  25.27 
 
 		 319 aa  47.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00268581  normal  0.960066 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3482  meta-pathway phenol degradation-like protein  24.8 
 
 		 318 aa  45.8  0.0009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1272  meta-pathway phenol degradation-like protein  25.13 
 
 		 325 aa  45.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2795  hypothetical protein  28.44 
 
 		 327 aa  45.1  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30840  hypothetical protein  22.97 
 
 		 294 aa  43.1  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.856206  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1289  histidyl-tRNA synthetase  29.46 
 
 		 531 aa  42.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.219331 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>