53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2203 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2203  hypothetical protein  100 
 
 		 349 aa  702    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0598  hypothetical protein  53.78 
 
 		 364 aa  362  6e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.161242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2975  hypothetical protein  51.34 
 
 		 331 aa  321  9.999999999999999e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6752  hypothetical protein  34.21 
 
 		 337 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00609082 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0531  hypothetical protein  35.06 
 
 		 345 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1191  hypothetical protein  31.95 
 
 		 350 aa  156  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.161242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2404  hypothetical protein  32.09 
 
 		 329 aa  144  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.147622  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5144  hypothetical protein  32.1 
 
 		 331 aa  143  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3413  hypothetical protein  32.39 
 
 		 328 aa  139  6e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.591496  normal  0.708141 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2795  hypothetical protein  37.63 
 
 		 327 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8068  hypothetical protein  31.6 
 
 		 341 aa  126  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3122  hypothetical protein  30.32 
 
 		 326 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08780  hypothetical protein  27.76 
 
 		 268 aa  91.7  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299934  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0883  hypothetical protein  34.39 
 
 		 309 aa  86.3  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00462477  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03076  putative signal peptide protein  33.33 
 
 		 311 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5460  hypothetical protein  33.15 
 
 		 296 aa  79.3  0.00000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6407  hypothetical protein  32.16 
 
 		 312 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.579544 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4267  hypothetical protein  32.74 
 
 		 297 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6119  hypothetical protein  31.76 
 
 		 312 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30840  hypothetical protein  25.55 
 
 		 294 aa  74.7  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.856206  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2732  hypothetical protein  32.63 
 
 		 301 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.206778  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4527  hypothetical protein  34.93 
 
 		 310 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2982  hypothetical protein  30.32 
 
 		 299 aa  69.3  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000220614  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3157  meta-pathway phenol degradation-like protein  28.71 
 
 		 295 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3482  meta-pathway phenol degradation-like protein  28.57 
 
 		 318 aa  69.3  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4890  hypothetical protein  33.56 
 
 		 312 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6917  hypothetical protein  32.89 
 
 		 312 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3274  hypothetical protein  33.56 
 
 		 312 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0193485 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32260  signal peptide protein  29.53 
 
 		 303 aa  68.2  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3195  hypothetical protein  33.12 
 
 		 313 aa  67  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3305  MetA-pathway phenol degradation-like protein  28.14 
 
 		 299 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.853243 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1833  putative signal peptide protein  29.31 
 
 		 297 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.714906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1588  hypothetical protein  24.79 
 
 		 320 aa  63.9  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.232894  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4501  MetA-pathway phenol degradation-like protein  28.24 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2107  putative signal peptide protein  29.84 
 
 		 309 aa  62  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3168  hypothetical protein  24.61 
 
 		 315 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70300  putative enzyme  23.83 
 
 		 316 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6101  putative lipoprotein  24.87 
 
 		 316 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4488  protein involved in meta-pathway of phenol degradation  30 
 
 		 302 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0190  hypothetical protein  27.27 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2732  putative signal peptide  30.97 
 
 		 315 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235663  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32640  hypothetical protein  28.39 
 
 		 303 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00101125  hitchhiker  0.00152263 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1676  hypothetical protein  28.77 
 
 		 328 aa  52.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.275603  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6970  hypothetical protein  33.11 
 
 		 340 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000157214  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2845  phenol degradation-like protein  24.59 
 
 		 306 aa  50.1  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4536  phenol degradation protein  25.74 
 
 		 318 aa  49.3  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375555  normal  0.225823 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3839  regulation of phenolics degradation protein  31.25 
 
 		 298 aa  47  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2763  hypothetical protein  27.1 
 
 		 301 aa  47  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1272  meta-pathway phenol degradation-like protein  30.38 
 
 		 325 aa  47  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2955  meta-pathway phenol degradation-like protein  25.45 
 
 		 300 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0632  meta-pathway phenol degradation-like protein  36.14 
 
 		 316 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0608  hypothetical protein  24.35 
 
 		 330 aa  43.5  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2388  hypothetical protein  29.38 
 
 		 310 aa  43.1  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.806824 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>