88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2982 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2982  hypothetical protein  100 
 
 		 299 aa  616  1e-175  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000220614  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2732  hypothetical protein  46.49 
 
 		 301 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.206778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0883  hypothetical protein  43.97 
 
 		 309 aa  263  3e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00462477  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3305  MetA-pathway phenol degradation-like protein  43.67 
 
 		 299 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.853243 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3482  meta-pathway phenol degradation-like protein  40.48 
 
 		 318 aa  211  1e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2107  putative signal peptide protein  41.83 
 
 		 309 aa  210  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3157  meta-pathway phenol degradation-like protein  40.82 
 
 		 295 aa  209  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4501  MetA-pathway phenol degradation-like protein  41.84 
 
 		 295 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08780  hypothetical protein  42.8 
 
 		 268 aa  205  8e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299934  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1838  phenol metabolism protein  36.24 
 
 		 310 aa  193  4e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.394031  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30840  hypothetical protein  36.36 
 
 		 294 aa  177  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.856206  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2955  meta-pathway phenol degradation-like protein  35.17 
 
 		 300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148613  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1833  putative signal peptide protein  34.46 
 
 		 297 aa  172  6.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.714906  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32260  signal peptide protein  37.09 
 
 		 303 aa  171  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2127  phenol degradation-like protein  33.87 
 
 		 307 aa  159  6e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1588  hypothetical protein  33.45 
 
 		 320 aa  158  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.232894  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2845  phenol degradation-like protein  33.45 
 
 		 306 aa  156  4e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4527  hypothetical protein  34.26 
 
 		 310 aa  153  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0190  hypothetical protein  32.08 
 
 		 307 aa  153  4e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4488  protein involved in meta-pathway of phenol degradation  32.19 
 
 		 302 aa  148  9e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0355  hypothetical protein  32.87 
 
 		 295 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6101  putative lipoprotein  33.11 
 
 		 316 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0368  hypothetical protein  31.94 
 
 		 295 aa  145  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3168  hypothetical protein  32.04 
 
 		 315 aa  144  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70300  putative enzyme  31.58 
 
 		 316 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3195  hypothetical protein  31.37 
 
 		 313 aa  143  4e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5460  hypothetical protein  31.65 
 
 		 296 aa  142  7e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0341  hypothetical protein  31.88 
 
 		 295 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.225999  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6407  hypothetical protein  31.61 
 
 		 312 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.579544 
 
 
-
 
NC_003296  RS03076  putative signal peptide protein  31.62 
 
 		 311 aa  139  6e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4890  hypothetical protein  30.56 
 
 		 312 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3274  hypothetical protein  30.56 
 
 		 312 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0193485 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6119  hypothetical protein  31.48 
 
 		 312 aa  136  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1272  meta-pathway phenol degradation-like protein  32.73 
 
 		 325 aa  135  9e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6917  hypothetical protein  30.56 
 
 		 312 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4267  hypothetical protein  31.6 
 
 		 297 aa  132  5e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1728  hypothetical protein  31.17 
 
 		 334 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000180313 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0164  hypothetical protein  27.61 
 
 		 306 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.433262  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2098  hypothetical protein  31.92 
 
 		 269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.591796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32640  hypothetical protein  29.96 
 
 		 303 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00101125  hitchhiker  0.00152263 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6752  hypothetical protein  30 
 
 		 337 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00609082 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4832  hypothetical protein  27.53 
 
 		 304 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.922561 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1377  MetA-pathway phenol degradation-like protein  28.33 
 
 		 324 aa  109  5e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.351343  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2763  hypothetical protein  28.52 
 
 		 301 aa  109  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2838  hypothetical protein  28.06 
 
 		 306 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2732  putative signal peptide  31.43 
 
 		 315 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235663  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3839  regulation of phenolics degradation protein  26.64 
 
 		 298 aa  108  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3122  hypothetical protein  31.67 
 
 		 326 aa  107  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0531  hypothetical protein  29.81 
 
 		 345 aa  106  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6009  protein involved in MetA-pathway of phenol degradation-like protein  28.39 
 
 		 319 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33380  hypothetical protein  27.8 
 
 		 306 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.72965  normal  0.084061 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6305  protein involved in MetA-pathway of phenol degradation-like protein  27.85 
 
 		 319 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.477506  normal  0.244867 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0632  meta-pathway phenol degradation-like protein  32.68 
 
 		 316 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5144  hypothetical protein  28.08 
 
 		 331 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1931  hypothetical protein  27.33 
 
 		 327 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.903227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8068  hypothetical protein  31.49 
 
 		 341 aa  103  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1047  MetA-pathway of phenol degradation-like protein  29.2 
 
 		 307 aa  100  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.379936 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3413  hypothetical protein  28.11 
 
 		 328 aa  92  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.591496  normal  0.708141 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1191  hypothetical protein  29.37 
 
 		 350 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.161242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7181  protein involved in meta-pathway of phenol degradation-like  25.39 
 
 		 318 aa  91.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0516478 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5489  protein involved in MetA-pathway of phenol degradation-like  25.24 
 
 		 318 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6775  protein involved in MetA-pathway of phenol degradation-like protein  25.24 
 
 		 318 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.617497 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6363  MetA-pathway-like protein  25.09 
 
 		 318 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0295  hypothetical protein  29.65 
 
 		 256 aa  89.4  7e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000520717 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2404  hypothetical protein  28.43 
 
 		 329 aa  87.8  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.147622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2388  hypothetical protein  24.25 
 
 		 310 aa  85.5  9e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.806824 
 
 
-
 
NC_003296  RS05192  putative signal peptide protein  25.71 
 
 		 319 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00268581  normal  0.960066 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4536  phenol degradation protein  29.7 
 
 		 318 aa  81.6  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375555  normal  0.225823 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5224  hypothetical protein  30.9 
 
 		 322 aa  80.5  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.347235 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0092  hypothetical protein  27.01 
 
 		 334 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.672977  normal  0.778879 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2795  hypothetical protein  26.32 
 
 		 327 aa  78.6  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7148  protein involved in meta-pathway of phenol degradation  26.58 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00536985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3846  hypothetical protein  27.14 
 
 		 334 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1956  hypothetical protein  24.44 
 
 		 322 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.235366  hitchhiker  0.00028826 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1676  hypothetical protein  31.61 
 
 		 328 aa  76.3  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.275603  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2099  Protein involved in meta-pathway of phenol degradation  28.32 
 
 		 319 aa  71.6  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119201  normal  0.245606 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1376  meta-pathway phenol degradation protein  26.55 
 
 		 309 aa  72  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2975  hypothetical protein  33.52 
 
 		 331 aa  71.6  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0598  hypothetical protein  34 
 
 		 364 aa  69.7  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.161242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2203  hypothetical protein  29.17 
 
 		 349 aa  68.9  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5600  hypothetical protein  22.78 
 
 		 383 aa  65.9  0.0000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00091534  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6970  hypothetical protein  28.9 
 
 		 340 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000157214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0608  hypothetical protein  23.51 
 
 		 330 aa  61.2  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1148  meta-pathway phenol degradation-like protein  22.46 
 
 		 324 aa  60.8  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1768  meta-pathway phenol degradation-like protein  22.27 
 
 		 316 aa  50.1  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3232  hypothetical protein  25 
 
 		 297 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.389417  normal  0.383811 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4081  hypothetical protein  25 
 
 		 298 aa  43.1  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4285  hypothetical protein  25 
 
 		 298 aa  43.1  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46217  normal  0.974652 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>