39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4285 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_4081  hypothetical protein  100 
 
 		 298 aa  608  1e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4285  hypothetical protein  100 
 
 		 298 aa  608  1e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46217  normal  0.974652 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3232  hypothetical protein  99.33 
 
 		 297 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.389417  normal  0.383811 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6259  hypothetical protein  90.6 
 
 		 298 aa  564  1e-160  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.486413 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6545  hypothetical protein  90.24 
 
 		 297 aa  560  1e-158  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2725  meta-pathway phenol degradation-like protein  59.78 
 
 		 288 aa  343  2e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0005  hypothetical protein  39.93 
 
 		 295 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.489422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1460  putative signal peptide  39.93 
 
 		 306 aa  185  6e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00422609  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3351  hypothetical protein  38.01 
 
 		 293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0824985  normal  0.65514 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4520  putative signal peptide  38.11 
 
 		 298 aa  178  9e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1158  putative signal peptide  38.1 
 
 		 298 aa  176  4e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2099  putative signal peptide  36.86 
 
 		 296 aa  155  7e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00558021  normal  0.7383 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3429  putative signal peptide  35.4 
 
 		 312 aa  151  1e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5137  hypothetical protein  39.05 
 
 		 282 aa  137  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.510015 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3246  putative signal peptide  31.27 
 
 		 296 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620994 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1344  putative signal peptide  31.6 
 
 		 294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1259  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  30.42 
 
 		 315 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0181867 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5058  putative signal peptide  30.56 
 
 		 323 aa  117  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0192886  normal  0.0905657 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2000  putative signal peptide  29.18 
 
 		 291 aa  109  7.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2846  hypothetical protein  30.43 
 
 		 288 aa  101  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3742  putative phenol degradation enzyme  26.37 
 
 		 287 aa  92.4  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3016  phenol degradation enzyme  26.37 
 
 		 287 aa  92  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0548  hypothetical protein  37.75 
 
 		 152 aa  87.4  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0826434  hitchhiker  0.00673364 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0551  hypothetical protein  39.81 
 
 		 151 aa  75.9  0.0000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0319027  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1344  hypothetical protein  26.91 
 
 		 298 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.43261  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15280  hypothetical protein  26.45 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0013273  hitchhiker  0.000000000000157451 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2001  hypothetical protein  25.17 
 
 		 296 aa  62  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.949569  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1088  hypothetical protein  23.72 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.454901 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1758  hypothetical protein  23.77 
 
 		 306 aa  59.3  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.404134  normal  0.0201554 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0885  hypothetical protein  26.27 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00140795  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0486  hypothetical protein  27.66 
 
 		 201 aa  53.9  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0628681  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0207  hypothetical protein  24.46 
 
 		 326 aa  49.3  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.311208 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6305  protein involved in MetA-pathway of phenol degradation-like protein  24.24 
 
 		 319 aa  46.6  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.477506  normal  0.244867 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7181  protein involved in meta-pathway of phenol degradation-like  23.12 
 
 		 318 aa  46.2  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0516478 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32260  signal peptide protein  29.37 
 
 		 303 aa  45.4  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6009  protein involved in MetA-pathway of phenol degradation-like protein  23.98 
 
 		 319 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08780  hypothetical protein  28.57 
 
 		 268 aa  45.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299934  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2982  hypothetical protein  25 
 
 		 299 aa  43.1  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000220614  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2732  putative signal peptide  27.97 
 
 		 315 aa  42.7  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235663  normal  0.493951 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>