85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2107 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2107  putative signal peptide protein  100 
 
 		 309 aa  634    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2982  hypothetical protein  41.83 
 
 		 299 aa  210  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000220614  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3305  MetA-pathway phenol degradation-like protein  43.79 
 
 		 299 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.853243 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1833  putative signal peptide protein  37.42 
 
 		 297 aa  191  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.714906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2732  hypothetical protein  43.5 
 
 		 301 aa  185  8e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.206778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3157  meta-pathway phenol degradation-like protein  37.33 
 
 		 295 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4501  MetA-pathway phenol degradation-like protein  39.53 
 
 		 295 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08780  hypothetical protein  39.19 
 
 		 268 aa  174  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299934  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32260  signal peptide protein  36.2 
 
 		 303 aa  167  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0883  hypothetical protein  36.16 
 
 		 309 aa  160  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00462477  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3482  meta-pathway phenol degradation-like protein  39.83 
 
 		 318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1588  hypothetical protein  36.17 
 
 		 320 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.232894  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0355  hypothetical protein  33.57 
 
 		 295 aa  139  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2955  meta-pathway phenol degradation-like protein  33.67 
 
 		 300 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0368  hypothetical protein  32.5 
 
 		 295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2127  phenol degradation-like protein  31.21 
 
 		 307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2845  phenol degradation-like protein  32.39 
 
 		 306 aa  133  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0341  hypothetical protein  32.58 
 
 		 295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.225999  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3195  hypothetical protein  31.66 
 
 		 313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4527  hypothetical protein  32.85 
 
 		 310 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1272  meta-pathway phenol degradation-like protein  34.12 
 
 		 325 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2838  hypothetical protein  34.06 
 
 		 306 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33380  hypothetical protein  34.06 
 
 		 306 aa  122  7e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.72965  normal  0.084061 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1838  phenol metabolism protein  35.27 
 
 		 310 aa  122  9e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.394031  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03076  putative signal peptide protein  29.91 
 
 		 311 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30840  hypothetical protein  30.53 
 
 		 294 aa  116  3.9999999999999997e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.856206  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1728  hypothetical protein  29.75 
 
 		 334 aa  116  6e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000180313 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32640  hypothetical protein  29.6 
 
 		 303 aa  109  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00101125  hitchhiker  0.00152263 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4267  hypothetical protein  31.1 
 
 		 297 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70300  putative enzyme  34.55 
 
 		 316 aa  107  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2763  hypothetical protein  29.24 
 
 		 301 aa  107  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6407  hypothetical protein  31.21 
 
 		 312 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.579544 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5460  hypothetical protein  30.45 
 
 		 296 aa  104  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1931  hypothetical protein  30.25 
 
 		 327 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.903227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3274  hypothetical protein  29.74 
 
 		 312 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0193485 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3168  hypothetical protein  34.62 
 
 		 315 aa  101  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4890  hypothetical protein  29.74 
 
 		 312 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6119  hypothetical protein  31.47 
 
 		 312 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6101  putative lipoprotein  35 
 
 		 316 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0190  hypothetical protein  26.88 
 
 		 307 aa  100  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3839  regulation of phenolics degradation protein  28.85 
 
 		 298 aa  99.8  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6917  hypothetical protein  29.41 
 
 		 312 aa  99.4  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2098  hypothetical protein  28.32 
 
 		 269 aa  96.7  5e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.591796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0531  hypothetical protein  28.8 
 
 		 345 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1377  MetA-pathway phenol degradation-like protein  29.79 
 
 		 324 aa  92.8  7e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.351343  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6305  protein involved in MetA-pathway of phenol degradation-like protein  31.74 
 
 		 319 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.477506  normal  0.244867 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6009  protein involved in MetA-pathway of phenol degradation-like protein  31.74 
 
 		 319 aa  90.5  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0164  hypothetical protein  25.09 
 
 		 306 aa  89.4  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.433262  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4832  hypothetical protein  28.03 
 
 		 304 aa  89.4  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.922561 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6752  hypothetical protein  28.88 
 
 		 337 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00609082 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4488  protein involved in meta-pathway of phenol degradation  28.71 
 
 		 302 aa  88.6  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05192  putative signal peptide protein  31.82 
 
 		 319 aa  88.6  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00268581  normal  0.960066 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3122  hypothetical protein  28.46 
 
 		 326 aa  87.8  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5489  protein involved in MetA-pathway of phenol degradation-like  28.53 
 
 		 318 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5144  hypothetical protein  26.88 
 
 		 331 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6775  protein involved in MetA-pathway of phenol degradation-like protein  28.53 
 
 		 318 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.617497 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7181  protein involved in meta-pathway of phenol degradation-like  30.03 
 
 		 318 aa  85.9  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0516478 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6363  MetA-pathway-like protein  29.59 
 
 		 318 aa  85.9  8e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0632  meta-pathway phenol degradation-like protein  29.84 
 
 		 316 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2404  hypothetical protein  27.17 
 
 		 329 aa  79.7  0.00000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.147622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8068  hypothetical protein  27.7 
 
 		 341 aa  79.3  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2732  putative signal peptide  29.7 
 
 		 315 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235663  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1676  hypothetical protein  34.75 
 
 		 328 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.275603  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3413  hypothetical protein  27.64 
 
 		 328 aa  76.3  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.591496  normal  0.708141 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4536  phenol degradation protein  27.71 
 
 		 318 aa  72.4  0.000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375555  normal  0.225823 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0295  hypothetical protein  25.87 
 
 		 256 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000520717 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1191  hypothetical protein  26.01 
 
 		 350 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.161242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0092  hypothetical protein  27.03 
 
 		 334 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.672977  normal  0.778879 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0608  hypothetical protein  25.45 
 
 		 330 aa  67  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5224  hypothetical protein  33.33 
 
 		 322 aa  66.6  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.347235 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6970  hypothetical protein  33.09 
 
 		 340 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000157214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3846  hypothetical protein  28.25 
 
 		 334 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1047  MetA-pathway of phenol degradation-like protein  24.65 
 
 		 307 aa  62.8  0.000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.379936 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2203  hypothetical protein  29.9 
 
 		 349 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2388  hypothetical protein  26.09 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.806824 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1148  meta-pathway phenol degradation-like protein  24.63 
 
 		 324 aa  61.6  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2975  hypothetical protein  27.8 
 
 		 331 aa  61.2  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1768  meta-pathway phenol degradation-like protein  22.83 
 
 		 316 aa  60.5  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2795  hypothetical protein  25.71 
 
 		 327 aa  58.9  0.00000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0598  hypothetical protein  33.99 
 
 		 364 aa  57  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.161242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2099  Protein involved in meta-pathway of phenol degradation  26.51 
 
 		 319 aa  53.9  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119201  normal  0.245606 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1376  meta-pathway phenol degradation protein  26.03 
 
 		 309 aa  53.1  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7148  protein involved in meta-pathway of phenol degradation  25 
 
 		 304 aa  48.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00536985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5600  hypothetical protein  25.17 
 
 		 383 aa  45.8  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00091534  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1956  hypothetical protein  25.43 
 
 		 322 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.235366  hitchhiker  0.00028826 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>