65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2098 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2098  hypothetical protein  100 
 
 		 269 aa  554  1e-157  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.591796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1728  hypothetical protein  75 
 
 		 334 aa  449  1e-125  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000180313 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0295  hypothetical protein  75 
 
 		 256 aa  423  1e-117  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000520717 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2982  hypothetical protein  31.92 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000220614  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3839  regulation of phenolics degradation protein  32.36 
 
 		 298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2732  hypothetical protein  31.44 
 
 		 301 aa  115  5e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.206778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1148  meta-pathway phenol degradation-like protein  26.36 
 
 		 324 aa  110  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2107  putative signal peptide protein  28.32 
 
 		 309 aa  96.7  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3305  MetA-pathway phenol degradation-like protein  25.19 
 
 		 299 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.853243 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08780  hypothetical protein  27.88 
 
 		 268 aa  91.3  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299934  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32640  hypothetical protein  26.64 
 
 		 303 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00101125  hitchhiker  0.00152263 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0883  hypothetical protein  25 
 
 		 309 aa  88.2  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00462477  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2763  hypothetical protein  26.28 
 
 		 301 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32260  signal peptide protein  27.1 
 
 		 303 aa  85.1  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5460  hypothetical protein  26.59 
 
 		 296 aa  84.3  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4527  hypothetical protein  28.63 
 
 		 310 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3195  hypothetical protein  27.34 
 
 		 313 aa  82  0.000000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03076  putative signal peptide protein  27.04 
 
 		 311 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0190  hypothetical protein  27.72 
 
 		 307 aa  80.1  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3482  meta-pathway phenol degradation-like protein  34.25 
 
 		 318 aa  79.7  0.00000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4501  MetA-pathway phenol degradation-like protein  28.94 
 
 		 295 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3157  meta-pathway phenol degradation-like protein  27.61 
 
 		 295 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4267  hypothetical protein  30.1 
 
 		 297 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1838  phenol metabolism protein  27.8 
 
 		 310 aa  76.3  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.394031  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2955  meta-pathway phenol degradation-like protein  24.24 
 
 		 300 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2099  Protein involved in meta-pathway of phenol degradation  25.5 
 
 		 319 aa  72.8  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119201  normal  0.245606 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0368  hypothetical protein  26.64 
 
 		 295 aa  72.4  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0341  hypothetical protein  27.51 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.225999  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1768  meta-pathway phenol degradation-like protein  26.1 
 
 		 316 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2838  hypothetical protein  25.64 
 
 		 306 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1833  putative signal peptide protein  24.64 
 
 		 297 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.714906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0355  hypothetical protein  26.2 
 
 		 295 aa  70.5  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3274  hypothetical protein  25.99 
 
 		 312 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0193485 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4890  hypothetical protein  25.99 
 
 		 312 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33380  hypothetical protein  26.01 
 
 		 306 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.72965  normal  0.084061 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6917  hypothetical protein  25.74 
 
 		 312 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30840  hypothetical protein  23.79 
 
 		 294 aa  67.8  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.856206  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1376  meta-pathway phenol degradation protein  21.64 
 
 		 309 aa  66.6  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6009  protein involved in MetA-pathway of phenol degradation-like protein  25 
 
 		 319 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6305  protein involved in MetA-pathway of phenol degradation-like protein  25 
 
 		 319 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.477506  normal  0.244867 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6407  hypothetical protein  24.91 
 
 		 312 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.579544 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7181  protein involved in meta-pathway of phenol degradation-like  24.83 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0516478 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1272  meta-pathway phenol degradation-like protein  25 
 
 		 325 aa  63.9  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6775  protein involved in MetA-pathway of phenol degradation-like protein  23.59 
 
 		 318 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.617497 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5489  protein involved in MetA-pathway of phenol degradation-like  23.59 
 
 		 318 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6363  MetA-pathway-like protein  23.59 
 
 		 318 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6119  hypothetical protein  24.73 
 
 		 312 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1588  hypothetical protein  23.81 
 
 		 320 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.232894  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3413  hypothetical protein  25.62 
 
 		 328 aa  60.1  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.591496  normal  0.708141 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6101  putative lipoprotein  23.6 
 
 		 316 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0164  hypothetical protein  24.02 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.433262  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4488  protein involved in meta-pathway of phenol degradation  24.71 
 
 		 302 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2732  putative signal peptide  26.13 
 
 		 315 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235663  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5144  hypothetical protein  25.36 
 
 		 331 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70300  putative enzyme  23.25 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3168  hypothetical protein  22.69 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2845  phenol degradation-like protein  23.3 
 
 		 306 aa  53.1  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0531  hypothetical protein  22.46 
 
 		 345 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8068  hypothetical protein  23.81 
 
 		 341 aa  48.9  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6752  hypothetical protein  22.3 
 
 		 337 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00609082 
 
 
-
 
NC_003296  RS05192  putative signal peptide protein  26.74 
 
 		 319 aa  48.5  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00268581  normal  0.960066 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1931  hypothetical protein  21.22 
 
 		 327 aa  44.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.903227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4832  hypothetical protein  23.4 
 
 		 304 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.922561 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2127  phenol degradation-like protein  25.37 
 
 		 307 aa  43.1  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1191  hypothetical protein  23.98 
 
 		 350 aa  42  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.161242  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>