83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3195 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3195  hypothetical protein  100 
 
 		 313 aa  643    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4527  hypothetical protein  54.19 
 
 		 310 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4267  hypothetical protein  56.77 
 
 		 297 aa  352  4e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0190  hypothetical protein  54.43 
 
 		 307 aa  349  4e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03076  putative signal peptide protein  47.78 
 
 		 311 aa  279  3e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6917  hypothetical protein  46.06 
 
 		 312 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6407  hypothetical protein  48.8 
 
 		 312 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.579544 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6119  hypothetical protein  48.8 
 
 		 312 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4890  hypothetical protein  45.74 
 
 		 312 aa  271  9e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3274  hypothetical protein  45.74 
 
 		 312 aa  271  9e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0193485 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2732  hypothetical protein  36.48 
 
 		 301 aa  172  5e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.206778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2982  hypothetical protein  31.37 
 
 		 299 aa  143  4e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000220614  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3305  MetA-pathway phenol degradation-like protein  30.62 
 
 		 299 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.853243 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2107  putative signal peptide protein  31.66 
 
 		 309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08780  hypothetical protein  31.52 
 
 		 268 aa  124  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299934  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2955  meta-pathway phenol degradation-like protein  33.33 
 
 		 300 aa  123  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0883  hypothetical protein  30.27 
 
 		 309 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00462477  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5460  hypothetical protein  30.32 
 
 		 296 aa  117  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32640  hypothetical protein  30.57 
 
 		 303 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00101125  hitchhiker  0.00152263 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1588  hypothetical protein  30.9 
 
 		 320 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.232894  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4501  MetA-pathway phenol degradation-like protein  30.25 
 
 		 295 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2763  hypothetical protein  29.14 
 
 		 301 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3157  meta-pathway phenol degradation-like protein  28.94 
 
 		 295 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32260  signal peptide protein  27.97 
 
 		 303 aa  104  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0355  hypothetical protein  28.11 
 
 		 295 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0368  hypothetical protein  27.05 
 
 		 295 aa  102  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1838  phenol metabolism protein  29.17 
 
 		 310 aa  100  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.394031  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0341  hypothetical protein  27.45 
 
 		 295 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.225999  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3168  hypothetical protein  26.1 
 
 		 315 aa  100  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3482  meta-pathway phenol degradation-like protein  28.81 
 
 		 318 aa  97.8  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1833  putative signal peptide protein  26.33 
 
 		 297 aa  96.7  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.714906  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30840  hypothetical protein  28.18 
 
 		 294 aa  95.1  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.856206  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1931  hypothetical protein  29.85 
 
 		 327 aa  94.7  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.903227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6101  putative lipoprotein  27.19 
 
 		 316 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70300  putative enzyme  28.44 
 
 		 316 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2838  hypothetical protein  26.71 
 
 		 306 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4832  hypothetical protein  27.44 
 
 		 304 aa  90.1  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.922561 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6009  protein involved in MetA-pathway of phenol degradation-like protein  28.35 
 
 		 319 aa  87.4  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6305  protein involved in MetA-pathway of phenol degradation-like protein  28.35 
 
 		 319 aa  87.4  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.477506  normal  0.244867 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4488  protein involved in meta-pathway of phenol degradation  29.49 
 
 		 302 aa  85.9  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33380  hypothetical protein  26.73 
 
 		 306 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.72965  normal  0.084061 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0164  hypothetical protein  27.5 
 
 		 306 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.433262  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2795  hypothetical protein  32.27 
 
 		 327 aa  82.8  0.000000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1377  MetA-pathway phenol degradation-like protein  29.41 
 
 		 324 aa  82  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.351343  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2098  hypothetical protein  27.34 
 
 		 269 aa  82  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.591796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1728  hypothetical protein  26.01 
 
 		 334 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000180313 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7181  protein involved in meta-pathway of phenol degradation-like  28.75 
 
 		 318 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0516478 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5489  protein involved in MetA-pathway of phenol degradation-like  30.03 
 
 		 318 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05192  putative signal peptide protein  27.51 
 
 		 319 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00268581  normal  0.960066 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6775  protein involved in MetA-pathway of phenol degradation-like protein  30.03 
 
 		 318 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.617497 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6363  MetA-pathway-like protein  29.72 
 
 		 318 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0295  hypothetical protein  25 
 
 		 256 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000520717 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1956  hypothetical protein  34.15 
 
 		 322 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.235366  hitchhiker  0.00028826 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2975  hypothetical protein  27.6 
 
 		 331 aa  74.7  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0531  hypothetical protein  28.4 
 
 		 345 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1272  meta-pathway phenol degradation-like protein  24.61 
 
 		 325 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0598  hypothetical protein  34.84 
 
 		 364 aa  73.6  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.161242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1047  MetA-pathway of phenol degradation-like protein  25.11 
 
 		 307 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.379936 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0632  meta-pathway phenol degradation-like protein  27.23 
 
 		 316 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7148  protein involved in meta-pathway of phenol degradation  29.85 
 
 		 304 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00536985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2732  putative signal peptide  29.73 
 
 		 315 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235663  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0092  hypothetical protein  26.91 
 
 		 334 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.672977  normal  0.778879 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6970  hypothetical protein  28.57 
 
 		 340 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000157214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4536  phenol degradation protein  26.36 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375555  normal  0.225823 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2203  hypothetical protein  33.12 
 
 		 349 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3846  hypothetical protein  26.54 
 
 		 334 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3122  hypothetical protein  35.17 
 
 		 326 aa  66.6  0.0000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5224  hypothetical protein  30.07 
 
 		 322 aa  65.1  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.347235 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5144  hypothetical protein  27.17 
 
 		 331 aa  63.9  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1676  hypothetical protein  31.25 
 
 		 328 aa  63.2  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.275603  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3839  regulation of phenolics degradation protein  28.45 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3413  hypothetical protein  25 
 
 		 328 aa  61.2  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.591496  normal  0.708141 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6752  hypothetical protein  27.83 
 
 		 337 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00609082 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1191  hypothetical protein  29.48 
 
 		 350 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.161242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2127  phenol degradation-like protein  22.68 
 
 		 307 aa  52.4  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2388  hypothetical protein  24.45 
 
 		 310 aa  51.2  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.806824 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5600  hypothetical protein  23.15 
 
 		 383 aa  47  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00091534  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1148  meta-pathway phenol degradation-like protein  23.97 
 
 		 324 aa  44.3  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2845  phenol degradation-like protein  22.57 
 
 		 306 aa  44.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8068  hypothetical protein  25.11 
 
 		 341 aa  43.9  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2404  hypothetical protein  27.47 
 
 		 329 aa  42.7  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.147622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2099  Protein involved in meta-pathway of phenol degradation  26.83 
 
 		 319 aa  42.4  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119201  normal  0.245606 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0608  hypothetical protein  22.07 
 
 		 330 aa  42.4  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>