51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0608 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0608  hypothetical protein  100 
 
 		 330 aa  667    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6305  protein involved in MetA-pathway of phenol degradation-like protein  41.61 
 
 		 319 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.477506  normal  0.244867 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6363  MetA-pathway-like protein  40 
 
 		 318 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6009  protein involved in MetA-pathway of phenol degradation-like protein  41.61 
 
 		 319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6775  protein involved in MetA-pathway of phenol degradation-like protein  39.93 
 
 		 318 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.617497 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5489  protein involved in MetA-pathway of phenol degradation-like  39.93 
 
 		 318 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7181  protein involved in meta-pathway of phenol degradation-like  39.26 
 
 		 318 aa  188  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0516478 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2732  putative signal peptide  34.35 
 
 		 315 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235663  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_003296  RS05192  putative signal peptide protein  35.62 
 
 		 319 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00268581  normal  0.960066 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1272  meta-pathway phenol degradation-like protein  35.84 
 
 		 325 aa  146  5e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2838  hypothetical protein  34.38 
 
 		 306 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33380  hypothetical protein  33.33 
 
 		 306 aa  132  6e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.72965  normal  0.084061 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2763  hypothetical protein  31.74 
 
 		 301 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32640  hypothetical protein  31.77 
 
 		 303 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00101125  hitchhiker  0.00152263 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2955  meta-pathway phenol degradation-like protein  28.35 
 
 		 300 aa  107  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1588  hypothetical protein  27.91 
 
 		 320 aa  105  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.232894  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3305  MetA-pathway phenol degradation-like protein  26.62 
 
 		 299 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.853243 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08780  hypothetical protein  23.68 
 
 		 268 aa  82.8  0.000000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299934  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6101  putative lipoprotein  24.27 
 
 		 316 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4488  protein involved in meta-pathway of phenol degradation  25.43 
 
 		 302 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3157  meta-pathway phenol degradation-like protein  25.19 
 
 		 295 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4501  MetA-pathway phenol degradation-like protein  26.1 
 
 		 295 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2107  putative signal peptide protein  25.45 
 
 		 309 aa  67  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3168  hypothetical protein  24.43 
 
 		 315 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5460  hypothetical protein  25.27 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70300  putative enzyme  23.33 
 
 		 316 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32260  signal peptide protein  23.47 
 
 		 303 aa  65.9  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0368  hypothetical protein  27.72 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1833  putative signal peptide protein  24.37 
 
 		 297 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.714906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3482  meta-pathway phenol degradation-like protein  24 
 
 		 318 aa  63.2  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0341  hypothetical protein  27.38 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.225999  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0355  hypothetical protein  26.36 
 
 		 295 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2127  phenol degradation-like protein  22.78 
 
 		 307 aa  62.4  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2845  phenol degradation-like protein  24.32 
 
 		 306 aa  62.4  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2982  hypothetical protein  23.51 
 
 		 299 aa  61.2  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000220614  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4267  hypothetical protein  26.85 
 
 		 297 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03076  putative signal peptide protein  25.99 
 
 		 311 aa  59.7  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2732  hypothetical protein  24.16 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.206778  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30840  hypothetical protein  22.3 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.856206  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0883  hypothetical protein  22.47 
 
 		 309 aa  55.1  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00462477  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0598  hypothetical protein  29.14 
 
 		 364 aa  50.8  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.161242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6119  hypothetical protein  24.85 
 
 		 312 aa  50.4  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4527  hypothetical protein  25.17 
 
 		 310 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6407  hypothetical protein  24.85 
 
 		 312 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.579544 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1931  hypothetical protein  22.67 
 
 		 327 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.903227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1838  phenol metabolism protein  24.88 
 
 		 310 aa  45.4  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.394031  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2975  hypothetical protein  25.83 
 
 		 331 aa  45.8  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2203  hypothetical protein  24.35 
 
 		 349 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3274  hypothetical protein  23.08 
 
 		 312 aa  43.1  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0193485 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4890  hypothetical protein  23.08 
 
 		 312 aa  43.1  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3195  hypothetical protein  22.07 
 
 		 313 aa  42.4  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>