62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2732 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2732  putative signal peptide  100 
 
 		 315 aa  644    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235663  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6009  protein involved in MetA-pathway of phenol degradation-like protein  48.89 
 
 		 319 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6305  protein involved in MetA-pathway of phenol degradation-like protein  48.89 
 
 		 319 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.477506  normal  0.244867 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6363  MetA-pathway-like protein  49.18 
 
 		 318 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7181  protein involved in meta-pathway of phenol degradation-like  49.35 
 
 		 318 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0516478 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6775  protein involved in MetA-pathway of phenol degradation-like protein  48.85 
 
 		 318 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.617497 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5489  protein involved in MetA-pathway of phenol degradation-like  48.85 
 
 		 318 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05192  putative signal peptide protein  45.36 
 
 		 319 aa  260  2e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00268581  normal  0.960066 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1272  meta-pathway phenol degradation-like protein  39.23 
 
 		 325 aa  195  8.000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32640  hypothetical protein  40.62 
 
 		 303 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00101125  hitchhiker  0.00152263 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2763  hypothetical protein  39.16 
 
 		 301 aa  189  4e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2838  hypothetical protein  37.17 
 
 		 306 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33380  hypothetical protein  36.42 
 
 		 306 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.72965  normal  0.084061 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0608  hypothetical protein  34.35 
 
 		 330 aa  172  5e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2982  hypothetical protein  31.43 
 
 		 299 aa  108  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000220614  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2955  meta-pathway phenol degradation-like protein  28.57 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3305  MetA-pathway phenol degradation-like protein  26.75 
 
 		 299 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.853243 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08780  hypothetical protein  29.89 
 
 		 268 aa  97.4  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299934  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3168  hypothetical protein  29.55 
 
 		 315 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2127  phenol degradation-like protein  25.54 
 
 		 307 aa  91.3  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2732  hypothetical protein  30.77 
 
 		 301 aa  89.4  7e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.206778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3482  meta-pathway phenol degradation-like protein  28.32 
 
 		 318 aa  89  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6101  putative lipoprotein  31.96 
 
 		 316 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3157  meta-pathway phenol degradation-like protein  25.56 
 
 		 295 aa  87.4  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1588  hypothetical protein  25.51 
 
 		 320 aa  86.7  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.232894  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4501  MetA-pathway phenol degradation-like protein  25.93 
 
 		 295 aa  85.9  8e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4488  protein involved in meta-pathway of phenol degradation  26.3 
 
 		 302 aa  85.9  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0883  hypothetical protein  31.03 
 
 		 309 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00462477  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1833  putative signal peptide protein  28.08 
 
 		 297 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.714906  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2845  phenol degradation-like protein  29.08 
 
 		 306 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70300  putative enzyme  29.9 
 
 		 316 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1838  phenol metabolism protein  32.68 
 
 		 310 aa  79  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.394031  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2107  putative signal peptide protein  29.7 
 
 		 309 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30840  hypothetical protein  28.41 
 
 		 294 aa  77  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.856206  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5460  hypothetical protein  28.47 
 
 		 296 aa  75.5  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32260  signal peptide protein  27.24 
 
 		 303 aa  74.7  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03076  putative signal peptide protein  28.66 
 
 		 311 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3195  hypothetical protein  29.73 
 
 		 313 aa  70.5  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4527  hypothetical protein  25.47 
 
 		 310 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0190  hypothetical protein  27.34 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6119  hypothetical protein  27.59 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6407  hypothetical protein  26.96 
 
 		 312 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.579544 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4890  hypothetical protein  25.87 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3274  hypothetical protein  25.87 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0193485 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4267  hypothetical protein  27.53 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6917  hypothetical protein  25.87 
 
 		 312 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2098  hypothetical protein  26.13 
 
 		 269 aa  59.3  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.591796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2203  hypothetical protein  30.97 
 
 		 349 aa  52.8  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6545  hypothetical protein  28.93 
 
 		 297 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0368  hypothetical protein  27.68 
 
 		 295 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0341  hypothetical protein  27.83 
 
 		 295 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.225999  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2975  hypothetical protein  30.38 
 
 		 331 aa  48.1  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1728  hypothetical protein  23.31 
 
 		 334 aa  48.1  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000180313 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6259  hypothetical protein  28.3 
 
 		 298 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.486413 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0355  hypothetical protein  25.89 
 
 		 295 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5600  hypothetical protein  27.61 
 
 		 383 aa  46.2  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00091534  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0598  hypothetical protein  30.77 
 
 		 364 aa  46.2  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.161242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0164  hypothetical protein  23.27 
 
 		 306 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.433262  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4285  hypothetical protein  27.97 
 
 		 298 aa  42.7  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46217  normal  0.974652 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4081  hypothetical protein  27.97 
 
 		 298 aa  42.7  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0295  hypothetical protein  23.72 
 
 		 256 aa  42.4  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000520717 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3232  hypothetical protein  28.48 
 
 		 297 aa  42.4  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.389417  normal  0.383811 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>